ProHoster > Blog > башкаруу > Kubernetesтин иштөөсүндөгү 6 көңүл ачуучу тутум мүчүлүштүктөрү [жана аларды чечүү]

Kubernetesтин иштөөсүндөгү 6 көңүл ачуучу тутум мүчүлүштүктөрү [жана аларды чечүү]

Kubernetesтин иштөөсүндөгү 6 көңүл ачуучу тутум мүчүлүштүктөрү [жана аларды чечүү]

Kubernetes-ти өндүрүштө колдонгон жылдар ичинде биз системанын ар кандай компоненттериндеги мүчүлүштүктөрдүн контейнерлердин жана капчыктардын иштешине таасир эткен жагымсыз жана/же түшүнүксүз кесепеттерге алып келген көптөгөн кызыктуу окуяларды топтодук. Бул макалада биз эң кеңири таралган же кызыктуу айрымдарын тандап алдык. Мындай жагдайларга жолугуу жолуң болбосо да, мындай кыска детективдик аңгемелерди окуу - өзгөчө "биринчи колго" - ар дайым кызыктуу, туурабы?..

Окуя 1. Supercronic жана Docker илинген

Кластерлердин биринде биз мезгил-мезгили менен кластердин нормалдуу иштешине тоскоол болгон тоңдурулган Докерди алдык. Ошол эле учурда, Docker журналдарында төмөнкүлөр байкалды: 

level=error msg="containerd: start init process" error="exit status 2: "runtime/cgo: pthread_create failed: No space left on device
SIGABRT: abort
PC=0x7f31b811a428 m=0

goroutine 0 [idle]:

goroutine 1 [running]:
runtime.systemstack_switch() /usr/local/go/src/runtime/asm_amd64.s:252 fp=0xc420026768 sp=0xc420026760
runtime.main() /usr/local/go/src/runtime/proc.go:127 +0x6c fp=0xc4200267c0 sp=0xc420026768
runtime.goexit() /usr/local/go/src/runtime/asm_amd64.s:2086 +0x1 fp=0xc4200267c8 sp=0xc4200267c0

goroutine 17 [syscall, locked to thread]:
runtime.goexit() /usr/local/go/src/runtime/asm_amd64.s:2086 +0x1

…

Бул ката жөнүндө бизди эң ​​кызыктырган нерсе бул билдирүү: pthread_create failed: No space left on device. Quick Study документтер Докер процессти айрый албаганын, ошондуктан ал мезгил-мезгили менен тоңуп турганын түшүндүрдү.

Мониторингде төмөнкү сүрөт болуп жаткан нерсеге дал келет:

Kubernetesтин иштөөсүндөгү 6 көңүл ачуучу тутум мүчүлүштүктөрү [жана аларды чечүү]

Ушундай эле абал башка түйүндөрдө да байкалат:

Kubernetesтин иштөөсүндөгү 6 көңүл ачуучу тутум мүчүлүштүктөрү [жана аларды чечүү]

Kubernetesтин иштөөсүндөгү 6 көңүл ачуучу тутум мүчүлүштүктөрү [жана аларды чечүү]

Ошол эле түйүндөрдө биз көрөбүз:

root@kube-node-1 ~ # ps auxfww | grep curl -c
19782
root@kube-node-1 ~ # ps auxfww | grep curl | head
root     16688  0.0  0.0      0     0 ?        Z    Feb06   0:00      |       _ [curl] <defunct>
root     17398  0.0  0.0      0     0 ?        Z    Feb06   0:00      |       _ [curl] <defunct>
root     16852  0.0  0.0      0     0 ?        Z    Feb06   0:00      |       _ [curl] <defunct>
root      9473  0.0  0.0      0     0 ?        Z    Feb06   0:00      |       _ [curl] <defunct>
root      4664  0.0  0.0      0     0 ?        Z    Feb06   0:00      |       _ [curl] <defunct>
root     30571  0.0  0.0      0     0 ?        Z    Feb06   0:00      |       _ [curl] <defunct>
root     24113  0.0  0.0      0     0 ?        Z    Feb06   0:00      |       _ [curl] <defunct>
root     16475  0.0  0.0      0     0 ?        Z    Feb06   0:00      |       _ [curl] <defunct>
root      7176  0.0  0.0      0     0 ?        Z    Feb06   0:00      |       _ [curl] <defunct>
root      1090  0.0  0.0      0     0 ?        Z    Feb06   0:00      |       _ [curl] <defunct>

Көрсө, бул жүрүм-турум подвод менен иштегендин кесепети экен суперкроника (подставдарда cron жумуштарын иштетүү үчүн колдонгон Go утилитасы):

 _ docker-containerd-shim 833b60bb9ff4c669bb413b898a5fd142a57a21695e5dc42684235df907825567 /var/run/docker/libcontainerd/833b60bb9ff4c669bb413b898a5fd142a57a21695e5dc42684235df907825567 docker-runc
|   _ /usr/local/bin/supercronic -json /crontabs/cron
|       _ /usr/bin/newrelic-daemon --agent --pidfile /var/run/newrelic-daemon.pid --logfile /dev/stderr --port /run/newrelic.sock --tls --define utilization.detect_aws=true --define utilization.detect_azure=true --define utilization.detect_gcp=true --define utilization.detect_pcf=true --define utilization.detect_docker=true
|       |   _ /usr/bin/newrelic-daemon --agent --pidfile /var/run/newrelic-daemon.pid --logfile /dev/stderr --port /run/newrelic.sock --tls --define utilization.detect_aws=true --define utilization.detect_azure=true --define utilization.detect_gcp=true --define utilization.detect_pcf=true --define utilization.detect_docker=true -no-pidfile
|       _ [newrelic-daemon] <defunct>
|       _ [curl] <defunct>
|       _ [curl] <defunct>
|       _ [curl] <defunct>
…

Көйгөй бул: тапшырма суперкроникада аткарылганда, процесс андан пайда болот туура бүтүрө албайт, айланат Zombie.

пикир: Тагыраак айтканда, процесстер cron тапшырмалары менен пайда болот, бирок supercronic башталгыч система эмес жана анын балдары пайда болгон процесстерди "кабылдай албайт". SIGHUP же SIGTERM сигналдары көтөрүлгөндө, алар бала процесстерине берилбейт, натыйжада бала процесстери токтобой, зомби абалында калат. Мунун баары жөнүндө көбүрөөк окуй аласыз, мисалы мындай макала.

Көйгөйлөрдү чечүүнүн бир нече жолу бар:

  1. Убактылуу чечүү катары - бир убакта системадагы PIDдердин санын көбөйтүү: 
           /proc/sys/kernel/pid_max (since Linux 2.5.34)
              This file specifies the value at which PIDs wrap around (i.e., the value in this file is one greater than the maximum PID).  PIDs greater than this  value  are  not  allo‐
              cated;  thus, the value in this file also acts as a system-wide limit on the total number of processes and threads.  The default value for this file, 32768, results in the
              same range of PIDs as on earlier kernels
  2. Же тапшырмаларды суперкроникте түз эмес, ошол эле колдонуу менен ишке киргизиңиз Тини, ал процесстерди туура токтотуп, зомбилерди чыгара албайт.

Окуя 2. Топту жок кылууда "Зомбилер"

Kubelet көп CPU керектей баштады:

Kubernetesтин иштөөсүндөгү 6 көңүл ачуучу тутум мүчүлүштүктөрү [жана аларды чечүү]

Бул эч кимге жакпайт, ошондуктан биз өзүбүз куралдандык перф жана көйгөй менен алектене баштады. Тергөөнүн жыйынтыгы төмөнкүдөй болду:

  • Kubelet бардык топтордон эстутум маалыматтарын тартып алуу үчүн CPU убактысынын үчтөн биринен көбүн сарптайт:

    Kubernetesтин иштөөсүндөгү 6 көңүл ачуучу тутум мүчүлүштүктөрү [жана аларды чечүү]

  • Ядро иштеп чыгуучулардын почта тизмесинен сиз таба аласыз көйгөйдү талкуулоо. Кыскасы, кеп мына ушунда: ар кандай tmpfs файлдары жана башка ушул сыяктуу нерселер тутумдан толугу менен жок кылынбайт бир топту жок кылууда, деп аталган memcg Zombie. Эртеби, кечпи, алар беттин кэшинен өчүрүлөт, бирок серверде эстутум көп жана ядро ​​аларды жок кылууга убакыт коротуунун маанисин көрбөйт. Ошон үчүн алар үйүлүп турушат. Эмне үчүн бул да болуп жатат? Бул дайыма жаңы жумуш орундарын түзүүчү cron жумуштары бар сервер жана алар менен бирге жаңы подколор. Ошентип, алардагы контейнерлер үчүн жаңы топтор түзүлөт, алар жакында жок кылынат.
  • Эмне үчүн kubeletтеги cAdvisor мынча убакытты текке кетирет? Муну эң жөнөкөй аткаруу менен көрүү оңой time cat /sys/fs/cgroup/memory/memory.stat. Эгерде дени сак машинада операция 0,01 секундду талап кылса, анда көйгөйлүү cron02де 1,2 секунд талап кылынат. Кеп нерсе, sysfs маалыматтарын өтө жай окуган cAdvisor зомби топторунда колдонулган эстутумду эске алууга аракет кылат.
  • Зомбилерди күч менен жок кылуу үчүн, LKMLде сунушталган кэштерди тазалоого аракет кылдык: sync; echo 3 > /proc/sys/vm/drop_caches, - бирок өзөгү татаалыраак болуп, машинаны кыйратты.

Эмне кылыш керек? Маселе чечилүүдө (жасоо, жана сүрөттөмө үчүн караңыз билдирүү чыгаруу) Linux ядросун 4.16 версиясына жаңылоо.

History 3. Systemd жана анын монтажы

Дагы бир жолу, kubelet кээ бир түйүндөрдө өтө көп ресурстарды керектеп жатат, бирок бул жолу ал өтө көп эстутумду керектеп жатат:

Kubernetesтин иштөөсүндөгү 6 көңүл ачуучу тутум мүчүлүштүктөрү [жана аларды чечүү]

Ubuntu 16.04 колдонулган системада көйгөй бар экени жана ал туташуу үчүн түзүлгөн орнотмолорду башкарууда пайда болот. subPath ConfigMaps же сырлардан. Подчик өз ишин аяктагандан кийин systemd кызматы жана анын кызмат монтажы калат системада. Убакыттын өтүшү менен алардын көп саны топтолот. Бул тема боюнча да маселелер бар:

  1. #5916;
  2. kubernetes #57345.

...алардын акыркысы системадагы PRга тиешелүү: #7811 (системадагы маселе - #7798).

Көйгөй Ubuntu 18.04'те мындан ары жок, бирок Ubuntu 16.04'ту колдонууну улантууну кааласаңыз, бул тема боюнча биздин чечүүнү пайдалуу деп тапсаңыз болот.

Ошентип, биз төмөнкү DaemonSet жасадык:

---
apiVersion: extensions/v1beta1
kind: DaemonSet
metadata:
  labels:
    app: systemd-slices-cleaner
  name: systemd-slices-cleaner
  namespace: kube-system
spec:
  updateStrategy:
    type: RollingUpdate
  selector:
    matchLabels:
      app: systemd-slices-cleaner
  template:
    metadata:
      labels:
        app: systemd-slices-cleaner
    spec:
      containers:
      - command:
        - /usr/local/bin/supercronic
        - -json
        - /app/crontab
        Image: private-registry.org/systemd-slices-cleaner/systemd-slices-cleaner:v0.1.0
        imagePullPolicy: Always
        name: systemd-slices-cleaner
        resources: {}
        securityContext:
          privileged: true
        volumeMounts:
        - name: systemd
          mountPath: /run/systemd/private
        - name: docker
          mountPath: /run/docker.sock
        - name: systemd-etc
          mountPath: /etc/systemd
        - name: systemd-run
          mountPath: /run/systemd/system/
        - name: lsb-release
          mountPath: /etc/lsb-release-host
      imagePullSecrets:
      - name: antiopa-registry
      priorityClassName: cluster-low
      tolerations:
      - operator: Exists
      volumes:
      - name: systemd
        hostPath:
          path: /run/systemd/private
      - name: docker
        hostPath:
          path: /run/docker.sock
      - name: systemd-etc
        hostPath:
          path: /etc/systemd
      - name: systemd-run
        hostPath:
          path: /run/systemd/system/
      - name: lsb-release
        hostPath:
          path: /etc/lsb-release

... жана ал төмөнкү сценарийди колдонот: 

#!/bin/bash

# we will work only on xenial
hostrelease="/etc/lsb-release-host"
test -f ${hostrelease} && grep xenial ${hostrelease} > /dev/null || exit 0

# sleeping max 30 minutes to dispense load on kube-nodes
sleep $((RANDOM % 1800))

stoppedCount=0
# counting actual subpath units in systemd
countBefore=$(systemctl list-units | grep subpath | grep "run-" | wc -l)
# let's go check each unit
for unit in $(systemctl list-units | grep subpath | grep "run-" | awk '{print $1}'); do
  # finding description file for unit (to find out docker container, who born this unit)
  DropFile=$(systemctl status ${unit} | grep Drop | awk -F': ' '{print $2}')
  # reading uuid for docker container from description file
  DockerContainerId=$(cat ${DropFile}/50-Description.conf | awk '{print $5}' | cut -d/ -f6)
  # checking container status (running or not)
  checkFlag=$(docker ps | grep -c ${DockerContainerId})
  # if container not running, we will stop unit
  if [[ ${checkFlag} -eq 0 ]]; then
    echo "Stopping unit ${unit}"
    # stoping unit in action
    systemctl stop $unit
    # just counter for logs
    ((stoppedCount++))
    # logging current progress
    echo "Stopped ${stoppedCount} systemd units out of ${countBefore}"
  fi
done

... жана ал мурда айтылган суперкрониканы колдонуу менен 5 мүнөт сайын иштейт. Анын Dockerfile төмөнкүдөй көрүнөт:

FROM ubuntu:16.04
COPY rootfs /
WORKDIR /app
RUN apt-get update && 
    apt-get upgrade -y && 
    apt-get install -y gnupg curl apt-transport-https software-properties-common wget
RUN add-apt-repository "deb [arch=amd64] https://download.docker.com/linux/ubuntu xenial stable" && 
    curl -fsSL https://download.docker.com/linux/ubuntu/gpg | apt-key add - && 
    apt-get update && 
    apt-get install -y docker-ce=17.03.0*
RUN wget https://github.com/aptible/supercronic/releases/download/v0.1.6/supercronic-linux-amd64 -O 
    /usr/local/bin/supercronic && chmod +x /usr/local/bin/supercronic
ENTRYPOINT ["/bin/bash", "-c", "/usr/local/bin/supercronic -json /app/crontab"]

Окуя 4. Подборлорду пландаштырууда атаандаштык

Анда байкалган: эгерде бизде бир түйүнгө капчык орнотулуп, анын сүрөтү өтө узак убакытка чейин сорулуп турса, анда ошол эле түйүнгө "ураган" дагы бир капчык жөн эле болот. жаңы подъезддин сүрөтүн тарта баштабайт. Анын ордуна, ал мурунку подъезддин сүрөтү тартылганга чейин күтөт. Натыйжада, мурунтан эле пландаштырылган жана сүрөтү бир мүнөттө жүктөлүп алынышы мүмкүн болгон подкаст төмөнкү статуска ээ болот. containerCreating.

Окуялар төмөнкүдөй болот:

Normal  Pulling    8m    kubelet, ip-10-241-44-128.ap-northeast-1.compute.internal  pulling image "registry.example.com/infra/openvpn/openvpn:master"

Ал экен жай реестрден бир эле сүрөт жайгаштырууну бөгөттөй алат түйүнүнө.

Тилекке каршы, кырдаалдан чыгуунун жолдору көп эмес:

  1. Docker реестриңизди түздөн-түз кластерде же түздөн-түз кластер менен бирге колдонууга аракет кылыңыз (мисалы, GitLab Registry, Nexus ж.б.);
  2. сыяктуу коммуналдык кызматтарды колдонуңуз Kraken.

Окуя 5. Эс тутумдун жетишсиздигинен түйүндөр илинип турат

Ар кандай тиркемелерди иштетүү учурунда биз түйүн толугу менен жеткиликтүү болбой калган кырдаалга туш болдук: SSH жооп бербейт, бардык мониторинг демондору кулап, андан кийин журналдарда аномалдуу эч нерсе (же дээрлик эч нерсе) жок.

Мен MongoDB иштеген бир түйүндүн мисалында сүрөттөрдө айтып берем.

Төбөсү ушундай көрүнөт үчүн кырсыктар:

Kubernetesтин иштөөсүндөгү 6 көңүл ачуучу тутум мүчүлүштүктөрү [жана аларды чечүү]

Жана ушул сыяктуу - после кырсыктар:

Kubernetesтин иштөөсүндөгү 6 көңүл ачуучу тутум мүчүлүштүктөрү [жана аларды чечүү]

Мониторингде түйүн жеткиликтүү болбой калган кескин секирүү да бар:

Kubernetesтин иштөөсүндөгү 6 көңүл ачуучу тутум мүчүлүштүктөрү [жана аларды чечүү]

Ошентип, скриншоттордон көрүнүп тургандай:

  1. Машинадагы RAM аягына жакын;
  2. RAM керектөөдө кескин секирик бар, андан кийин бүт машинага кирүү кескин өчүрүлөт;
  3. Монгого чоң тапшырма келет, ал DBMS процессин көбүрөөк эстутумду колдонууга жана дисктен активдүү окууга мажбурлайт.

Көрсө, эгер Linux бош эстутуму түгөнүп калса (эс тутумдун басымы орнойт) жана алмаштыруу жок болсо, анда үчүн OOM өлтүргүч келгенде, барактарды барактын кэшине ыргытуу жана аларды кайра дискке жазуу ортосунда тең салмактуулук актысы пайда болушу мүмкүн. Бул кийинки бөлүштүрүү үчүн мүмкүн болушунча көп эстутум баракчаларын кайраттуулук менен бошоткон kswapd тарабынан жасалат.

Тилекке каршы, чоң I/O жүктөмү жана аз сандагы бош эстутум менен, kswapd бүткүл системанын бөксөлүгү болуп калат, анткени алар ага байланган бардык тутумдагы эстутум барактарынын бөлүштүрүлүшү (баракчанын каталары). Бул процесстер эстутумду мындан ары колдонууну каалабай, бирок OOM өлтүргүч туңгуюгунун эң четинде бекитилсе, бул абдан узак убакытка созулушу мүмкүн.

Табигый суроо: эмне үчүн ООМ өлтүргүч мынча кеч келет? Учурдагы итерациясында OOM өлтүргүч өтө акылсыз: ал эстутум барагын бөлүштүрүү аракети ишке ашпай калганда гана процессти өлтүрөт, б.а. барактын катасы иштебей калса. Бул көпкө чейин болбойт, анткени kswapd кайраттуулук менен эстутум барактарын бошотуп, баракчанын кэшин (чындыгында тутумдагы бүткүл диск I/O) кайра дискке таштайт. Көбүрөөк, ядродогу мындай көйгөйлөрдү жоюу үчүн зарыл болгон кадамдардын сүрөттөлүшү менен сиз окуй аласыз бул жерде.

Бул жүрүм-турум жакшыртуу керек Linux ядросу 4.6+ менен.

Окуя 6. Поддор Күтүүдөгү абалда тыгылып калышат

Кээ бир кластерлерде, аларда чындап эле көп сандалып иштейт, биз алардын көпчүлүгү штатта узак убакыт бою "илип" турганын байкай баштадык. Pending, бирок Docker контейнерлери түйүндөрдө иштеп жатат жана аларды кол менен иштесе болот.

Бул учурда, describe туура эмес эч нерсе жок:

  Type    Reason                  Age                From                     Message
  ----    ------                  ----               ----                     -------
  Normal  Scheduled               1m                 default-scheduler        Successfully assigned sphinx-0 to ss-dev-kub07
  Normal  SuccessfulAttachVolume  1m                 attachdetach-controller  AttachVolume.Attach succeeded for volume "pvc-6aaad34f-ad10-11e8-a44c-52540035a73b"
  Normal  SuccessfulMountVolume   1m                 kubelet, ss-dev-kub07    MountVolume.SetUp succeeded for volume "sphinx-config"
  Normal  SuccessfulMountVolume   1m                 kubelet, ss-dev-kub07    MountVolume.SetUp succeeded for volume "default-token-fzcsf"
  Normal  SuccessfulMountVolume   49s (x2 over 51s)  kubelet, ss-dev-kub07    MountVolume.SetUp succeeded for volume "pvc-6aaad34f-ad10-11e8-a44c-52540035a73b"
  Normal  Pulled                  43s                kubelet, ss-dev-kub07    Container image "registry.example.com/infra/sphinx-exporter/sphinx-indexer:v1" already present on machine
  Normal  Created                 43s                kubelet, ss-dev-kub07    Created container
  Normal  Started                 43s                kubelet, ss-dev-kub07    Started container
  Normal  Pulled                  43s                kubelet, ss-dev-kub07    Container image "registry.example.com/infra/sphinx/sphinx:v1" already present on machine
  Normal  Created                 42s                kubelet, ss-dev-kub07    Created container
  Normal  Started                 42s                kubelet, ss-dev-kub07    Started container

Бир аз казып алгандан кийин, биз кубелеттин капкактардын абалы жана жандуу/даярдык тесттери жөнүндө бардык маалыматты API серверине жөнөтүүгө убакыты жок деп божомолдодук.

Жана жардамды изилдегенден кийин, биз төмөнкү параметрлерди таптык:

--kube-api-qps - QPS to use while talking with kubernetes apiserver (default 5)
--kube-api-burst  - Burst to use while talking with kubernetes apiserver (default 10) 
--event-qps - If > 0, limit event creations per second to this value. If 0, unlimited. (default 5)
--event-burst - Maximum size of a bursty event records, temporarily allows event records to burst to this number, while still not exceeding event-qps. Only used if --event-qps > 0 (default 10) 
--registry-qps - If > 0, limit registry pull QPS to this value.
--registry-burst - Maximum size of bursty pulls, temporarily allows pulls to burst to this number, while still not exceeding registry-qps. Only used if --registry-qps > 0 (default 10)

Көрүнүп тургандай, демейки баалуулуктар абдан аз, ал эми 90%да алар бардык муктаждыктарды жабат... Бирок, биздин учурда бул жетишсиз болгон. Ошондуктан, биз төмөнкү баалуулуктарды койду:

--event-qps=30 --event-burst=40 --kube-api-burst=40 --kube-api-qps=30 --registry-qps=30 --registry-burst=40

... жана кубелеттерди кайра иштеттик, андан кийин API серверине чалуулардын графиктеринде төмөнкү сүрөттү көрдүк:

Kubernetesтин иштөөсүндөгү 6 көңүл ачуучу тутум мүчүлүштүктөрү [жана аларды чечүү]

... жана ооба, баары уча баштады!

PS

Мүчүлүштүктөрдү чогултууга жана бул макаланы даярдоого көрсөткөн жардамы үчүн мен биздин компаниянын көптөгөн инженерлерине, өзгөчө биздин R&D тобубуздагы кесиптешим Андрей Климентьевге терең ыраазычылык билдирем.зузалар).

PPS

Биздин блогдон дагы окуңуз:

Source: www.habr.com

Комментарий кошуу