DeepMind ΠΎΡ‚ΠΊΡ€Ρ‹Π» ΠΊΠΎΠ΄ AlphaFold 3, AI-систСмы модСлирования структуры Π±Π΅Π»ΠΊΠΎΠ²

Компания Google DeepMind ΠΎΠΏΡƒΠ±Π»ΠΈΠΊΠΎΠ²Π°Π»Π° исходныС тСксты систСмы машинного обучСния AlphaFold 3, ΠΏΡ€Π΅Π΄Π½Π°Π·Π½Π°Ρ‡Π΅Π½Π½ΠΎΠΉ для прСдсказания Ρ‚Ρ€Ρ‘Ρ…ΠΌΠ΅Ρ€Π½ΠΎΠΉ структуры Π±Π΅Π»ΠΊΠΎΠ² ΠΈ модСлирования взаимодСйствия Π±Π΅Π»ΠΊΠΎΠ² с Π΄Ρ€ΡƒΠ³ΠΈΠΌΠΈ Ρ‚ΠΈΠΏΠ°ΠΌΠΈ ΠΌΠΎΠ»Π΅ΠΊΡƒΠ». Π—Π° созданиС Π°Π»Π³ΠΎΡ€ΠΈΡ‚ΠΌΠΎΠ² машинного обучСния, Ρ€Π΅Π°Π»ΠΈΠ·ΠΎΠ²Π°Π½Π½Ρ‹Ρ… Π²ΠΎ Π²Ρ‚ΠΎΡ€ΠΎΠΉ вСрсии AlphaFold, Π² этом Π³ΠΎΠ΄Ρƒ присуТдСна НобСлСвская прСмия ΠΏΠΎ Ρ…ΠΈΠΌΠΈΠΈ. Бвязанный с AlphaFold 3 инструмСнтарий написан Π½Π° Python ΠΈ C++, ΠΈ распространяСтся ΠΏΠΎΠ΄ Π»ΠΈΡ†Π΅Π½Π·ΠΈΠ΅ΠΉ CC BY-NC-SA 4.0. НатрСнированныС ΠΌΠΎΠ΄Π΅Π»ΠΈ ΠΏΡ€Π΅Π΄ΠΎΡΡ‚Π°Π²Π»ΡΡŽΡ‚ΡΡ Π½Π° основС ΠΏΠΎΠ»ΡŒΠ·ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΡΠΊΠΎΠ³ΠΎ соглашСния. ΠžΡ‚Π΄Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎ Π·Π°ΠΏΡƒΡ‰Π΅Π½ сСрвСр, ΠΏΠΎΠ·Π²ΠΎΠ»ΡΡŽΡ‰ΠΈΠΉ ΡΠΊΡΠΏΠ΅Ρ€ΠΈΠΌΠ΅Π½Ρ‚ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ с AlphaFold 3 Π² online-Ρ€Π΅ΠΆΠΈΠΌΠ΅.

МодСль, которая ΠΎΠ±ΡƒΡ‡Π΅Π½Π° Π½Π° ΠΊΠΎΠ»Π»Π΅ΠΊΡ†ΠΈΠΈ с описаниСм структур всСх извСстных Π±Π΅Π»ΠΊΠΎΠ² ΠΈ аминокислотных ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚Π΅ΠΉ, Ρ€Π΅ΡˆΠ°Π΅Ρ‚ ΠΏΡ€ΠΎΠ±Π»Π΅ΠΌΡƒ Ρ„ΠΎΠ»Π΄ΠΈΠ½Π³Π° Π±Π΅Π»ΠΊΠ° ΠΈ позволяСт ΠΏΡ€ΠΎΠ³Π½ΠΎΠ·ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ Ρ‚Ρ€Ρ‘Ρ…ΠΌΠ΅Ρ€Π½ΡƒΡŽ структуру Π½ΠΎΠ²Ρ‹Ρ… Π±Π΅Π»ΠΊΠΎΠ² с Ρ‚ΠΎΡ‡Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒΡŽ, ΠΊΠ°ΠΊ ΠΌΠΈΠ½ΠΈΠΌΡƒΠΌ Π½Π΅ ΡƒΡΡ‚ΡƒΠΏΠ°ΡŽΡ‰Π΅ΠΉ Π»Π°Π±ΠΎΡ€Π°Ρ‚ΠΎΡ€Π½ΠΎΠΌΡƒ Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·Ρƒ, Π° ΠΏΡ€ΠΈ ΠΎΡ†Π΅Π½ΠΊΠ΅ взаимодСйствия Π±Π΅Π»ΠΊΠΎΠ² с Π΄Ρ€ΡƒΠ³ΠΈΠΌΠΈ Ρ‚ΠΈΠΏΠ°ΠΌΠΈ ΠΌΠΎΠ»Π΅ΠΊΡƒΠ» Π·Π½Π°Ρ‡ΠΈΡ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎ прСвосходящСй ΡΡƒΡ‰Π΅ΡΡ‚Π²ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΠ΅ ΠΌΠ΅Ρ‚ΠΎΠ΄Ρ‹ прогнозирования. Π’Ρ€Π΅Ρ‚ΡŒΡ вСрсия ΠΌΠΎΠ΄Π΅Π»ΠΈ AlphaFold отличаСтся задСйствованиСм Π½ΠΎΠ²ΠΎΠΉ Π°Ρ€Ρ…ΠΈΡ‚Π΅ΠΊΡ‚ΡƒΡ€Ρ‹ «Pairformer», Ρ€Π°Π·Π²ΠΈΠ²Π°ΡŽΡ‰Π΅ΠΉ идСю Π°Ρ€Ρ…ΠΈΡ‚Π΅ΠΊΡ‚ΡƒΡ€Ρ‹ «Ρ‚рансформСр».

Π’ ΠΎΡ‚Π»ΠΈΡ‡ΠΈΠ΅ ΠΎΡ‚ AlphaFold 2 новая вСрсия Π½Π΅ ограничиваСтся Π±Π΅Π»ΠΊΠ°ΠΌΠΈ, состоящими ΠΈΠ· ΠΎΠ΄Π½ΠΎΠΉ ΠΏΠΎΠ»ΠΈΠΏΠ΅ΠΏΡ‚ΠΈΠ΄Π½ΠΎΠΉ Ρ†Π΅ΠΏΠΈ, ΠΈ ΠΌΠΎΠΆΠ΅Ρ‚ ΠΏΡ€ΠΈΠΌΠ΅Π½ΡΡ‚ΡŒΡΡ для прСдсказания Π±Π΅Π»ΠΊΠΎΠ²Ρ‹Ρ… комплСксов с Π”ΠΠš ΠΈ РНК, Π° Ρ‚Π°ΠΊΠΆΠ΅ модСлирования ΠΌΠΎΠ΄ΠΈΡ„ΠΈΡ†ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½Π½Ρ‹Ρ… Π²Π°Ρ€ΠΈΠ°Π½Ρ‚ΠΎΠ² этих ΠΌΠΎΠ»Π΅ΠΊΡƒΠ». На Π²Ρ…ΠΎΠ΄ AlphaFold пСрСдаётся список ΠΌΠΎΠ»Π΅ΠΊΡƒΠ», Π° Π½Π° Π²Ρ‹Ρ…ΠΎΠ΄Π΅ формируСтся совмСстная 3D-структура, ΠΎΠΏΡ€Π΅Π΄Π΅Π»ΡΡŽΡ‰Π°Ρ Π½Π°ΠΈΠ±ΠΎΠ»Π΅Π΅ вСроятноС взаимодСйствиС ΡƒΠΊΠ°Π·Π°Π½Π½Ρ‹Ρ… ΠΌΠΎΠ»Π΅ΠΊΡƒΠ».

Π‘ практичСской стороны AlphaFold 3 ΠΌΠΎΠΆΠ΅Ρ‚ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡŒΠ·ΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒΡΡ для Ρ€Π°Π·Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚ΠΊΠΈ лСкарств ΠΈ ΠΌΠ΅Ρ‚ΠΎΠ΄ΠΎΠ² лСчСния, Π° Ρ‚Π°ΠΊΠΆΠ΅ создания Π½ΠΎΠ²Ρ‹Ρ… Π±Π΅Π»ΠΊΠΎΠ². НапримСр, ΠΏΡ€ΠΈ ΠΏΠΎΠΌΠΎΡ‰ΠΈ AlphaFold спроСктирован Π±Π΅Π»ΠΎΠΊ, способный ΠΏΡ€ΠΈΠΊΡ€Π΅ΠΏΠ»ΡΡ‚ΡŒΡΡ ΠΊ ΠΎΠΏΡ€Π΅Π΄Π΅Π»Ρ‘Π½Π½Ρ‹ΠΌ Ρ€Π°ΠΊΠΎΠ²Ρ‹ΠΌ ΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΊΠ°ΠΌ, Ρ‡Ρ‚ΠΎ ΠΌΠΎΠΆΠ΅Ρ‚ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡŒΠ·ΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒΡΡ Π² ΠΏΡ€ΠΎΡ‚ΠΈΠ²ΠΎΡ€Π°ΠΊΠΎΠ²ΠΎΠΉ Ρ‚Π΅Ρ€Π°ΠΏΠΈΠΈ Π½ΠΎΠ²ΠΎΠ³ΠΎ поколСния. AlphaFold Ρ‚Π°ΠΊΠΆΠ΅ Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡŒΠ·ΡƒΠ΅Ρ‚ΡΡ ΠΏΡ€ΠΈ ΠΈΠ·ΡƒΡ‡Π΅Π½ΠΈΠΈ взаимодСйствия Π°Π½Ρ‚ΠΈΡ‚Π΅Π» с Π±Π΅Π»ΠΊΠ°ΠΌΠΈ для понимания ΠΈΠΌΠΌΡƒΠ½Π½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΎΡ‚Π²Π΅Ρ‚Π° Ρ‡Π΅Π»ΠΎΠ²Π΅ΠΊΠ° ΠΈ создания Π½ΠΎΠ²Ρ‹Ρ… Π°Π½Ρ‚ΠΈΡ‚Π΅Π».

Π˜ΡΡ‚ΠΎΡ‡Π½ΠΈΠΊ: opennet.ru