Nan seri detektif ak fim, kote kriminolojis jwe wòl prensipal la nan kondwi konplo a, ou ka souvan wè ki jan moun ki kite tras sa yo te idantifye avèk siksè pa bou a nan yon sigarèt oswa pa chiklèt kole sou tab la. Nan lavi reyèl, ou ka aprann anpil bagay sou li tou nan chiklèt moulen ki te nan bouch yon moun. Jodi a nou pral gade nan yon etid nan ki syantis nan University of Copenhagen dekouvri "chiklèt moulen" pandan fouyman, ki gen apeprè 5700 ane fin vye granmoun. Ki enfòmasyon sou moun syantifik yo ta ka jwenn nan jwenn yo, ki lòt moun te kapab pale ansyen chiklèt, e ki jan rechèch sa a ta ka afekte batay la kont divès maladi nan lavni? Repons kesyon sa yo ap tann nou nan rapò syantis yo. Ale.
Rechèch baz
Karaktè prensipal etid sa a se résine Birch oswa goudwon Birch. Sibstans mawon-nwa sa a jwenn lè w bouyi kouch anwo nan jape Birch (jape Birch) nan yon veso ki fèmen. Nan kondisyon sa yo, chofaj fèt san aksè a oksijèn, i.e. distilasyon sèk. Pandan pwosesis chofaj la, jape Birch konvèti an goudwon.
Nan tan lontan, pwosesis sa a te fèt nan resipyan ajil sou yon dife. Nan epòk sa yo, goudwon te anjeneral itilize pou trete pwodwi wòch kòm yon lakòl inivèsèl. Premye dekouvèt akeyolojik nan goudwon lèzòm yo te itilize yo remonte nan peryòd Paleolitik la.
Li lojik ke goudwon te itilize nan "endistri", se konsa pale. Sepandan, akeyològ yo te jwenn tras dan sou anpil moso nan résine Birch. Poukisa zansèt nou yo te moulen goudwon? Gen plizyè teyori pou eksplike sa. Premyèman, goudwon byen vit vin di lè li refwadi, kidonk moulen li ta ka akòz dezi a chofe li epi fè li douser pou travay. Gen yon teyori ki deklare ke goudwon te moulen pou diminye doulè ki te koze pa maladi nan kavite oral la, depi goudwon yo konsidere kòm yon Antiseptik, byenke yon sèl trè fèb. Epitou, kèk chèchè kwè ke sa yo te kòmansman ijyèn dantè, ak goudwon an te aji kòm yon bwòs dan ansyen. Ak teyori ki pi komik, men se poutèt sa pa san sans, se plezi. Ansyen moun te kapab moulen résine a jis konsa, i.e. san okenn bon rezon.
Fè résine Birch nan pratik.
Gen yon anpil nan espekilasyon sou sijè a nan moulen résine pa ansyen moun, men pèsonn pa te fè anpil rechèch ki bay rezilta konkrè. Se poutèt sa, syantis nan University of Copenhagen deside analize yon moso résine moulen yo te jwenn pandan fouyman nan sid Denmark (1a). Yon etid nan echantiyon an te montre ke li pa sèlman genyen ADN imen, men tou, ADN mikwòb, ki ta ka di plis sou mikrobyom oral la. ADN te jwenn tou nan plant ki te aparamman boule pa ansyen moun anvan moulen résine a.
ADN a tèlman byen konsève, syantis yo kontan ke yo te kapab izole genòm konplè imen an. Reyalite sa a w pèdi ensiyifyan se aktyèlman yon zouti nan akeyoloji ak jenetik. Reyalite a se ke genomic konplè a nan yon ansyen moun te kapab deja jwenn sèlman nan kadav li yo (anjeneral zo).
Rezilta rechèch
Lè yo te resevwa "prèv materyèl yo," akeyològ yo te kòmanse yon analiz etap pa etap sou li pou jwenn enfòmasyon ki pi konplè sou "sispèk" nou an, ki te moulen résine Birch.
Imaj #1
Datasyon radyo-kabòn, ki fèt lè yo varye kantite izotòp radyo-aktif 14C nan yon echantiyon an parapò ak izotòp ki estab kabòn, yo jwenn jansiv la genyen ant 5858 ak 5661 ane (1b). Sa a sijere ke echantiyon an dat tounen nan peryòd Neyolitik bonè. Peryòd sa a yo rele tou "New Stone Age", kòm pwodwi wòch yo te vin pi konplèks, ak teknoloji a nan fanm k'ap pile ak perçage twou parèt.
Analiz chimik lè l sèvi avèk Fourier transfòme espektroskopi enfrawouj (FTIR) pwodui yon spectre ki sanble anpil ak goudwon Birch modèn. GC/MS (kwomatografi gaz/spèktrometri mas) revele prezans triterpèn betulin ak lupeol, ki se byen komen nan echantiyon yo pran nan Birch (1c). Lòt konfimasyon ke echantiyon an te Birch te tras yo nan asid dikarboksilik ak asid gra satire idantifye pa menm GC/MS la.
Kidonk, syantis yo te jwenn echantiyon an se résine Birch ki gen laj soti nan 5858 a 5661 ane (bonè Neyolitik).
Pwochen etap la se sekans ADN, ki te pwodwi apeprè 360 milyon sekans ADN baz-pè, prèske yon tyè nan ki ta ka inikman matche ak genòm referans imen an (hg19).
Sekans baz pè nan ADN imen yo te montre tout karakteristik nannan nan ADN ansyen moun yo: longè mwayèn nan fragman jistis kout, prezans souvan. purin* rupture suture ak ogmante frekans ranplasman vizib sitozin* (C) sou timin* (T) nan pwent 5′ fragman ADN yo.
purin* (C5N4H4) se reprezantan ki pi senp nan imidazo [4,5-d] pirimidin.
Sitozin* (C4H5N3O) se yon konpoze òganik, yon baz nitwojèn, yon dérivés pirimidin.
Timin* (C5H6N2O2) se yon derive pirimidin, youn nan senk baz nitwojèn.
Li te tou pwodwi apeprè 7.3 GB nan done konsènan sekans ki pa imen.
Echantiyon an te genyen apeprè 30% ADN moun andojèn. Sa a se konparab ak dan yo byen konsève ak zo nan ansyen moun.
Ki baze sou relasyon ki genyen ant sekans yo nan baz pè ki koresponn ak kwomozòm yo X ak Y, syantis yo te kapab detèmine sèks nan lover nan jansiv ansyen - fi.
Yo nan lòd yo predi koulè a nan cheve, je ak po, jenotip yo te sòti pou karannde youn. SNP*ki enkli nan sistèm nan .
SNP* (sèl polimorfis nukleotid) - diferans ki genyen nan sekans ADN nan yon sèl nukleotid nan gwosè nan genomic reprezantan menm espès la oswa ant rejyon omològ kwomozòm omològ.
Analiz sa a te montre ke fanm nan te po nwa ak cheve mawon nwa ak je ble.
Imaj #2
Syantis yo te jwenn 593102 SNP nan genòm nan etid la ki te deja genotip nan yon baz done ki gen > 1000 imen modèn ak > 100 deja pibliye ansyen jenom.
Sou imaj la 2a yo montre rezilta analiz eleman prensipal yo. Metòd sa a nan rediksyon dimansyon done pèmèt nou detèmine ke ansyen fanm ki gen genòm yo ap etidye a gen plis chans yon chasè-rasanble Lwès (W.H.G.). Konparezon alèl* moun modèn ak yon ansyen fanm konfime manm li nan yon gwoup etabli (2b).
alèl* - diferan kalite jèn nan menm, ki sitiye nan menm rejyon yo nan kwomozòm omològ. Alèl yo detèmine direksyon devlopman yon karakteristik patikilye.
Rezilta sa yo konfime tou pa analiz qpAdm. Analiz sa a montre ke yon senp modèl lineyè, ki sipoze yon orijin 100% WHG pou ansyen fanm lan, pa ka jete an favè yon modèl ki pi konplèks (2s).
Pou karakterize lajman konpozisyon taksonomik nan sekans ki pa imen nan echantiyon an, yo te itilize MetaPhlan2, yon zouti ki fèt espesyalman pou pwofil taksonomik nan sekans kout yo jwenn. metòd fizi*.
Metòd fizi* - yon metòd pou sekans seksyon long nan ADN, lè w ap jwenn yon echantiyon masiv o aza nan fragman ADN klone pèmèt ou retabli sekans ADN orijinal la.
Imaj #3
Sou "origami" 3a montre rezilta yo nan yon analiz eleman prensipal konpare konpozisyon mikwòb echantiyon etid la ak 689 pwofil mikrobyom ki soti nan Pwojè Mikwobyom Imèn (HMP). Te gen gwoupman ant done echantiyon yo ak done HMP yo, sa vle di yo te sanble anpil. Sa a se tou vizib sou 3b, ki montre konpozisyon mikwòb résine a an konparezon ak menm bagay la tou soti nan de echantiyon tè (koleksyon an te fèt nan menm plas la) ak an konparezon ak konpozisyon an mikwòb nan imen modèn.
Yon analiz pi detaye sou konpozisyon mikwòb la te montre prezans bakteri Neisseria subflava и Rothia mucilaginosaAk Porphyromonas jenjivali, Tannerella forsythia и Treponema denticola. Anplis de sa, tras viris Epstein-Barr yo te detekte.
Plizyè espès strèptokok ki fè pati gwoup la MitisKi gen ladan Streptococcus viridans и Streptococcus pneumoniae.
Tablo 1: Lis tout takson ki pa imen yo te jwenn nan echantiyon goudwon Birch la.
Yo te rekonstwi yon genòm konsansis apati de sekans pè baz S. pneumoniae ak estimasyon kantite sit eterozigòt. Rezilta yo te montre prezans plizyè tansyon (imaj #4).
Imaj #4
Pou evalye virulans nan tansyon yo S. pneumoniaeEkstrè soti nan ansyen résine, syantis yo matche kontig (yon seri segman ADN ki sipèpoze) ak yon baz done konplè sou faktè virulans, ki pèmèt yo idantifye jèn li te ye. virulans* S. pneumoniae.
Virilans* — degre nan kapasite souch la pou enfekte òganis yo ap etidye a.
Ven-sis faktè virulans nan S. pneumoniae yo te idantifye nan echantiyon ansyen an, ki gen ladan polisakarid kapsulè (CPS), enolaz strèptokok (Eno), ak antijèn sifas nemokoksik A (PsaA).
Analiz de echantiyon résine ansyen an tou revele prezans nan tras nan de espès plant: Birch (Betula pendula) ak nwazèt (Corylus avellana). Anplis de sa, apeprè 50000 sekans yo te dekouvri ki te gen rapò ak mallard la (Anas platyrhynchos, yon espès kanna).
Pou yon konesans pi detaye ak nuans etid la, mwen rekòmande gade и pou li.
Épilogue
Etid sa a ka jis rele inik, bay kantite enfòmasyon yo jwenn. Précédemment, yo te kapab retabli genòm konplè a nan yon ansyen moun sèlman nan rès li (zo ak dan), men nan travay sa a, syantis yo te kapab jwenn li nan résine Birch moulen.
Yo te jwenn ke ansyen jansiv la, 5700 ane fin vye granmoun, te moulen pa yon fanm ki gen po nwa, cheve mawon fonse ak je ble. Deskripsyon sa a nan aparans yon lòt fwa ankò konfime ke pigmantasyon po pi lejè nan mitan moun ki rete nan pati lwès la nan Eurasia te kòmanse parèt pita. Anplis de sa, karakteristik ekstèn sa yo konparab ak sa yo ki nan reprezantan ki nan Western chasè-rasanbleman, ki prezimableman enkli fanm nan ki gen genomic yo te jwenn nan echantiyon an.
Avantaj nan etidye résine moulen se ke li bay enfòmasyon konsènan konpozisyon mikwòb nan kavite oral la nan yon ansyen moun. Analiz sa a te montre prezans plizyè kalite bakteri (Neisseria subflava, Rothia mucilaginosa, Porphyromonas jenjivali, Tannerella forsythia и Treponema denticola). Anplis de sa, yo te jwenn tras nan viris Epstein-Barr, ki pa etone, bay gwo prévalence viris sa a nan mitan moun modèn (90-95% nan popilasyon adilt la se transpòtè li yo).
Plizyè espès streptococci nan gwoup la te jwenn tou MitisKi gen ladan Streptococcus viridans и Streptococcus pneumoniae.
Kòm pou preferans gastronomik ansyen fanm lan, evalyasyon an nan sekans ADN ki pa imen, ki te tou pa gen rapò ak viris oswa bakteri, yo te jwenn tras nan Birch, nwazèt ak kanna mallard. Li ka sipoze ke plant sa yo ak bèt yo te baz la nan manje pou ansyen moun yo nan peryòd sa a. Sepandan, gen yon bon chans ke ADN nan plant ak bèt sa yo te antre nan résine a paske ansyen fanm nan boule yo yon ti tan anvan moulen résine a. Nan lòt mo, sa a ta ka yon ensidan izole.
Poukisa résine se yon sous ekselan nan ansyen ADN imen? Bagay la se ke pandan pwosesis moulen an, ADN "sele" ak résine epi estoke nan li akòz pwopriyete aseptik ak idrofob li yo.
Nan lavni an, syantis yo planifye analize lòt echantiyon yo te jwenn, ki pral ede plis konprann lavi a nan ansyen moun. Anplis de sa, konpozisyon mikwòb ansyen echantiyon yo bay yon insight sou evolisyon mikwòb oral ak kèk patojèn.
Kèlkeswa, ranmase anpil enfòmasyon sou yon nonm nan yon moso résine moulen li te krache 5700 ane de sa se yon reyalizasyon enkwayab. Pou kèk moun, enfòmasyon ki soti nan tan lontan an, espesyalman yon sèl byen lwen, pa enpòtan. Sepandan, an reyalite, plis nou konnen sou zansèt nou yo, plis nou konprann pwòp tèt nou.
Vandredi sou tèt:
Yon videyo sou fason yo pwodui chiklèt nan mond modèn lan.
Off-top 2.0:
Yon ti nostalji :)
Mèsi paske w gade, rete kirye epi pase yon bon wikenn tout moun! 🙂
Kèk piblisite 🙂
Mèsi paske w rete avèk nou. Ou renmen atik nou yo? Vle wè plis kontni enteresan? Sipòte nou pa mete yon lòd oswa rekòmande pou zanmi, , yon analogue inik nan sèvè nivo antre, ki te envante pa nou pou ou: (disponib ak RAID1 ak RAID10, jiska 24 nwayo ak jiska 40GB DDR4).
Dell R730xd 2 fwa pi bon mache nan sant done Equinix Tier IV nan Amstèdam? Sèlman isit la nan Netherlands! Dell R420 - 2x E5-2430 2.2Ghz 6C 128GB DDR3 2x960GB SSD 1Gbps 100TB - soti nan $ 99! Li sou
Sous: www.habr.com