Premye genòm òdinatè ta ka mennen nan fòm lavi sentetik

Tout sekans ADN fòm lavi syantis yo etidye yo estoke nan yon baz done ki posede pa Sant Nasyonal pou Enfòmasyon sou Biotechnologie nan peyi Etazini. Epi sou 1ye avril, yon nouvo antre parèt nan baz done a: "Caulobacter ethensis-2.0." Sa a se premye genòm sentetik nan yon òganis vivan ki gen yon modèl konplètman òdinatè epi apre sa sentèz, devlope pa syantis nan ETH Zurich (ETH Zurich). Sepandan, li ta dwe mete aksan sou ke byenke genomic nan C. ethensis-2.0 te jwenn avèk siksè nan fòm lan nan yon molekil ADN gwo, yon òganis k ap viv korespondan poko egziste.

Premye genòm òdinatè ta ka mennen nan fòm lavi sentetik

Travay rechèch la te fèt pa Beat Christen, yon pwofesè nan byoloji sistèm eksperimantal, ak frè l Matthias Christen, yon famasi. Nouvo genòm nan, ki rele Caulobacter ethensis-2.0, te kreye pa netwaye ak optimize kòd natirèl bakteri Caulobacter crescentus, yon bakteri inofansif ki ap viv nan dlo fre atravè mond lan.  

Premye genòm òdinatè ta ka mennen nan fòm lavi sentetik

Sa gen plis pase yon dekad, yon ekip ki te dirije pa jenetikis Craig Venter te kreye premye bakteri "sentetik". Nan kou a nan travay yo, syantis yo sentèz yon kopi nan Mycoplasma mycoides genòm, Lè sa a, li te implanté nan yon selil konpayi asirans, ki Lè sa a, yo te tounen vin konplètman solid epi kenbe kapasite nan repwodui tèt li.

Nouvo etid la kontinye travay Kreiger. Si deja syantis yo te kreye yon modèl dijital ADN nan yon òganis reyèl epi sentèz yon molekil ki baze sou li, nouvo pwojè a ale pi lwen, lè l sèvi avèk kòd ADN orijinal la. Syantis yo anpil retravay li anvan sentèz li ak tès fonksyonalite li yo.

Chèchè yo te kòmanse ak orijinal genomic C. crescentus, ki gen 4000 jèn. Menm jan ak nenpòt òganis vivan, pi fò nan jèn sa yo pa pote okenn enfòmasyon epi yo se "ADN tenten". Apre analiz la, syantis yo te rive nan konklizyon ke sèlman apeprè 680 nan yo ki nesesè yo kenbe lavi sa a ki nan bakteri nan laboratwa a.

Apre yo fin retire ADN tenten an epi jwenn yon genòm minim C. crescentus, ekip la te kontinye travay yo. ADN nan òganis vivan karakterize pa prezans nan redondance entegre, ki gen ladann nan lefèt ke sentèz la nan menm pwoteyin nan se kode pa jèn diferan nan plizyè seksyon nan chèn lan. Chèchè yo ranplase plis pase 1/6 nan 800 lèt ADN nan yon optimize pou retire kòd kopi.

"Gras a algorithm nou an, nou te konplètman reekri genòm nan nan yon nouvo sekans lèt ADN ki pa sanble ak orijinal la ankò," di Beat Christen, ko-dirijan otè etid la. "An menm tan an, fonksyon byolojik nan nivo sentèz pwoteyin rete san okenn chanjman."

Pou teste si chèn ki te lakòz la ta travay byen nan yon selil vivan, chèchè yo te grandi yon souch bakteri ki te gen tou de genòm natirèl Caulobacter ak segman nan genòm atifisyèl nan ADN li. Syantis yo etenn jèn natirèl endividyèl yo epi yo teste kapasite tokay atifisyèl yo pou yo fè menm wòl byolojik la. Rezilta a te byen enpresyonan: apeprè 580 sou 680 jèn atifisyèl yo te vin fonksyonèl.

Kristen di: "Avèk konesans nou jwenn, nou pral kapab amelyore algorithm nou an epi devlope yon nouvo vèsyon genomic 3.0. "Nou kwè ke nan fiti prè nou pral kreye selil bakteri vivan ak yon genòm konplètman sentetik."

Nan premye etap la, syans sa yo pral ede jenetik yo tcheke presizyon nan konesans yo nan domèn konpreyansyon ADN ak wòl nan jèn endividyèl yo nan li, paske nenpòt erè nan sentèz la nan chèn lan ap mennen nan lefèt ke òganis la ak la. nouvo genòm pral mouri oswa defektye. Nan lavni an, yo pral mennen nan Aparisyon nan mikwo-òganis sentetik ki pral kreye pou travay predetèmine. Viris atifisyèl yo pral kapab goumen ak fanmi natirèl yo, ak bakteri espesyal yo pral pwodwi vitamin oswa medikaman.

Etid la te pibliye nan jounal PNAS.




Sous: 3dnews.ru

Add nouvo kòmantè