פגם בתסריט של Python עלול להוביל לתוצאות שגויות ביותר מ-100 פרסומי כימיה

סטודנט לתואר שני באוניברסיטת הוואי נמצא בעיה בסקריפט Python המשמש לחישובים תזוזה כימית, הקובע את המבנה הכימי של החומר הנחקר במהלך ניתוח ספקטרלי של אותות באמצעות השיטה תהודה מגנטית גרעינית. בזמן אימות תוצאות המחקר של אחד מהפרופסורים שלו, סטודנט לתואר שני שם לב שכאשר מפעיל סקריפט במערכות הפעלה שונות על אותו מערך נתונים, הפלט היה שונה.

לדוגמה, כאשר פועל על macOS 10.14 ו-Ubuntu 16.04 עבור מערך הנתונים שנבדק, הסקריפט הפיקו ערך שגוי 172.4 במקום 173.2. התסריט כולל כ-1000 שורות קוד והוא נמצא בשימוש על ידי כימאים מאז 2014. בדיקת הקוד הראתה שהפלט שגוי עקב הבדלים בעת מיון קבצים במערכות הפעלה שונות. מחברי התסריט האמינו שהפונקציה "גלוב ()תמיד מחזיר קבצים ממוינים לפי שם, בעוד בתיעוד הגלוב קובע שסדר הפלט אינו מובטח. התיקון היה להוסיף list_of_files.sort() לאחר הקריאה glob().

הבעיה שהתגלתה הטילה ספק בנכונותם של יותר מ-100 פרסומים על כימיה, שמסקנותיהם נעשו על בסיס השינוי הכימי שחושב על ידי התסריט. המספר המדויק של המחקרים שבהם נעשה שימוש בתסריט אינו ידוע, אך פרסומים עם הקוד שלו צוטטו ב-158 מאמרים. למחברי עבודות אלו מומלץ להעריך את נכונות הסקריפט במערכות ההפעלה המשמשות לחישובים ולחשב אותם מחדש על מנת להבטיח שהערכים המחושבים נכונים. האירוע הוא דוגמה מצוינת לכך שלא רק איכות הניסוי, אלא גם נכונות עיבוד הנתונים המתקבלים בתוכנות
זה נעשה שימוש נרחב עשוי להשפיע על התוצאה הסופית.

מקור: OpenNet.ru