ಪ್ರಸ್ತುತ COVID-19 ಸಾಂಕ್ರಾಮಿಕವು ಹ್ಯಾಕರ್ಗಳು ದಾಳಿ ಮಾಡಲು ಸಂತೋಷಪಡುವ ಅನೇಕ ಸಮಸ್ಯೆಗಳನ್ನು ಸೃಷ್ಟಿಸಿದೆ. 3D ಮುದ್ರಿತ ಫೇಸ್ ಶೀಲ್ಡ್ಗಳು ಮತ್ತು ಮನೆಯಲ್ಲಿ ತಯಾರಿಸಿದ ವೈದ್ಯಕೀಯ ಮುಖವಾಡಗಳಿಂದ ಪೂರ್ಣ ಯಾಂತ್ರಿಕ ವೆಂಟಿಲೇಟರ್ ಅನ್ನು ಬದಲಿಸುವವರೆಗೆ, ಆಲೋಚನೆಗಳ ಹರಿವು ಸ್ಪೂರ್ತಿದಾಯಕ ಮತ್ತು ಹೃದಯವನ್ನು ಬೆಚ್ಚಗಾಗಿಸುತ್ತದೆ. ಅದೇ ಸಮಯದಲ್ಲಿ, ಮತ್ತೊಂದು ಪ್ರದೇಶದಲ್ಲಿ ಮುನ್ನಡೆಯಲು ಪ್ರಯತ್ನಗಳು ನಡೆದವು: ವೈರಸ್ ಅನ್ನು ಎದುರಿಸುವ ಗುರಿಯನ್ನು ಸಂಶೋಧನೆಯಲ್ಲಿ.
ಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿ, ಪ್ರಸ್ತುತ ಸಾಂಕ್ರಾಮಿಕ ರೋಗವನ್ನು ನಿಲ್ಲಿಸುವ ಮತ್ತು ನಂತರದ ಎಲ್ಲವನ್ನು ಮೀರಿಸುವ ದೊಡ್ಡ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವು ಸಮಸ್ಯೆಯ ಮೂಲವನ್ನು ಪಡೆಯಲು ಪ್ರಯತ್ನಿಸುವ ವಿಧಾನದಲ್ಲಿದೆ. ಈ "ನಿಮ್ಮ ಶತ್ರುವನ್ನು ತಿಳಿದುಕೊಳ್ಳಿ" ವಿಧಾನವನ್ನು ಫೋಲ್ಡಿಂಗ್ @ ಹೋಮ್ ಕಂಪ್ಯೂಟಿಂಗ್ ಯೋಜನೆಯಿಂದ ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳಲಾಗಿದೆ. ಲಕ್ಷಾಂತರ ಜನರು ಯೋಜನೆಗೆ ಸಹಿ ಹಾಕಿದ್ದಾರೆ ಮತ್ತು ತಮ್ಮ ಪ್ರೊಸೆಸರ್ಗಳು ಮತ್ತು GPU ಗಳ ಕೆಲವು ಸಂಸ್ಕರಣಾ ಶಕ್ತಿಯನ್ನು ದಾನ ಮಾಡುತ್ತಿದ್ದಾರೆ, ಹೀಗಾಗಿ ಇತಿಹಾಸದಲ್ಲಿ ಅತಿದೊಡ್ಡ [ವಿತರಣೆ] ಸೂಪರ್ಕಂಪ್ಯೂಟರ್ ಅನ್ನು ರಚಿಸಿದ್ದಾರೆ.
ಆದರೆ ಈ ಎಲ್ಲಾ ಎಕ್ಸಾಫ್ಲಾಪ್ಗಳನ್ನು ನಿಖರವಾಗಿ ಯಾವುದಕ್ಕಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ? ಅಂತಹ ಕಂಪ್ಯೂಟಿಂಗ್ ಶಕ್ತಿಯನ್ನು ಎಸೆಯುವುದು ಏಕೆ ಅಗತ್ಯ?
ಮೊದಲನೆಯದಾಗಿ, ಪ್ರಮುಖ ವಿಷಯ: ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಏಕೆ ಬೇಕು?
ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಪ್ರಮುಖ ರಚನೆಗಳಾಗಿವೆ. ಅವು ಜೀವಕೋಶಗಳಿಗೆ ಕಟ್ಟಡ ಸಾಮಗ್ರಿಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸುವುದಲ್ಲದೆ, ಬಹುತೇಕ ಎಲ್ಲಾ ಜೀವರಾಸಾಯನಿಕ ಕ್ರಿಯೆಗಳಿಗೆ ಕಿಣ್ವ ವೇಗವರ್ಧಕಗಳಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ. ಅಳಿಲುಗಳೇ ಇರಲಿ
ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ತಮ್ಮ ಕಾರ್ಯವನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸುವ ರಚನೆಯನ್ನು ಹೇಗೆ ಪಡೆದುಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ ಎಂಬುದನ್ನು ಅರ್ಥಮಾಡಿಕೊಳ್ಳಲು, ನಾವು ಆಣ್ವಿಕ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರದ ಮೂಲಭೂತ ಅಂಶಗಳನ್ನು ಮತ್ತು ಜೀವಕೋಶದಲ್ಲಿನ ಮಾಹಿತಿಯ ಹರಿವಿನ ಮೇಲೆ ಹೋಗಬೇಕಾಗಿದೆ.
ಉತ್ಪಾದನೆ, ಅಥವಾ
ರೈಬೋಸೋಮ್ಗಳು ಅಸೆಂಬ್ಲಿ ಯಂತ್ರಗಳಂತೆ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ - ಅವು ಎಮ್ಆರ್ಎನ್ಎ ಟೆಂಪ್ಲೇಟ್ ಅನ್ನು ತೆಗೆದುಕೊಂಡು ಅದನ್ನು ಆರ್ಎನ್ಎಯ ಇತರ ಸಣ್ಣ ತುಣುಕುಗಳಿಗೆ ಹೊಂದಿಸುತ್ತವೆ,
ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಈ ಅನುಕ್ರಮವು ಪ್ರೋಟೀನ್ ರಚನಾತ್ಮಕ ಕ್ರಮಾನುಗತದ ಮೊದಲ ಹಂತವಾಗಿದೆ, ಅದಕ್ಕಾಗಿಯೇ ಇದನ್ನು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ
ಪ್ರೋಟೀನ್ ಭಾಗಗಳ ದೀರ್ಘ-ಶ್ರೇಣಿಯ ಬಂಧಗಳು
ಮೂರು ಆಯಾಮದ ರಚನೆಯ ಮುಂದಿನ ಹಂತ, ಪ್ರಾಥಮಿಕವನ್ನು ಮೀರಿ, ಬುದ್ಧಿವಂತ ಹೆಸರನ್ನು ನೀಡಲಾಯಿತು
ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಆಲ್ಫಾ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ಮತ್ತು ಬೀಟಾ ಶೀಟ್ಗಳು. ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಹೈಡ್ರೋಜನ್ ಬಂಧಗಳು ರೂಪುಗೊಳ್ಳುತ್ತವೆ.
ಈ ಎರಡು ರಚನೆಗಳು ಮತ್ತು ಅವುಗಳ ಸಂಯೋಜನೆಗಳು ಮುಂದಿನ ಹಂತದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ರಚನೆಯನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತವೆ -
ಅಲ್ಲದೆ, ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ನಡುವಿನ ದೀರ್ಘ-ಶ್ರೇಣಿಯ ಬಂಧಗಳಿಂದ ತೃತೀಯ ರಚನೆಗಳ ಸ್ಥಿರತೆಯನ್ನು ಖಚಿತಪಡಿಸಿಕೊಳ್ಳಲಾಗುತ್ತದೆ. ಅಂತಹ ಸಂಪರ್ಕಗಳ ಒಂದು ಶ್ರೇಷ್ಠ ಉದಾಹರಣೆಯಾಗಿದೆ
ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಸಿಟಿ ಅಥವಾ ಡೈಸಲ್ಫೈಡ್ ಬಂಧಗಳಂತಹ ದೀರ್ಘ-ಶ್ರೇಣಿಯ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳಿಂದ ತೃತೀಯ ರಚನೆಯನ್ನು ಸ್ಥಿರಗೊಳಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ
ನಡುವೆ ಡೈಸಲ್ಫೈಡ್ ಬಂಧಗಳು ಸಂಭವಿಸಬಹುದು
ರೋಗಕ್ಕೆ ಪರಿಹಾರದ ಹುಡುಕಾಟದಲ್ಲಿ ರಚನೆಗಳನ್ನು ಮಾಡೆಲಿಂಗ್ ಮಾಡುವುದು
ಪಾಲಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸರಪಳಿಗಳು ಅನುವಾದದ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಅವುಗಳ ಅಂತಿಮ ಆಕಾರಕ್ಕೆ ಮಡಚಿಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ, ಏಕೆಂದರೆ ಬೆಳೆಯುತ್ತಿರುವ ಸರಪಳಿ ರೈಬೋಸೋಮ್ನಿಂದ ನಿರ್ಗಮಿಸುತ್ತದೆ, ಮೆಮೊರಿ-ಮಿಶ್ರಲೋಹದ ತಂತಿಯ ತುಂಡು ಬಿಸಿಯಾದಾಗ ಸಂಕೀರ್ಣ ಆಕಾರಗಳನ್ನು ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳಬಹುದು. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಯಾವಾಗಲೂ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರದಲ್ಲಿ, ವಿಷಯಗಳು ಅಷ್ಟು ಸುಲಭವಲ್ಲ.
ಅನೇಕ ಜೀವಕೋಶಗಳಲ್ಲಿ, ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ ಮಾಡಲಾದ ಜೀನ್ಗಳು ಅನುವಾದದ ಮೊದಲು ವ್ಯಾಪಕವಾದ ಸಂಪಾದನೆಗೆ ಒಳಗಾಗುತ್ತವೆ, ಜೀನ್ನ ಶುದ್ಧ ಮೂಲ ಅನುಕ್ರಮಕ್ಕೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಮೂಲ ರಚನೆಯನ್ನು ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿ ಬದಲಾಯಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಸಂದರ್ಭದಲ್ಲಿ, ಭಾಷಾಂತರ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಆಣ್ವಿಕ ಚಾಪೆರೋನ್ಗಳ ಸಹಾಯವನ್ನು ಪಡೆಯುತ್ತವೆ, ಅದು ತಾತ್ಕಾಲಿಕವಾಗಿ ಹೊಸ ಪಾಲಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಸರಪಳಿಗೆ ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಯಾವುದೇ ಮಧ್ಯಂತರ ರೂಪವನ್ನು ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳದಂತೆ ತಡೆಯುತ್ತದೆ, ಇದರಿಂದ ಅವು ಅಂತಿಮ ರೂಪಕ್ಕೆ ಹೋಗಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗುವುದಿಲ್ಲ.
ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಅಂತಿಮ ಆಕಾರವನ್ನು ಊಹಿಸುವುದು ಕ್ಷುಲ್ಲಕ ಕೆಲಸವಲ್ಲ ಎಂದು ಹೇಳುವುದು ಇಷ್ಟೇ. ದಶಕಗಳವರೆಗೆ, ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ರಚನೆಯನ್ನು ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡುವ ಏಕೈಕ ಮಾರ್ಗವೆಂದರೆ ಎಕ್ಸ್-ರೇ ಸ್ಫಟಿಕಶಾಸ್ತ್ರದಂತಹ ಭೌತಿಕ ವಿಧಾನಗಳ ಮೂಲಕ. 1960 ರ ದಶಕದ ಅಂತ್ಯದವರೆಗೆ ಜೈವಿಕ ಭೌತಶಾಸ್ತ್ರದ ರಸಾಯನಶಾಸ್ತ್ರಜ್ಞರು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಫೋಲ್ಡಿಂಗ್ನ ಕಂಪ್ಯೂಟೇಶನಲ್ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ನಿರ್ಮಿಸಲು ಪ್ರಾರಂಭಿಸಿದರು, ಪ್ರಾಥಮಿಕವಾಗಿ ದ್ವಿತೀಯ ರಚನೆಯ ಮಾದರಿಯ ಮೇಲೆ ಕೇಂದ್ರೀಕರಿಸಿದರು. ಈ ವಿಧಾನಗಳು ಮತ್ತು ಅವುಗಳ ವಂಶಸ್ಥರಿಗೆ ಪ್ರಾಥಮಿಕ ರಚನೆಯ ಜೊತೆಗೆ ಅಗಾಧ ಪ್ರಮಾಣದ ಇನ್ಪುಟ್ ಡೇಟಾ ಅಗತ್ಯವಿರುತ್ತದೆ - ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಅಮೈನೋ ಆಸಿಡ್ ಬಾಂಡ್ ಕೋನಗಳ ಕೋಷ್ಟಕಗಳು, ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಸಿಟಿಯ ಪಟ್ಟಿಗಳು, ಚಾರ್ಜ್ಡ್ ಸ್ಟೇಟ್ಸ್, ಮತ್ತು ವಿಕಸನೀಯ ಸಮಯದ ಮಾಪಕಗಳ ಮೇಲೆ ರಚನೆ ಮತ್ತು ಕಾರ್ಯದ ಸಂರಕ್ಷಣೆ - ಎಲ್ಲಾ ಸಲುವಾಗಿ ಅಂತಿಮ ಪ್ರೋಟೀನ್ನಂತೆ ಏನಾಗುತ್ತದೆ ಎಂದು ಊಹಿಸಿ.
ಫೋಲ್ಡಿಂಗ್ @ ಹೋಮ್ ನೆಟ್ವರ್ಕ್ನಲ್ಲಿ ಚಾಲನೆಯಲ್ಲಿರುವಂತಹ ಸೆಕೆಂಡರಿ ಸ್ಟ್ರಕ್ಚರ್ ಪ್ರಿಡಿಕ್ಷನ್ಗಾಗಿ ಇಂದಿನ ಕಂಪ್ಯೂಟೇಶನಲ್ ವಿಧಾನಗಳು ಸುಮಾರು 80% ನಿಖರತೆಯೊಂದಿಗೆ ಕೆಲಸ ಮಾಡುತ್ತವೆ-ಇದು ಸಮಸ್ಯೆಯ ಸಂಕೀರ್ಣತೆಯನ್ನು ಪರಿಗಣಿಸಿ ಬಹಳ ಒಳ್ಳೆಯದು. SARS-CoV-2 ಸ್ಪೈಕ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ನಂತಹ ಪ್ರೊಟೀನ್ಗಳ ಮೇಲೆ ಭವಿಷ್ಯಸೂಚಕ ಮಾದರಿಗಳಿಂದ ಉತ್ಪತ್ತಿಯಾಗುವ ಡೇಟಾವನ್ನು ವೈರಸ್ನ ಭೌತಿಕ ಅಧ್ಯಯನಗಳ ಡೇಟಾದೊಂದಿಗೆ ಹೋಲಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಪರಿಣಾಮವಾಗಿ, ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ನಿಖರವಾದ ರಚನೆಯನ್ನು ಪಡೆಯಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಬಹುಶಃ ವೈರಸ್ ಗ್ರಾಹಕಗಳಿಗೆ ಹೇಗೆ ಅಂಟಿಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ಅರ್ಥಮಾಡಿಕೊಳ್ಳಬಹುದು.
ಪ್ರೋಟೀನ್ ಫೋಲ್ಡಿಂಗ್ ಸಂಶೋಧನೆಯು ಹಲವಾರು ರೋಗಗಳು ಮತ್ತು ಸೋಂಕುಗಳ ಬಗ್ಗೆ ನಮ್ಮ ತಿಳುವಳಿಕೆಯ ಹೃದಯಭಾಗದಲ್ಲಿದೆ, ನಾವು ಇತ್ತೀಚೆಗೆ ಬೆಳವಣಿಗೆಯಲ್ಲಿ ಸ್ಫೋಟಗೊಳ್ಳುತ್ತಿರುವುದನ್ನು ನಾವು ನೋಡಿರುವ COVID-19 ಅನ್ನು ಹೇಗೆ ಸೋಲಿಸುವುದು ಎಂದು ಲೆಕ್ಕಾಚಾರ ಮಾಡಲು Folding@Home ನೆಟ್ವರ್ಕ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿದಾಗಲೂ ನೆಟ್ವರ್ಕ್ ಗೆಲ್ಲುತ್ತದೆ. ದೀರ್ಘಕಾಲ ಸುಮ್ಮನಿರಬೇಡ. ಕೆಲಸ. ಇದು ಅಲ್ಝೈಮರ್ ಕಾಯಿಲೆ ಅಥವಾ ಕ್ರಿಟ್ಜ್ಫೆಲ್ಡ್-ಜಾಕೋಬ್ ಕಾಯಿಲೆಯಂತಹ ಡಜನ್ಗಟ್ಟಲೆ ಪ್ರೋಟೀನ್ ತಪ್ಪು ಮಡಿಕೆ ರೋಗಗಳಿಗೆ ಆಧಾರವಾಗಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಲು ಸೂಕ್ತವಾಗಿರುವ ಸಂಶೋಧನಾ ಸಾಧನವಾಗಿದೆ, ಇದನ್ನು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಹುಚ್ಚು ಹಸುವಿನ ಕಾಯಿಲೆ ಎಂದು ತಪ್ಪಾಗಿ ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ. ಮತ್ತು ಮತ್ತೊಂದು ವೈರಸ್ ಅನಿವಾರ್ಯವಾಗಿ ಕಾಣಿಸಿಕೊಂಡಾಗ, ನಾವು ಅದನ್ನು ಮತ್ತೆ ಹೋರಾಡಲು ಸಿದ್ಧರಾಗುತ್ತೇವೆ.
ಮೂಲ: www.habr.com