برنامه های کاربردی در Qubes بسته به اهمیت داده های در حال پردازش و وظایف حل شده، هر کلاس از برنامه ها و همچنین خدمات سیستم (زیر سیستم شبکه، کار با ذخیره سازی و غیره) به کلاس هایی تقسیم می شوند. هنگامی که کاربر برنامه ای را از منو راه اندازی می کند، این برنامه در یک ماشین مجازی خاص شروع می شود که یک سرور X جداگانه، یک مدیر پنجره ساده شده، و یک درایور ویدیوی خرد را اجرا می کند که خروجی را به محیط کنترل در حالت ترکیبی ترجمه می کند. در همان زمان، برنامه ها به طور یکپارچه در یک دسکتاپ در دسترس هستند و برای وضوح با رنگ های مختلف قاب پنجره برجسته می شوند. هر محیط دارای دسترسی خواندنی به سیستم فایل ریشه زیرین و ذخیره سازی محلی است که با ذخیره سازی محیط های دیگر همپوشانی ندارد. پوسته کاربر در بالای Xfce ساخته شده است.
منبع: opennet.ru