Toolbox pour les chercheurs — troisième numéro : recherche de sources et travail avec elles

Travailler sur un projet de recherche implique la recherche et l'exploration de nombreuses sources d'information. L'organisation de ce processus est une tâche complexe. Aujourd'hui, nous allons parler des outils destinés à optimiser ses différentes composantes.

Toolbox pour les chercheurs — troisième numéro : recherche de sources et travail avec elles
Photo João Silas — Unsplash

Les fournisseurs de logiciels académiques fonctionnent souvent sur la base de la coopération avec les établissements d'enseignement. Si votre organisation n'a pas acquis le produit qui vous intéresse, l'organiser peut être difficile. Bien que des plans individuels existent, tout le monde n'est pas prêt à les payer de sa propre poche. D'un autre côté, les produits ouverts ou gratuits, créés par des universitaires, souffrent souvent d'un design peu convivial et d'un manque de support.

Vous pouvez essayer de nombreux outils différents avant de vous arrêter sur une option fonctionnelle. Nous avons décidé de parler des plus notables sur Hacker News et dans les sélections sur GitHub.

Recherche de sources

DOAJ — un catalogue curé de revues scientifiques ouvertes. Sa base contient plus de 4 millions d'articles provenant de 13 000 revues représentant 130 pays. Dans un avenir proche, la plateforme prévoyait va considérablement augmenter le nombre de revues en sciences humaines, spécialisées et non anglophones. Ce qui est intéressant, c'est que DOAJ fournit une API ouverte pour automatiser la recherche selon divers paramètres.

Peerus — aide à suivre les nouvelles publications thématiques. Chaque jour, l'archive s'enrichit en moyenne de 7 000 nouveaux matériaux. Peerus propose offre une intégration avec les proxys universitaires pour télécharger des matériaux en un clic.

Crossref — une archive ouverte pour la publication et la recherche d'articles scientifiques. L'objectif du projet est de rassembler des chercheurs du monde entier sur une même plateforme pour qu'ils puissent résoudre ensemble des problématiques de recherche. Le site a déjà rassemblé cent millions d'enregistrements. Vous pouvez trouver le contenu nécessaire par métadonnées et mots-clés.

SciRate — une application web pour rechercher des recherches sur arXiv.org. Des filtres sont disponibles par domaines scientifiques et date de publication. Un système de notation utilisateur a également été mis en place, attribuant un score à chaque article.

ArXiv Sanity Preserver — accélère la recherche sur arXiv.org grâce à des algorithmes d'apprentissage automatique. Sur la page d'accueil, les documents les plus récents sont affichés avec un résumé. Les publications peuvent être recherchées par mots-clés dans la barre de recherche, ainsi que par des critères similaires via le lien montrer similaire, situé dans le coin supérieur droit près de chaque document.

OSF — plateforme ouverte pour rechercher et créer des projets scientifiques. Ici, il est possible de structurer les travaux de recherche — établir un contrôle des versions et ajouter des tags pour que les publications soient trouvées par d'autres. La plateforme permet de travailler dans le cloud, ce qui facilite l'accès à ses projets. Les contributions peuvent être effectuées de manière autonome et partagées avec les membres de la communauté.

Organisation et citation

doi2bib — moteur de recherche pour travailler avec des listes de sources. Dans la barre de recherche, on saisit l'identifiant numérique de l'objet (DOI), et le système affiche les métadonnées du matériel trouvé pour organiser la bibliographie au format BibTeX.

JabRef — application qui optimise le travail avec des listes bibliographiques au format BibTeX. La liste générée peut être exportée en HTML, Docbook, BibTeXML, MODS, RTF, Refer/Endnote, OpenOffice et LibreOffice. L'utilitaire peut être exécuté sur Java VM (version 8), sous Win, Linux et OS X.

Mendeley — gestionnaire de listes bibliographiques et plateforme cloud, qui permet d'accéder aux fichiers de projet depuis n'importe quel appareil. Mendeley propose également des fonctionnalités de recommandation et des outils de communication.

Docear — outil open source pour organiser les sources et construire une œuvre scientifique sur leur base. L'utilisateur doit indiquer un dossier qui servira de « bibliothèque » de documents pour un projet donné. Le programme va automatiquement le scanner et ajouter les fichiers trouvés à sa base de données. La base de données peut être structurée sous forme d'un « arbre », rassemblant dans une même branche les travaux d'une même orientation. Les commentaires et surlignages dans les fichiers PDF sont automatiquement importés et affichés dans l'interface. Une fois le travail sur les sources terminé, Docear aide à créer une « carte mentale » finale et fournira les citations nécessaires.

Duecredit — il est possible de citer non seulement du texte, mais aussi du code. Si votre programme emprunte des algorithmes ou des méthodes à des travaux scientifiques, cette bibliothèque vous aidera à les référencer correctement. Actuellement, la bibliothèque est disponible en Python.

Travail avec des documents

Sphinx — un outil pour la « compilation » de documents en reStructuredText en HTML, ePub, Texinfo, pages man et texte brut. Supporte 50 extensions, l'indexation automatique des composants logiciels, la création de liens pour les fonctions, classes, citations, termes, etc. Pour les débutants, les développeurs ont préparé tutoriel et un guide de démarrage rapide. En outre, nous vous proposons d'explorer les sujets suivants pour travailler avec Sphinx : rtd — supporte à la fois Sphinx et Read the Docs; Bootstrap — un thème où les modèles CSS et les extensions JavaScript du framework Bootstrap sont intégrés à la fonctionnalité de Sphinx : navigation, menu hiérarchique, etc.

Toolbox pour les chercheurs — troisième numéro : recherche de sources et travail avec elles
Photo freddie marriage — Unsplash

Git-scribe — un outil open source conçu pour la création de livres électroniques. Fournit des fonctionnalités pour la structuration du texte, l'édition, la révision, la correction, le travail collaboratif, ainsi que la publication et l'exportation en PDF, mobi et epub.

Jupyter Notebook — un éditeur de texte avec un environnement intégré pour la programmation interactive en Python. Autrefois connu sous le nom d'iPython Notebook. Peut être installé localement ou sur un VPS, existent versions cloud du produit.

Texture — l'interface de cet éditeur donne accès à un large éventail de fonctions spécialisées — telles que la création de graphiques, de formules et différentes manières de citer. Le programme utilise un format de fichier spécial qui peut être « décompressé » et analysé en éléments constitutifs si on le souhaite. Selon les créateurs de Texture, cela permet aux éditeurs de simplifier le processus d'édition et de révision.

Ce qu'il y a à l'Université ITMO :

Source : habr.com

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