Gellir defnyddio Shepherd fel y brif system gychwyn (init gyda PID 1), ac ar ffurf ar wahΓ’n i reoli prosesau cefndir defnyddwyr unigol (er enghraifft, i redeg tor, privoxy, mcron, ac ati) gyda gweithredu gyda hawliau y defnyddwyr hyn. Mae Shepherd yn gwneud y gwaith o gychwyn a stopio gwasanaethau trwy gymryd i ystyriaeth y berthynas rhwng gwasanaethau, gan nodi a chychwyn yn ddeinamig y gwasanaethau y mae'r gwasanaeth a ddewiswyd yn dibynnu arnynt. Mae Shepherd hefyd yn cefnogi canfod gwrthdaro rhwng gwasanaethau a'u hatal rhag rhedeg ar yr un pryd.