เบˆเบฒเบ algorithms เบเบฑเบšเบกเบฐเป€เบฎเบฑเบ‡: เบเบฒเบ™เบšเบฑเบ™เบเบฒเบเบˆเบฒเบเป‚เบฎเบ‡เบฎเบฝเบ™เบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบš bioinformatics

เบˆเบฒเบ algorithms เบเบฑเบšเบกเบฐเป€เบฎเบฑเบ‡: เบเบฒเบ™เบšเบฑเบ™เบเบฒเบเบˆเบฒเบเป‚เบฎเบ‡เบฎเบฝเบ™เบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบš bioinformaticsเปƒเบ™เบŠเปˆเบงเบ‡เบฅเบถเบฐเป€เบšเบดเปˆเบ‡เบฎเป‰เบญเบ™เบ‚เบญเบ‡ 2018, เป‚เบฎเบ‡เบฎเบฝเบ™ summer เบ›เบฐเบˆเปเบฒเบ›เบตเปƒเบ™ bioinformatics เป„เบ”เป‰เบˆเบฑเบ”เบ‚เบถเป‰เบ™เบขเบนเปˆเปƒเบเป‰เบเบฑเบš St. Petersburg, เบšเปˆเบญเบ™เบ—เบตเปˆ 100 เบ™เบฑเบเบชเบถเบเบชเบฒเบ›เบฐเบฅเบดเบ™เบเบฒเบ•เบตเปเบฅเบฐเบˆเบปเบšเบเบฒเบ™เบชเบถเบเบชเบฒเป„เบ”เป‰เบกเบฒเบชเบถเบเบชเบฒ bioinformatics เปเบฅเบฐเบฎเบฝเบ™เบฎเบนเป‰เบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบšเบเบฒเบ™เบ™เปเบฒเปƒเบŠเป‰เบ‚เบญเบ‡เบ•เบปเบ™เปƒเบ™เบ‚เบปเบ‡เป€เบ‚เบ”เบ•เปˆเบฒเบ‡เป†เบ‚เบญเบ‡เบŠเบตเบงเบฐเบชเบฒเบ”เปเบฅเบฐเบเบฒเบ™เปเบžเบ”.

เป‚เบฎเบ‡เบฎเบฝเบ™เบ•เบปเป‰เบ™เบ•เปเปเบกเปˆเบ™เบชเบธเบกเปƒเบชเปˆเบเบฒเบ™เบ„เบปเป‰เบ™เบ„เบงเป‰เบฒเบกเบฐเป€เบฎเบฑเบ‡, เปเบ•เปˆเบกเบตเบเบฒเบ™เบšเบฑเบ™เบเบฒเบเบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบšเบ‚เบปเบ‡เป€เบ‚เบ”เบญเบทเปˆเบ™เป†เบ‚เบญเบ‡ bioinformatics, เบ™เบฑเบšเบ•เบฑเป‰เบ‡เปเบ•เปˆ evolution เบเบฑเบšเบเบฒเบ™เบงเบดเป€เบ„เบฒเบฐเบ‚เปเป‰เบกเบนเบ™เบเบฒเบ™เบˆเบฑเบ”เบฅเปเบฒเบ”เบฑเบšเบ‚เบญเบ‡เบˆเบธเบฅเบฑเบ‡เบ”เบฝเบง. เปƒเบ™เป„เบฅเบเบฐเบญเบฒเบ—เบดเบ”, guys เป„เบ”เป‰เบฎเบฝเบ™เบฎเบนเป‰เบ—เบตเปˆเบˆเบฐเป€เบฎเบฑเบ”เบงเบฝเบเบเบฑเบšเบ‚เปเป‰เบกเบนเบ™เบฅเปเบฒเบ”เบฑเบšเบเบฒเบ™เบœเบฐเบฅเบดเบ”เบ•เปเปˆเป„เบ›, เบ”เปเบฒเป€เบ™เบตเบ™เป‚เบ„เบ‡เบเบฒเบ™เปƒเบ™ Python เปเบฅเบฐ R, เป„เบ”เป‰เบ™เปเบฒเปƒเบŠเป‰เป€เบ„เบทเปˆเบญเบ‡เบกเบท bioinformatics เบกเบฒเบ”เบ•เบฐเบ–เบฒเบ™เปเบฅเบฐเบเบญเบš, เป„เบ”เป‰เบ„เบธเป‰เบ™เป€เบ„เบตเบเบเบฑเบšเบงเบดเบ—เบตเบเบฒเบ™เบ‚เบญเบ‡เบŠเบตเบงเบฐเบชเบฒเบ”เบฅเบฐเบšเบปเบš, เบžเบฑเบ™เบ—เบธเบเปเบฒเบ›เบฐเบŠเบฒเบเบญเบ™เปเบฅเบฐเบเบฒเบ™เบชเป‰เบฒเบ‡เปเบšเบšเบˆเปเบฒเบฅเบญเบ‡เบขเบฒเปƒเบ™เป€เบงเบฅเบฒเบ—เบตเปˆเบชเบถเบเบชเบฒ tumors, เปเบฅเบฐเบญเบทเปˆเบ™เป†เบญเบตเบ.

เบ‚เป‰เบฒเบ‡เบฅเบธเปˆเบกเบ™เบตเป‰เบ—เปˆเบฒเบ™เบˆเบฐเป€เบซเบฑเบ™เบงเบดเบ”เบตเป‚เบญเบ‚เบญเบ‡ 18 เบเบฒเบ™เบšเบฑเบ™เบเบฒเบเบ—เบตเปˆเปƒเบซเป‰เบขเบนเปˆเปƒเบ™เป‚เบฎเบ‡เบฎเบฝเบ™, เบกเบตเบ„เปเบฒเบญเบฐเบ—เบดเบšเบฒเบเบชเบฑเป‰เบ™เป†เปเบฅเบฐเบชเบฐเป„เบฅเป‰. เบญเบฑเบ™เบ—เบตเปˆเปเบฒเบเบ”เป‰เบงเบเป€เบ„เบทเปˆเบญเบ‡เปเบฒเบเบ”เบฒเบง โ€œ*โ€ เปเบกเปˆเบ™เบ‚เป‰เบญเบ™เบ‚เป‰เบฒเบ‡เบžเบทเป‰เบ™เบ–เบฒเบ™ เปเบฅเบฐเบชเบฒเบกเบฒเบ”เป€เบšเบดเปˆเบ‡เป„เบ”เป‰เป‚เบ”เบเบšเปเปˆเบ•เป‰เบญเบ‡เบเบฝเบกเบ•เบปเบงเบเปˆเบญเบ™.

เบˆเบฒเบ algorithms เบเบฑเบšเบกเบฐเป€เบฎเบฑเบ‡: เบเบฒเบ™เบšเบฑเบ™เบเบฒเบเบˆเบฒเบเป‚เบฎเบ‡เบฎเบฝเบ™เบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบš bioinformatics

1*. Oncogenomics เปเบฅเบฐ oncology เบชเปˆเบงเบ™เบšเบธเบเบ„เบปเบ™ | Mikhail Pyatnitsky, เบชเบฐเบ–เบฒเบšเบฑเบ™เบ„เบปเป‰เบ™เบ„เบงเป‰เบฒเป€เบ„เบกเบตเบŠเบตเบงเบฐเบชเบฒเบ”

เบงเบตโ€‹เบ”เบตโ€‹เป‚เบญ | เบชเบฐเป„เบฅเป‰

Mikhail เป„เบ”เป‰เป€เบงเบปเป‰เบฒเบชเบฑเป‰เบ™เป†เบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบš genomics tumor เปเบฅเบฐเบงเบดเบ—เบตเบเบฒเบ™เป€เบ‚เบปเป‰เบฒเปƒเบˆเบงเบดเบงเบฑเบ”เบ—เบฐเบ™เบฒเบเบฒเบ™เบ‚เบญเบ‡เบˆเบธเบฅเบฑเบ‡เบกเบฐเป€เบฎเบฑเบ‡เบŠเปˆเบงเบเปƒเบซเป‰เบžเบงเบเป€เบฎเบปเบฒเปเบเป‰เป„เบ‚เบšเบฑเบ™เบซเบฒเบเบฒเบ™เบ›เบฐเบ•เบดเบšเบฑเบ”เปƒเบ™ oncology. เบญเบฒเบˆเบฒเบ™เป„เบ”เป‰เป€เบญเบปเบฒเปƒเบˆเปƒเบชเปˆเป€เบ›เบฑเบ™เบžเบดเป€เบชเบ”เปƒเบ™เบเบฒเบ™เบญเบฐเบ—เบดเบšเบฒเบเบ„เบงเบฒเบกเปเบ•เบเบ•เปˆเบฒเบ‡เบฅเบฐเบซเบงเปˆเบฒเบ‡ oncogenes เปเบฅเบฐเบเบฒเบ™เบชเบฐเบเบฑเบ”เบเบฑเป‰เบ™ tumor, เบงเบดเบ—เบตเบเบฒเบ™เบ„เบปเป‰เบ™เบซเบฒ "เป€เบŠเบทเป‰เบญเป‚เบฃเบเบกเบฐเป€เบฎเบฑเบ‡" เปเบฅเบฐเบเบฒเบ™เบเปเบฒเบ™เบปเบ”เบ›เบฐเป€เบžเบ”เบเปˆเบญเบเป‚เบกเป€เบฅเบเบธเบ™เบ‚เบญเบ‡เป€เบ™เบทเป‰เบญเบ‡เบญเบ. เบชเบฐเบซเบผเบธเบšเปเบฅเป‰เบง, Mikhail เป„เบ”เป‰เป€เบญเบปเบฒเปƒเบˆเปƒเบชเปˆเบ•เปเปˆเบญเบฐเบ™เบฒเบ„เบปเบ”เบ‚เบญเบ‡ oncogenomics เปเบฅเบฐเบšเบฑเบ™เบซเบฒเบ—เบตเปˆเบญเบฒเบ”เบˆเบฐเป€เบเบตเบ”เบ‚เบทเป‰เบ™.

เบˆเบฒเบ algorithms เบเบฑเบšเบกเบฐเป€เบฎเบฑเบ‡: เบเบฒเบ™เบšเบฑเบ™เบเบฒเบเบˆเบฒเบเป‚เบฎเบ‡เบฎเบฝเบ™เบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบš bioinformatics

2*. เบเบฒเบ™เบšเบปเปˆเบ‡เบกเบฐเบ•เบดเบ—เบฒเบ‡เบžเบฑเบ™เบ—เบธเบเปเบฒเบ‚เบญเบ‡เป‚เบฃเบ tumor เป€เบŠเบทเป‰เบญเบชเบฒเบ | Andrey Afanasyev, yRisk

เบงเบตโ€‹เบ”เบตโ€‹เป‚เบญ | เบชเบฐเป„เบฅเป‰

Andrey เป€เบงเบปเป‰เบฒเบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบšเป‚เบฃเบ tumor เบ—เบฒเบ‡เบ”เป‰เบฒเบ™เบžเบฑเบ™เบ—เบธเบเปเบฒเปเบฅเบฐเบ›เบถเบเบชเบฒเบซเบฒเบฅเบทเบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบšเบŠเบตเบงเบฐเบงเบดเบ—เบฐเบเบฒ, เบžเบฐเบเบฒเบ”เบฅเบฐเบšเบฒเบ”เปเบฅเบฐเบเบฒเบ™เบชเบฐเปเบ”เบ‡เบญเบญเบเบ—เบฒเบ‡เบ”เป‰เบฒเบ™เบ„เบฅเบตเบ™เบดเบ. เบชเปˆเบงเบ™เบซเบ™เบถเปˆเบ‡เบ‚เบญเบ‡เบเบฒเบ™เบšเบฑเบ™เบเบฒเบเปเบกเปˆเบ™เบญเบธเบ—เบดเบ”เปƒเบซเป‰เบเบฑเบšเบšเบฑเบ™เบซเบฒเบ‚เบญเบ‡เบเบฒเบ™เบ—เบปเบ”เบชเบญเบšเบžเบฑเบ™เบ—เบธเบเปเบฒ - เบœเบนเป‰เบ—เบตเปˆเบˆเปเบฒเป€เบ›เบฑเบ™เบ•เป‰เบญเบ‡เป„เบ”เป‰เบฎเบฑเบšเบกเบฑเบ™, เบชเบดเปˆเบ‡เบ—เบตเปˆเป€เบฎเบฑเบ”เบชเปเบฒเบฅเบฑเบšเบเบฒเบ™เบ™เบตเป‰, เบ„เบงเบฒเบกเบซเบเบธเป‰เบ‡เบเบฒเบเบญเบฑเบ™เปƒเบ”เป€เบเบตเบ”เบ‚เบทเป‰เบ™เปƒเบ™เบเบฒเบ™เบ›เบธเบ‡เปเบ•เปˆเบ‡เบ‚เปเป‰เบกเบนเบ™เปเบฅเบฐเบเบฒเบ™เบ•เบตเบ„เบงเบฒเบกเบซเบกเบฒเบเบœเบปเบ™เป„เบ”เป‰เบฎเบฑเบš, เปเบฅเบฐเบชเบธเบ”เบ—เป‰เบฒเบ, เบœเบปเบ™เบ›เบฐเป‚เบซเบเบ”เบ‚เบญเบ‡เบ„เบปเบ™เป€เบˆเบฑเบšเปเบฅเบฐเบเบฒเบ”เบžเบตเปˆเบ™เป‰เบญเบ‡เบ‚เบญเบ‡เบžเบงเบเป€เบ‚เบปเบฒเปเบกเปˆเบ™เบซเบเบฑเบ‡. .

เบˆเบฒเบ algorithms เบเบฑเบšเบกเบฐเป€เบฎเบฑเบ‡: เบเบฒเบ™เบšเบฑเบ™เบเบฒเบเบˆเบฒเบเป‚เบฎเบ‡เบฎเบฝเบ™เบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบš bioinformatics

3*. The Pan-Cancer Atlas | เป€เบขเบเบฅเบฐเบกเบฑเบ™ Demidov, BIST/UPF

เบงเบตโ€‹เบ”เบตโ€‹เป‚เบญ | เบชเบฐเป„เบฅเป‰

เป€เบ–เบดเบ‡เบงเปˆเบฒเบˆเบฐเบกเบตเบเบฒเบ™เบ„เบปเป‰เบ™เบ„เบงเป‰เบฒเบซเบผเบฒเบเบ—เบปเบ”เบชเบฐเบงเบฑเบ”เปƒเบ™เบ‚เบปเบ‡เป€เบ‚เบ”เบ‚เบญเบ‡ genomics เบกเบฐเป€เบฎเบฑเบ‡เปเบฅเบฐ epigenomics, เบ„เปเบฒเบ•เบญเบšเบ‚เบญเบ‡เบ„เปเบฒเบ–เบฒเบก "เบงเบดเบ—เบตเบเบฒเบ™, เบšเปˆเบญเบ™เปƒเบ”เปเบฅเบฐเป€เบ›เบฑเบ™เบซเบเบฑเบ‡เป‚เบฃเบ tumor เป€เบเบตเบ”เบ‚เบทเป‰เบ™" เบเบฑเบ‡เบšเปเปˆเบ„เบปเบšเบ–เป‰เบงเบ™. เป€เบซเบ”เบœเบปเบ™เบซเบ™เบถเปˆเบ‡เบชเปเบฒเบฅเบฑเบšเบเบฒเบ™เบ™เบตเป‰เปเบกเปˆเบ™เบ„เบงเบฒเบกเบ•เป‰เบญเบ‡เบเบฒเบ™เบชเปเบฒเบฅเบฑเบšเบเบฒเบ™เป„เบ”เป‰เบฎเบฑเบšเบกเบฒเบ”เบ•เบฐเบ–เบฒเบ™เปเบฅเบฐเบเบฒเบ™เบ›เบธเบ‡เปเบ•เปˆเบ‡เบ‚เปเป‰เบกเบนเบ™เบˆเปเบฒเบ™เบงเบ™เบซเบผเบงเบ‡เบซเบผเบฒเบเป€เบžเบทเปˆเบญเบเบงเบ”เบžเบปเบšเบœเบปเบ™เบเบฐเบ—เบปเบšเบ‚เบญเบ‡เบ‚เบฐเบซเบ™เบฒเบ”เบ‚เบฐเบซเบ™เบฒเบ”เบ™เป‰เบญเบเบ—เบตเปˆเบเบฒเบเบ—เบตเปˆเบˆเบฐเบเบงเบ”เบžเบปเบšเปƒเบ™เบŠเบธเบ”เบ‚เปเป‰เบกเบนเบ™เบˆเปเบฒเบเบฑเบ” (เบ‚เบฐเบซเบ™เบฒเบ”เบ—เบตเปˆเบ›เบปเบเบเบฐเบ•เบดเบชเปเบฒเบฅเบฑเบšเบเบฒเบ™เบชเบถเบเบชเบฒเบžเบฒเบเปƒเบ™เบซเบ™เบถเปˆเบ‡เบซเบผเบทเบซเบผเบฒเบเบซเป‰เบญเบ‡เบ—เบปเบ”เบฅเบญเบ‡) , เปเบ•เปˆเบงเปˆเบฒเปƒเบ™เบˆเปเบฒเบ™เบงเบ™เบฅเบงเบกเบกเบตเบšเบปเบ”เบšเบฒเบ”เบชเปเบฒเบ„เบฑเบ™เบกเบตเบšเบปเบ”เบšเบฒเบ”เบญเบฑเบ™เปƒเบซเบเปˆเบซเบผเบงเบ‡เปƒเบ™เบžเบฐเบเบฒเบ”เบ—เบตเปˆเบชเบฐเบฅเบฑเบšเบชเบฑเบšเบŠเป‰เบญเบ™เปเบฅเบฐ multifactorial เป€เบŠเบฑเปˆเบ™เบกเบฐเป€เบฎเบฑเบ‡.

เปƒเบ™เบŠเบธเบกเบ›เบตเบกเปเปˆเป†เบกเบฒเบ™เบตเป‰, เบซเบผเบฒเบเบเบธเปˆเบกเบ„เบปเป‰เบ™เบ„เป‰เบงเบฒเบ—เบตเปˆเบกเบตเบญเปเบฒเบ™เบฒเบ”เบ—เบตเปˆเบชเบธเบ”เบ‚เบญเบ‡เป‚เบฅเบ, เบฎเบฑเบšเบฎเบนเป‰เบšเบฑเบ™เบซเบฒเบ™เบตเป‰, เป„เบ”เป‰เป€เบฅเบตเปˆเบกเป€เบ‚เบปเป‰เบฒเบฎเปˆเบงเบกเบเปเบฒเบฅเบฑเบ‡เปƒเบ™เบ„เบงเบฒเบกเบžเบฐเบเบฒเบเบฒเบกเบ—เบตเปˆเบˆเบฐเบเบงเบ”เบžเบปเบšเปเบฅเบฐเบญเบฐเบ—เบดเบšเบฒเบเบœเบปเบ™เบเบฐเบ—เบปเบšเบ—เบฑเบ‡เบซเบกเบปเบ”เป€เบซเบผเบปเปˆเบฒเบ™เบตเป‰. Herman เป„เบ”เป‰เบเปˆเบฒเบงเป€เบ–เบดเบ‡เบซเบ™เบถเปˆเบ‡เปƒเบ™เบเบฒเบ™เบฅเบดเป€เบฅเบตเปˆเบกเป€เบซเบผเบปเปˆเบฒเบ™เบตเป‰ (The PanCancer Atlas) เปเบฅเบฐเบœเบปเบ™เป„เบ”เป‰เบฎเบฑเบšเบ—เบตเปˆเป„เบ”เป‰เบฎเบฑเบšเป€เบ›เบฑเบ™เบชเปˆเบงเบ™เบซเบ™เบถเปˆเบ‡เบ‚เบญเบ‡เบเบฒเบ™เป€เบฎเบฑเบ”เบงเบฝเบเบ‚เบญเบ‡เบซเป‰เบญเบ‡เบ—เบปเบ”เบฅเบญเบ‡เบ‚เบญเบ‡เบชเบฐเบกเบฒเบ„เบปเบกเบ™เบตเป‰เปเบฅเบฐเบˆเบฑเบ”เบžเบตเบกเบกเบฒเบขเบนเปˆเปƒเบ™เบชเบฐเบšเบฑเบšเบžเบดเป€เบชเบ”เบ‚เบญเบ‡ Cell เปƒเบ™เบเบฒเบ™เบšเบฑเบ™เบเบฒเบเบ™เบตเป‰.

เบˆเบฒเบ algorithms เบเบฑเบšเบกเบฐเป€เบฎเบฑเบ‡: เบเบฒเบ™เบšเบฑเบ™เบเบฒเบเบˆเบฒเบเป‚เบฎเบ‡เบฎเบฝเบ™เบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบš bioinformatics

4. Chip-Seq เปƒเบ™เบเบฒเบ™เบชเบถเบเบชเบฒเบเบปเบ™เป„เบเบเบฒเบ™ epigenetic | Oleg Shpynov, เบเบฒเบ™เบ„เบปเป‰เบ™เบ„เบงเป‰เบฒ JetBrains

เบงเบตโ€‹เบ”เบตโ€‹เป‚เบญ | เบชเบฐเป„เบฅเป‰

เบเบปเบ”เบฅเบฐเบšเบฝเบšเบเบฒเบ™เบชเบฐเปเบ”เบ‡เบญเบญเบเบ‚เบญเบ‡ gene เปเบกเปˆเบ™เบ”เปเบฒเป€เบ™เบตเบ™เปƒเบ™เบ—เบฒเบ‡เบ—เบตเปˆเปเบ•เบเบ•เปˆเบฒเบ‡เบเบฑเบ™. เบขเบนเปˆเบ—เบตเปˆเบเบฒเบ™เบšเบฑเบ™เบเบฒเบเบ‚เบญเบ‡เบฅเบฒเบง, Oleg เป€เบงเบปเป‰เบฒเบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบšเบเบปเบ”เบฅเบฐเบšเบฝเบšเบ‚เบญเบ‡ epigenetic เป‚เบ”เบเบœเปˆเบฒเบ™เบเบฒเบ™เบ›เปˆเบฝเบ™เปเบ›เบ‡เบ‚เบญเบ‡ histone, เบเบฒเบ™เบชเบถเบเบชเบฒเบ‚เบฐเบšเบงเบ™เบเบฒเบ™เป€เบซเบผเบปเปˆเบฒเบ™เบตเป‰เป‚เบ”เบเปƒเบŠเป‰เบงเบดเบ—เบตเบเบฒเบ™ ChiP-seq เปเบฅเบฐเบงเบดเบ—เบตเบเบฒเบ™เบชเปเบฒเบฅเบฑเบšเบเบฒเบ™เบงเบดเป€เบ„เบฒเบฐเบœเบปเบ™เป„เบ”เป‰เบฎเบฑเบšเบ—เบตเปˆเป„เบ”เป‰เบฎเบฑเบš.

เบˆเบฒเบ algorithms เบเบฑเบšเบกเบฐเป€เบฎเบฑเบ‡: เบเบฒเบ™เบšเบฑเบ™เบเบฒเบเบˆเบฒเบเป‚เบฎเบ‡เบฎเบฝเบ™เบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบš bioinformatics

5. Multiomics เปƒเบ™เบเบฒเบ™เบ„เบปเป‰เบ™เบ„เบงเป‰เบฒเบกเบฐเป€เบฎเบฑเบ‡ | Konstantin Okonechnikov, เบชเบนเบ™เบ„เบปเป‰เบ™เบ„เบงเป‰เบฒเบกเบฐเป€เบฎเบฑเบ‡เป€เบขเบเบฅเบฐเบกเบฑเบ™

เบงเบตโ€‹เบ”เบตโ€‹เป‚เบญ | เบชเบฐเป„เบฅเป‰

เบเบฒเบ™เบžเบฑเบ”เบ—เบฐเบ™เบฒเบ‚เบญเบ‡เป€เบ•เบฑเบเป‚เบ™เป‚เบฅเบŠเบตเบ—เบปเบ”เบฅเบญเบ‡เปƒเบ™เบŠเบตเบงเบฐเบชเบฒเบ”เป‚เบกเป€เบฅเบเบธเบ™เป„เบ”เป‰เป€เบฎเบฑเบ”เปƒเบซเป‰เบกเบฑเบ™เป€เบ›เบฑเบ™เป„เบ›เป„เบ”เป‰เบ—เบตเปˆเบˆเบฐเบชเบปเบกเบ—เบปเบšเบเบฒเบ™เบชเบถเบเบชเบฒเบ‚เบญเบ‡เบฅเบฐเบ”เบฑเบšเบ„เบงเบฒเบกเบเป‰เบงเบฒเบ‡เบ‚เบญเบ‡เบ‚เบฐเบšเบงเบ™เบเบฒเบ™เป€เบฎเบฑเบ”เบงเบฝเบเบขเบนเปˆเปƒเบ™เบˆเบธเบฅเบฑเบ‡, เบญเบฐเป„เบงเบเบฐเบงเบฐเบซเบผเบทเปเบกเป‰เบเบฐเบ—เบฑเป‰เบ‡เบญเบปเบ‡เบเบฒเบ™เบˆเบฑเบ”เบ•เบฑเป‰เบ‡เบ—เบฑเบ‡เบซเบกเบปเบ”. เป€เบžเบทเปˆเบญเบชเป‰เบฒเบ‡เบเบฒเบ™เป€เบŠเบทเปˆเบญเบกเบ•เปเปˆเบฅเบฐเบซเบงเปˆเบฒเบ‡เบญเบปเบ‡เบ›เบฐเบเบญเบšเบ‚เบญเบ‡เบ‚เบฐเบšเบงเบ™เบเบฒเบ™เบ—เบฒเบ‡เบŠเบตเบงเบฐเบžเบฒเบš, เบกเบฑเบ™เบˆเปเบฒเป€เบ›เบฑเบ™เบ•เป‰เบญเบ‡เปƒเบŠเป‰ multiomics, เป€เบŠเบดเปˆเบ‡เบฅเบงเบกเบ‚เปเป‰เบกเบนเบ™เบเบฒเบ™เบ—เบปเบ”เบฅเบญเบ‡เบ‚เบฐเบซเบ™เบฒเบ”เปƒเบซเบเปˆเบˆเบฒเบ genomics, transcriptomics, epigenomics เปเบฅเบฐ proteomics. Konstantin เป„เบ”เป‰เปƒเบซเป‰เบ•เบปเบงเบขเปˆเบฒเบ‡เบ—เบตเปˆเบŠเบฑเบ”เป€เบˆเบ™เบ‚เบญเบ‡เบเบฒเบ™เบ™เปเบฒเปƒเบŠเป‰ multi-omics เปƒเบ™เบ‚เบปเบ‡เป€เบ‚เบ”เบเบฒเบ™เบ„เบปเป‰เบ™เบ„เบงเป‰เบฒเบกเบฐเป€เบฎเบฑเบ‡เป‚เบ”เบเบชเบธเบกเปƒเบชเปˆเบเบฒเบ™ oncology เป€เบ”เบฑเบ.

6. Versatility เปเบฅเบฐเบ‚เปเป‰เบˆเปเบฒเบเบฑเบ”เบ‚เบญเบ‡เบเบฒเบ™เบงเบดเป€เบ„เบฒเบฐเบˆเบธเบฅเบฑเบ‡เบ”เบฝเบง | Konstantin Okonechnikov

เบงเบตโ€‹เบ”เบตโ€‹เป‚เบญ | เบชเบฐเป„เบฅเป‰

เบเบฒเบ™เบšเบฑเบ™เบเบฒเบเบฅเบฒเบเบฅเบฐเบญเบฝเบ”เป€เบžเบตเปˆเบกเป€เบ•เบตเบกเบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบš RNA-seq เป€เบŠเบ™เบ”เบฝเบงเปเบฅเบฐเบงเบดเบ—เบตเบเบฒเบ™เบชเปเบฒเบฅเบฑเบšเบเบฒเบ™เบงเบดเป€เบ„เบฒเบฐเบ‚เปเป‰เบกเบนเบ™เบ™เบตเป‰, เป€เบŠเบฑเปˆเบ™เบ”เบฝเบงเบเบฑเบ™เบเบฑเบšเบงเบดเบ—เบตเบเบฒเบ™เบ—เบตเปˆเบˆเบฐเป€เบญเบปเบฒเบŠเบฐเบ™เบฐเบšเบฑเบ™เบซเบฒเบ—เบตเปˆเบŠเบฑเบ”เป€เบˆเบ™เปเบฅเบฐเป€เบŠเบทเปˆเบญเบ‡เป„เบงเป‰เปƒเบ™เป€เบงเบฅเบฒเบ—เบตเปˆเบชเบถเบเบชเบฒเบžเบงเบเบกเบฑเบ™.

เบˆเบฒเบ algorithms เบเบฑเบšเบกเบฐเป€เบฎเบฑเบ‡: เบเบฒเบ™เบšเบฑเบ™เบเบฒเบเบˆเบฒเบเป‚เบฎเบ‡เบฎเบฝเบ™เบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบš bioinformatics

7. เบเบฒเบ™เบงเบดเป€เบ„เบฒเบฐเบ‚เปเป‰เบกเบนเบ™ RNA-seq เป€เบŠเบ™เบ”เบฝเบง | Konstantin Zaitsev, เบกเบฐเบซเบฒเบงเบดเบ—เบฐเบเบฒเป„เบฅ Washington เปƒเบ™ St

เบงเบตโ€‹เบ”เบตโ€‹เป‚เบญ | เบชเบฐเป„เบฅเป‰

เบเบฒเบ™เบšเบฑเบ™เบเบฒเบเป€เบšเบทเป‰เบญเบ‡เบ•เบปเป‰เบ™เบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบšเบเบฒเบ™เบˆเบฑเบ”เบฅเปเบฒเบ”เบฑเบšเป€เบŠเบฅเบ”เบฝเบง. Konstantin เบ›เบถเบเบชเบฒเบซเบฒเบฅเบทเบงเบดเบ—เบตเบเบฒเบ™เบˆเบฑเบ”เบฅเปเบฒเบ”เบฑเบš, เบ„เบงเบฒเบกเบซเบเบธเป‰เบ‡เบเบฒเบเปƒเบ™เบเบฒเบ™เป€เบฎเบฑเบ”เบงเบฝเบเปƒเบ™เบซเป‰เบญเบ‡เบ—เบปเบ”เบฅเบญเบ‡เปเบฅเบฐเบเบฒเบ™เบงเบดเป€เบ„เบฒเบฐ bioinformatics, เปเบฅเบฐเบงเบดเบ—เบตเบเบฒเบ™เป€เบžเบทเปˆเบญเป€เบญเบปเบฒเบŠเบฐเบ™เบฐเบžเบงเบเบกเบฑเบ™.

เบˆเบฒเบ algorithms เบเบฑเบšเบกเบฐเป€เบฎเบฑเบ‡: เบเบฒเบ™เบšเบฑเบ™เบเบฒเบเบˆเบฒเบเป‚เบฎเบ‡เบฎเบฝเบ™เบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบš bioinformatics

8. เบเบฒเบ™เบงเบดเบ™เบดเบ”เป„เบชเบ‚เบญเบ‡เบžเบฐเบเบฒเบ”เบเป‰เบฒเบกเป€เบ™เบทเป‰เบญเบญเบฑเบเป€เบชเบšเป‚เบ”เบเปƒเบŠเป‰ nanopore sequencing | Pavel Avdeev, เบกเบฐเบซเบฒเบงเบดเบ—เบฐเบเบฒเป„เบฅ George Washington

เบงเบตโ€‹เบ”เบตโ€‹เป‚เบญ | เบชเบฐเป„เบฅเป‰

เบเบฒเบ™เบˆเบฑเบ”เบฅเปเบฒเบ”เบฑเบšเป‚เบ”เบเปƒเบŠเป‰เป€เบ—เบเป‚เบ™เป‚เบฅเบเบต Oxford Nanopore เบกเบตเบ‚เปเป‰เบ”เบตเบ—เบตเปˆเบชเบฒเบกเบฒเบ”เบ™เปเบฒเปƒเบŠเป‰เป€เบžเบทเปˆเบญเบเปเบฒเบ™เบปเบ”เบชเบฒเป€เบซเบ”เบ—เบฒเบ‡เบžเบฑเบ™เบ—เบธเบเปเบฒเบ‚เบญเบ‡เบžเบฐเบเบฒเบ”เบ•เปˆเบฒเบ‡เป†เป€เบŠเบฑเปˆเบ™: dystrophy เบเป‰เบฒเบกเป€เบ™เบทเป‰เบญ. เปƒเบ™เบเบฒเบ™เบšเบฑเบ™เบเบฒเบเบ‚เบญเบ‡เบฅเบฒเบง, Pavel เป€เบงเบปเป‰เบฒเบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบšเบเบฒเบ™เบžเบฑเบ”เบ—เบฐเบ™เบฒเบ—เปเปˆเบชเปเบฒเบฅเบฑเบšเบเบฒเบ™เบงเบดเบ™เบดเบ”เป„เบชเบžเบฐเบเบฒเบ”เบ™เบตเป‰.

เบˆเบฒเบ algorithms เบเบฑเบšเบกเบฐเป€เบฎเบฑเบ‡: เบเบฒเบ™เบšเบฑเบ™เบเบฒเบเบˆเบฒเบเป‚เบฎเบ‡เบฎเบฝเบ™เบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบš bioinformatics

9*. เบเบฒเบ™เบชเบฐเปเบ”เบ‡เบเบฃเบฒเบšเบ‚เบญเบ‡ genome | Ilya Minkin, เบกเบฐเบซเบฒเบงเบดเบ—เบฐเบเบฒเป„เบฅเบฅเบฑเบ” Pennsylvania

เบงเบตโ€‹เบ”เบตโ€‹เป‚เบญ | เบชเบฐเป„เบฅเป‰

เบฎเบนเบšเปเบšเบšเบเบฒเบŸเบญเบฐเบ™เบธเบเบฒเบ”เปƒเบซเป‰เบชเบฐเปเบ”เบ‡เบ•เบปเบงเปเบšเบšเบซเบ™เบฒเปเบซเบ™เป‰เบ™เบ‚เบญเบ‡เบˆเปเบฒเบ™เบงเบ™เบฅเปเบฒเบ”เบฑเบšเบ—เบตเปˆเบ„เป‰เบฒเบเบ„เบทเบเบฑเบ™เปเบฅเบฐเบกเบฑเบเบˆเบฐเบ–เบทเบเบ™เปเบฒเปƒเบŠเป‰เปƒเบ™ genomics. Ilya เป„เบ”เป‰เป€เบงเบปเป‰เบฒเบขเปˆเบฒเบ‡เบฅเบฐเบญเบฝเบ”เบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบšเบงเบดเบ—เบตเบเบฒเบ™เบชเป‰เบฒเบ‡เบฅเปเบฒเบ”เบฑเบš genomic เป‚เบ”เบเปƒเบŠเป‰เบเบฒเบŸ, เบงเบดเบ—เบตเบเบฒเบ™เปเบฅเบฐเป€เบซเบ”เบœเบปเบ™เบ—เบตเปˆเปƒเบŠเป‰เบเบฒเบŸ de Bruin, เบงเบดเบ—เบตเบเบฒเบ™ "เบเบฒเบŸ" เบ”เบฑเปˆเบ‡เบเปˆเบฒเบงเป€เบžเบตเปˆเบกเบ„เบงเบฒเบกเบ–เบทเบเบ•เป‰เบญเบ‡เบ‚เบญเบ‡เบเบฒเบ™เบ„เบปเป‰เบ™เบซเบฒเบเบฒเบ™เบเบฒเบเบžเบฑเบ™, เปเบฅเบฐเบšเบฑเบ™เบซเบฒเบ—เบตเปˆเบšเปเปˆเป„เบ”เป‰เบฎเบฑเบšเบเบฒเบ™เปเบเป‰เป„เบ‚เบเบฑเบšเบเบฒเบ™เบ™เปเบฒเปƒเบŠเป‰เบเบฒเบŸเบเบฑเบ‡เบ„เบปเบ‡เบขเบนเปˆ.

เบˆเบฒเบ algorithms เบเบฑเบšเบกเบฐเป€เบฎเบฑเบ‡: เบเบฒเบ™เบšเบฑเบ™เบเบฒเบเบˆเบฒเบเป‚เบฎเบ‡เบฎเบฝเบ™เบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบš bioinformatics

10*. เบšเบฑเบ™เป€เบ—เบดเบ‡ proteomics | Pavel Sinitsyn, Max Planck เบชเบฐเบ–เบฒเบšเบฑเบ™เบŠเบตเบงเบฐเป€เบ„เบกเบต (2 เบžเบฒเบ)

เบงเบดเบ”เบตเป‚เบญ 1, เบงเบดเบ”เบตเป‚เบญ 2 |เบชเบฐเป„เบฅเป‰ 1, เบชเบฐเป„เบฅเป‰ 2

เบ—เบฒเบ”เป‚เบ›เบผเบ•เบตเบ™เปเบกเปˆเบ™เบฎเบฑเบšเบœเบดเบ”เบŠเบญเบšเบชเปเบฒเบฅเบฑเบšเบ‚เบฐเบšเบงเบ™เบเบฒเบ™เบ—เบฒเบ‡เบŠเบตเบงเบฐเป€เบ„เบกเบตเบชเปˆเบงเบ™เปƒเบซเบเปˆเปƒเบ™เบชเบดเปˆเบ‡เบกเบตเบŠเบตเบงเบดเบ”, เปเบฅเบฐเบกเบฒเบฎเบญเบ”เบ›เบฑเบ”เบˆเบธเบšเบฑเบ™ proteomics เปเบกเปˆเบ™เบงเบดเบ—เบตเบ”เบฝเบงเบชเปเบฒเบฅเบฑเบšเบเบฒเบ™เบงเบดเป€เบ„เบฒเบฐเบ—เบปเปˆเบงเป‚เบฅเบเบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบšเบชเบฐเบžเบฒเบšเบ‚เบญเบ‡เบ—เบฒเบ”เป‚เบ›เบผเบ•เบตเบ™เบซเบผเบฒเบเบžเบฑเบ™เบ„เบปเบ™เปƒเบ™เป€เบงเบฅเบฒเบ”เบฝเบงเบเบฑเบ™. เบฅเบฐเบ”เบฑเบšเบ‚เบญเบ‡เบšเบฑเบ™เบซเบฒเบ—เบตเปˆเบ–เบทเบเปเบเป‰เป„เบ‚เปเบกเปˆเบ™เบซเบ™เป‰เบฒเบ›เบฐเบ—เบฑเบšเปƒเบˆ - เบˆเบฒเบเบเบฒเบ™เบเปเบฒเบ™เบปเบ”เบžเบนเบกเบ•เป‰เบฒเบ™เบ—เบฒเบ™เปเบฅเบฐ antigens เป€เบžเบทเปˆเบญเบเปเบฒเบ™เบปเบ”เบ—เป‰เบญเบ‡เบ–เบดเปˆเบ™เบ‚เบญเบ‡เบ—เบฒเบ”เป‚เบ›เบผเบ•เบตเบ™เบซเบผเบฒเบเบžเบฑเบ™. เปƒเบ™เบเบฒเบ™เบšเบฑเบ™เบเบฒเบเบ‚เบญเบ‡เบฅเบฒเบง, Pavel เป€เบงเบปเป‰เบฒเบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบšเบเบฒเบ™เป€เบซเบผเบปเปˆเบฒเบ™เบตเป‰เปเบฅเบฐเบ„เปเบฒเบฎเป‰เบญเบ‡เบชเบฐเบซเบกเบฑเบเบญเบทเปˆเบ™เป†เบ‚เบญเบ‡ proteomics, เบเบฒเบ™เบžเบฑเบ”เบ—เบฐเบ™เบฒเปƒเบ™เบ›เบฐเบˆเบธเบšเบฑเบ™เปเบฅเบฐเบ„เบงเบฒเบกเบœเบดเบ”เบžเบฒเบ”เปƒเบ™เบเบฒเบ™เบงเบดเป€เบ„เบฒเบฐเบ‚เปเป‰เบกเบนเบ™.

เบˆเบฒเบ algorithms เบเบฑเบšเบกเบฐเป€เบฎเบฑเบ‡: เบเบฒเบ™เบšเบฑเบ™เบเบฒเบเบˆเบฒเบเป‚เบฎเบ‡เบฎเบฝเบ™เบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบš bioinformatics

เบชเบดเบšเป€เบญเบฑเบ”*. เบซเบผเบฑเบเบเบฒเบ™เบžเบทเป‰เบ™เบ–เบฒเบ™เบ‚เบญเบ‡เบเบฒเบ™เบˆเปเบฒเบฅเบญเบ‡เป‚เบกเป€เบฅเบเบธเบ™ | Pavel Yakovlev, BIOCAD

เบงเบตโ€‹เบ”เบตโ€‹เป‚เบญ | เบชเบฐเป„เบฅเป‰

เบšเบปเบ”เบšเบฑเบ™เบเบฒเบเบ—เบดเบ”เบชเบฐเบ”เบตเป€เบšเบทเป‰เบญเบ‡เบ•เบปเป‰เบ™เบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบšเบเบฒเบ™เป€เบ„เบทเปˆเบญเบ™เป„เบซเบงเบ‚เบญเบ‡เป‚เบกเป€เบฅเบเบธเบ™: เป€เบ›เบฑเบ™เบซเบเบฑเบ‡เบกเบฑเบ™เบˆเบถเปˆเบ‡เบˆเปเบฒเป€เบ›เบฑเบ™, เบกเบฑเบ™เป€เบฎเบฑเบ”เปเบ™เบงเปƒเบ”เปเบฅเบฐเบงเบดเบ—เบตเบเบฒเบ™เบ™เปเบฒเปƒเบŠเป‰เปƒเบ™เบเบฒเบ™เบžเบฑเบ”เบ—เบฐเบ™เบฒเบขเบฒ. Pavel เป€เบญเบปเบฒเปƒเบˆเปƒเบชเปˆเบเบฑเบšเบงเบดเบ—เบตเบเบฒเบ™เบ‚เบญเบ‡เบเบฒเบ™เป€เบ„เบทเปˆเบญเบ™เป„เบซเบงเป‚เบกเป€เบฅเบเบธเบ™, เบ„เปเบฒเบญเบฐเบ—เบดเบšเบฒเบเบ‚เบญเบ‡เบเปเบฒเบฅเบฑเบ‡เป‚เบกเป€เบฅเบเบธเบ™, เบฅเบฒเบเบฅเบฐเบญเบฝเบ”เบ‚เบญเบ‡เบเบฒเบ™เป€เบŠเบทเปˆเบญเบกเบ•เปเปˆ, เปเบ™เบงเบ„เบงเบฒเบกเบ„เบดเบ”เบ‚เบญเบ‡ "เบžเบฒเบเบชเบฐเบซเบ™เบฒเบกเบœเบปเบ™เบšเบฑเบ‡เบ„เบฑเบšเปƒเบŠเป‰" เปเบฅเบฐ "เบเบฒเบ™เป€เบŠเบทเปˆเบญเบกเป‚เบเบ‡", เบ‚เปเป‰เบˆเปเบฒเบเบฑเบ”เปƒเบ™เปเบšเบšเบˆเปเบฒเบฅเบญเบ‡, เปเบฅเบฐเบญเบทเปˆเบ™เป†.

เบˆเบฒเบ algorithms เบเบฑเบšเบกเบฐเป€เบฎเบฑเบ‡: เบเบฒเบ™เบšเบฑเบ™เบเบฒเบเบˆเบฒเบเป‚เบฎเบ‡เบฎเบฝเบ™เบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบš bioinformatics

12*. เบŠเบตเบงเบฐเบงเบดเบ—เบฐเบเบฒเป‚เบกเป€เบฅเบเบธเบ™ เปเบฅเบฐเบžเบฑเบ™เบ—เบธเบเปเบฒ | Yuri Barbitov, เบชเบฐเบ–เบฒเบšเบฑเบ™ Bioinformatics

เบงเบดเบ”เบตเป‚เบญ 1, เบงเบดเบ”เบตเป‚เบญ 2, เบงเบดเบ”เบตเป‚เบญ 3 | เบชเบฐเป„เบฅเป‰

เบเบฒเบ™เปเบ™เบฐเบ™เปเบฒเบชเบฒเบกเบžเบฒเบเบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบšเบŠเบตเบงเบฐเบชเบฒเบ”เป‚เบกเป€เบฅเบเบธเบ™ เปเบฅเบฐเบžเบฑเบ™เบ—เบธเบเปเบฒเบชเปเบฒเบฅเบฑเบšเบ™เบฑเบเบชเบถเบเบชเบฒเบงเบดเบชเบฐเบงเบฐเบเปเบฒ เปเบฅเบฐเบˆเบปเบšเบเบฒเบ™เบชเบถเบเบชเบฒ. เบเบฒเบ™เบšเบฑเบ™เบเบฒเบเบ„เบฑเป‰เบ‡เบ—เปเบฒเบญเบดเบ”เบชเบปเบ™เบ—เบฐเบ™เบฒเบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบšเปเบ™เบงเบ„เบงเบฒเบกเบ„เบดเบ”เบ‚เบญเบ‡เบŠเบตเบงเบฐเบชเบฒเบ”เบ—เบตเปˆเบ—เบฑเบ™เบชเบฐเป„เบซเบก, เบšเบฑเบ™เบซเบฒเบ‚เบญเบ‡เป‚เบ„เบ‡เบชเป‰เบฒเบ‡ genome เปเบฅเบฐเบเบฒเบ™เบ›เบฐเบเบปเบ”เบ•เบปเบงเบ‚เบญเบ‡เบเบฒเบ™เบเบฒเบเบžเบฑเบ™. เบญเบฑเบ™เบ—เบตเบชเบญเบ‡เบเบงเบกเป€เบญเบปเบฒเบขเปˆเบฒเบ‡เบฅเบฐเบญเบฝเบ”เบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบšเบšเบฑเบ™เบซเบฒเบ‚เบญเบ‡เบเบฒเบ™เป€เบฎเบฑเบ”เบงเบฝเบเบ‚เบญเบ‡ gene, เบ‚เบฐเบšเบงเบ™เบเบฒเบ™เบ–เปˆเบฒเบเบ—เบญเบ”เปเบฅเบฐเบเบฒเบ™เปเบ›เบžเบฒเบชเบฒ, เบ—เบตเบชเบฒเบกเบเบงเบกเป€เบญเบปเบฒเบเบปเบ”เบฅเบฐเบšเบฝเบšเบเบฒเบ™เบชเบฐเปเบ”เบ‡เบญเบญเบเบ‚เบญเบ‡ gene เปเบฅเบฐเบงเบดเบ—เบตเบเบฒเบ™เบŠเบตเบงเบฐเบžเบฒเบšเป‚เบกเป€เบฅเบเบธเบ™เบžเบทเป‰เบ™เบ–เบฒเบ™.

13*. เบซเบผเบฑเบเบเบฒเบ™เบ‚เบญเบ‡เบเบฒเบ™เบงเบดเป€เบ„เบฒเบฐเบ‚เปเป‰เบกเบนเบ™ NGS | Yuri Barbitov, เบชเบฐเบ–เบฒเบšเบฑเบ™ Bioinformatics

เบงเบตโ€‹เบ”เบตโ€‹เป‚เบญ | เบชเบฐเป„เบฅเป‰

เบเบฒเบ™เบšเบฑเบ™เบเบฒเบเบญเบฐเบ—เบดเบšเบฒเบเบงเบดเบ—เบตเบเบฒเบ™เบˆเบฑเบ”เบฅเปเบฒเบ”เบฑเบšเบฅเบธเป‰เบ™เบ—เบตเบชเบญเบ‡ (NGS), เบ›เบฐเป€เบžเบ” เปเบฅเบฐเบ„เบธเบ™เบฅเบฑเบเบชเบฐเบ™เบฐเบ‚เบญเบ‡เบžเบงเบเบกเบฑเบ™. เบญเบฒเบˆเบฒเบ™เบญเบฐเบ—เบดเบšเบฒเบเบขเปˆเบฒเบ‡เบฅเบฐเบญเบฝเบ”เบงเปˆเบฒเบ‚เปเป‰เบกเบนเบ™ "เบœเบปเบ™เบœเบฐเบฅเบดเบ”" เบˆเบฒเบเบฅเปเบฒเบ”เบฑเบšเบกเบตเป‚เบ„เบ‡เบชเป‰เบฒเบ‡เปเบ™เบงเปƒเบ”, เบกเบฑเบ™เบ–เบทเบเปเบ›เบ‡เปเบ™เบงเปƒเบ”เป€เบžเบทเปˆเบญเบงเบดเป€เบ„เบฒเบฐ, เปเบฅเบฐเบงเบดเบ—เบตเบเบฒเบ™เป€เบฎเบฑเบ”เบงเบฝเบเบเบฑเบšเบกเบฑเบ™เปเบกเปˆเบ™เบซเบเบฑเบ‡.

เบˆเบฒเบ algorithms เบเบฑเบšเบกเบฐเป€เบฎเบฑเบ‡: เบเบฒเบ™เบšเบฑเบ™เบเบฒเบเบˆเบฒเบเป‚เบฎเบ‡เบฎเบฝเบ™เบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบš bioinformatics

14*. เบเบฒเบ™เบ™เปเบฒเปƒเบŠเป‰เป€เบชเบฑเป‰เบ™เบ„เปเบฒเบชเบฑเปˆเบ‡, เบเบฒเบ™เบ›เบฐเบ•เบดเบšเบฑเบ” | Gennady Zakharov, EPAM

เบงเบตโ€‹เบ”เบตโ€‹เป‚เบญ

เบžเบฒเบšเบฅเบงเบกเบžเบฒเบเบ›เบฐเบ•เบดเบšเบฑเบ”เบ‚เบญเบ‡เบ„เปเบฒเบชเบฑเปˆเบ‡เป€เบชเบฑเป‰เบ™เบ„เปเบฒเบชเบฑเปˆเบ‡ Linux เบ—เบตเปˆเป€เบ›เบฑเบ™เบ›เบฐเป‚เบซเบเบ”, เบ—เบฒเบ‡เป€เบฅเบทเบญเบเปเบฅเบฐเบžเบทเป‰เบ™เบ–เบฒเบ™เบ‚เบญเบ‡เบเบฒเบ™เบ™เปเบฒเปƒเบŠเป‰เบžเบงเบเบกเบฑเบ™. เบ•เบปเบงเบขเปˆเบฒเบ‡เปเบกเปˆเบ™เบชเบธเบกเปƒเบชเปˆเบเบฒเบ™เบงเบดเป€เบ„เบฒเบฐเบ‚เบญเบ‡เบฅเปเบฒเบ”เบฑเบš DNA เบ—เบตเปˆเบกเบตเบฅเปเบฒเบ”เบฑเบš. เบ™เบญเบเป€เบซเบ™เบทเบญเบˆเบฒเบเบเบฒเบ™เบ”เปเบฒเป€เบ™เบตเบ™เบ‡เบฒเบ™เบ‚เบญเบ‡ Linux เบกเบฒเบ”เบ•เบฐเบ–เบฒเบ™ (เบ•เบปเบงเบขเปˆเบฒเบ‡เป€เบŠเบฑเปˆเบ™ cat, grep, sed, awk), utilities เบชเปเบฒเบฅเบฑเบšเบเบฒเบ™เป€เบฎเบฑเบ”เบงเบฝเบเบเบฑเบšเบฅเปเบฒเบ”เบฑเบš (samtools, bedtools) เปเบกเปˆเบ™เบžเบดเบˆเบฒเบฅเบฐเบ™เบฒ.

เบˆเบฒเบ algorithms เบเบฑเบšเบกเบฐเป€เบฎเบฑเบ‡: เบเบฒเบ™เบšเบฑเบ™เบเบฒเบเบˆเบฒเบเป‚เบฎเบ‡เบฎเบฝเบ™เบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบš bioinformatics

15*. เบเบฒเบ™เป€เบšเบดเปˆเบ‡เป€เบซเบฑเบ™เบ‚เปเป‰เบกเบนเบ™เบชเบณเบฅเบฑเบšเป€เบ”เบฑเบเบ™เป‰เบญเบ | Nikita Alekseev, เบกเบฐเบซเบฒเบงเบดเบ—เบฐเบเบฒเป„เบฅ ITMO

เบงเบตโ€‹เบ”เบตโ€‹เป‚เบญ | เบชเบฐเป„เบฅเป‰

เบšเบธเบเบ„เบปเบ™เบ—เบธเบเบ„เบปเบ™เบกเบตเบ›เบฐเบชเบปเบšเบเบฒเบ™เบชเบฐเปเบ”เบ‡เปƒเบซเป‰เป€เบซเบฑเบ™เบœเบปเบ™เป„เบ”เป‰เบฎเบฑเบšเบ‚เบญเบ‡เบšเบฑเบ™เบ”เบฒเป‚เบ„เบ‡เบเบฒเบ™เบงเบดเบ—เบฐเบเบฒเบชเบฒเบ”เบ‚เบญเบ‡เบ•เบปเบ™เป€เบญเบ‡เบซเบผเบทเบ„เบงเบฒเบกเป€เบ‚เบปเป‰เบฒเปƒเบˆเบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบšเปเบœเบ™เบงเบฒเบ”, เป€เบชเบฑเป‰เบ™เบชเบฐเปเบ”เบ‡เปเบฅเบฐเบฎเบนเบšเบžเบฒเบšเบ‚เบญเบ‡เบ„เบปเบ™เบญเบทเปˆเบ™. Nikita เบšเบญเบเบงเบดเบ—เบตเบเบฒเบ™เบ•เบตเบ„เบงเบฒเบกเบซเบกเบฒเบเบเบฒเบŸเปเบฅเบฐเปเบœเบ™เบงเบฒเบ”เบขเปˆเบฒเบ‡เบ–เบทเบเบ•เป‰เบญเบ‡, เป€เบ™เบฑเป‰เบ™เบซเบ™เบฑเบเป€เบ–เบดเบ‡เบชเบดเปˆเบ‡เบ•เบปเป‰เบ™เบ•เปเบˆเบฒเบเบžเบงเบเบกเบฑเบ™; เบงเบดเบ—เบตเบเบฒเบ™เปเบ•เป‰เบกเบฎเบนเบšเบ—เบตเปˆเบŠเบฑเบ”เป€เบˆเบ™. เบญเบฒเบˆเบฒเบ™เบเบฑเบ‡เป„เบ”เป‰เป€เบ™เบฑเป‰เบ™เปƒเบชเปˆเบชเบดเปˆเบ‡เบ—เบตเปˆเบ•เป‰เบญเบ‡เบŠเบญเบเบซเบฒเปƒเบ™เป€เบงเบฅเบฒเบญเปˆเบฒเบ™เบšเบปเบ”เบ„เบงเบฒเบก เบซเบผเบทเป€เบšเบดเปˆเบ‡เป‚เบ„เบชเบฐเบ™เบฒ.

เบˆเบฒเบ algorithms เบเบฑเบšเบกเบฐเป€เบฎเบฑเบ‡: เบเบฒเบ™เบšเบฑเบ™เบเบฒเบเบˆเบฒเบเป‚เบฎเบ‡เบฎเบฝเบ™เบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบš bioinformatics

16*. เบญเบฒเบŠเบตเบšเปƒเบ™ Bioinformatics | Victoria Korzhova, Max Planck เบชเบฐเบ–เบฒเบšเบฑเบ™เบŠเบตเบงเบฐเป€เบ„เบกเบต

เบงเบดเบ”เบตเป‚เบญ: 1, 2 | เบชเบฐเป„เบฅเป‰

Victoria เป„เบ”เป‰เป€เบงเบปเป‰เบฒเบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบšเป‚เบ„เบ‡เบชเป‰เบฒเบ‡เบ‚เบญเบ‡เบงเบดเบ—เบฐเบเบฒเบชเบฒเบ”เบ—เบฒเบ‡เบงเบดเบŠเบฒเบเบฒเบ™เบขเบนเปˆเบ•เปˆเบฒเบ‡เบ›เบฐเป€เบ—เบ”เปเบฅเบฐเบชเบดเปˆเบ‡เบ—เบตเปˆเบ—เปˆเบฒเบ™เบ•เป‰เบญเบ‡เป€เบญเบปเบฒเปƒเบˆเปƒเบชเปˆเป€เบžเบทเปˆเบญเบชเป‰เบฒเบ‡เบญเบฒเบŠเบตเบšเบงเบดเบ—เบฐเบเบฒเบชเบฒเบ”เบซเบผเบทเบญเบธเบ”เบชเบฒเบซเบฐเบเปเบฒเป€เบ›เบฑเบ™เบ›เบฐเบฅเบดเบ™เบเบฒเบ•เบต, เบˆเบปเบšเบเบฒเบ™เบชเบถเบเบชเบฒเบซเบผเบทเบ™เบฑเบเบชเบถเบเบชเบฒเบˆเบปเบšเบเบฒเบ™เบชเบถเบเบชเบฒ.

17*. เบงเบดเบ—เบตเบเบฒเบ™เบ‚เบฝเบ™ CV เบชเปเบฒเบฅเบฑเบšเบ™เบฑเบเบงเบดเบ—เบฐเบเบฒเบชเบฒเบ” | Victoria Korzhova, Max Planck เบชเบฐเบ–เบฒเบšเบฑเบ™เบŠเบตเบงเบฐเป€เบ„เบกเบต

เบงเบตโ€‹เบ”เบตโ€‹เป‚เบญ

เบชเบดเปˆเบ‡เบ—เบตเปˆเบ„เบงเบ™เบ›เบฐเป„เบงเป‰เปƒเบ™ CV เปเบฅเบฐเบชเบดเปˆเบ‡เบ—เบตเปˆเบˆเบฐเป€เบญเบปเบฒเบญเบญเบ? เบ‚เปเป‰เป€เบ—เบฑเบ”เบˆเบดเบ‡เบญเบฑเบ™เปƒเบ”เบ—เบตเปˆเบˆเบฐเบกเบตเบ„เบงเบฒเบกเบชเบปเบ™เปƒเบˆเบเบฑเบšเบœเบนเป‰เบˆเบฑเบ”เบเบฒเบ™เบซเป‰เบญเบ‡เบ—เบปเบ”เบฅเบญเบ‡เบ—เบตเปˆเบกเบตเบ—เปˆเบฒเปเบฎเบ‡, เปเบฅเบฐเบญเบฑเบ™เปƒเบ”เบ”เบตเบเบงเปˆเบฒเบ—เบตเปˆเบˆเบฐเบšเปเปˆเบเปˆเบฒเบงเป€เบ–เบดเบ‡? เบ—เปˆเบฒเบ™เบ„เบงเบ™เบˆเบฑเบ”เปเบˆเบ‡เบ‚เปเป‰เบกเบนเบ™เปเบ™เบงเปƒเบ”เป€เบžเบทเปˆเบญเป€เบฎเบฑเบ”เปƒเบซเป‰เบŠเบตเบงเบฐเบ›เบฐเบซเบงเบฑเบ”เบ‚เบญเบ‡เบ—เปˆเบฒเบ™เป‚เบ”เบ”เป€เบ”เบฑเปˆเบ™? เบเบฒเบ™เบšเบฑเบ™เบเบฒเบเบˆเบฐเปƒเบซเป‰เบ„เปเบฒเบ•เบญเบšเบ•เปเปˆเบ„เปเบฒเบ–เบฒเบกเป€เบซเบผเบปเปˆเบฒเบ™เบตเป‰เปเบฅเบฐเบ„เปเบฒเบ–เบฒเบกเบญเบทเปˆเบ™เป†.

18*. เบงเบดเบ—เบตเบเบฒเบ™เบ•เบฐเบซเบผเบฒเบ” bioinformatics เป€เบฎเบฑเบ”เบงเบฝเบ | Andrey Afanasyev, yRisk

เบงเบตโ€‹เบ”เบตโ€‹เป‚เบญ | เบชเบฐเป„เบฅเป‰

เบ•เบฐเบซเบผเบฒเบ”เป€เบฎเบฑเบ”เบงเบฝเบเปเบ™เบงเปƒเบ” เปเบฅเบฐเบ™เบฑเบเบŠเบตเบงเบฐเบ‚เปเป‰เบกเบนเบ™เบ‚เปˆเบฒเบงเบชเบฒเบ™เป€เบฎเบฑเบ”เบงเบฝเบเบขเบนเปˆเปƒเบช? เบ„เปเบฒเบ•เบญเบšเบ‚เบญเบ‡เบ„เปเบฒเบ–เบฒเบกเบ™เบตเป‰เปเบกเปˆเบ™เป„เบ”เป‰เบ–เบทเบเบ™เปเบฒเบชเบฐเป€เบซเบ™เบตเบขเปˆเบฒเบ‡เบฅเบฐเบญเบฝเบ”, เบกเบตเบ•เบปเบงเบขเปˆเบฒเบ‡เปเบฅเบฐเบ„เปเบฒเปเบ™เบฐเบ™เปเบฒ, เปƒเบ™เบเบฒเบ™เบšเบฑเบ™เบเบฒเบเบ‚เบญเบ‡ Andrey.

เบ—เบตเปˆเบชเบธเบ”

เบ”เบฑเปˆเบ‡เบ—เบตเปˆเบ—เปˆเบฒเบ™เบญเบฒเบ”เบˆเบฐเป„เบ”เป‰เบชเบฑเบ‡เป€เบเบ”เป€เบซเบฑเบ™, เบเบฒเบ™เบšเบฑเบ™เบเบฒเบเบขเบนเปˆเปƒเบ™เป‚เบฎเบ‡เบฎเบฝเบ™เปเบกเปˆเบ™เบ‚เป‰เบญเบ™เบ‚เป‰เบฒเบ‡เบเบงเป‰เบฒเบ‡เปƒเบ™เบซเบปเบงเบ‚เปเป‰ - เบˆเบฒเบเบเบฒเบ™เบชเป‰เบฒเบ‡เปเบšเบšเบˆเปเบฒเบฅเบญเบ‡เป‚เบกเป€เบฅเบเบธเบ™เปเบฅเบฐเบเบฒเบ™เบ™เปเบฒเปƒเบŠเป‰เบเบฒเบŸเบชเปเบฒเบฅเบฑเบšเบเบฒเบ™เบ›เบฐเบเบญเบš genome, เบเบฒเบ™เบงเบดเป€เบ„เบฒเบฐเบ‚เบญเบ‡เบˆเบธเบฅเบฑเบ‡เบ”เบฝเบงเปเบฅเบฐเบเบฒเบ™เบเปเปˆเบชเป‰เบฒเบ‡เบญเบฒเบŠเบตเบšเบงเบดเบ—เบฐเบเบฒเบชเบฒเบ”. เบžเบงเบเป€เบฎเบปเบฒเบขเบนเปˆเปƒเบ™เบชเบฐเบ–เบฒเบšเบฑเบ™เบŠเบตเบงเบฐเบ‚เปเป‰เบกเบนเบ™เบ‚เปˆเบฒเบงเบชเบฒเบ™เบžเบฐเบเบฒเบเบฒเบกเบฅเบงเบกเป€เบญเบปเบฒเบซเบปเบงเบ‚เปเป‰เบ•เปˆเบฒเบ‡เป†เปƒเบ™เป‚เบ„เบ‡เบเบฒเบ™เป‚เบฎเบ‡เบฎเบฝเบ™เป€เบžเบทเปˆเบญเปƒเบซเป‰เบเบงเบกเป€เบญเบปเบฒเบซเบผเบฒเบเบงเบดเบŠเบฒเบŠเบตเบงเบฐเบงเบดเบ—เบฐเบเบฒเป€เบ—เบปเปˆเบฒเบ—เบตเปˆเป€เบ›เบฑเบ™เป„เบ›เป„เบ”เป‰, เปเบฅเบฐเป€เบžเบทเปˆเบญเปƒเบซเป‰เบœเบนเป‰เป€เบ‚เบปเป‰เบฒเบฎเปˆเบงเบกเปเบ•เปˆเบฅเบฐเบ„เบปเบ™เป„เบ”เป‰เบฎเบฝเบ™เบฎเบนเป‰เบชเบดเปˆเบ‡เปƒเบซเบกเปˆเปเบฅเบฐเป€เบ›เบฑเบ™เบ›เบฐเป‚เบซเบเบ”.

เป‚เบฎเบ‡เบฎเบฝเบ™เบ•เปเปˆเป„เบ›เปƒเบ™ bioinformatics เบˆเบฐเบˆเบฑเบ”เบ‚เบถเป‰เบ™เปƒเบ™เบงเบฑเบ™เบ—เบต 29 เบเปเบฅเบฐเบเบปเบ”เบซเบฒ 3 เบชเบดเบ‡เบซเบฒ 2019 เปƒเบเป‰เบเบฑเบš Moscow. เบเบฒเบ™เบฅเบปเบ‡เบ—เบฐเบšเบฝเบ™เบชเปเบฒเบฅเบฑเบšเป‚เบฎเบ‡เบฎเบฝเบ™ 2019 เปเบกเปˆเบ™เปƒเบ™เบ›เบฑเบ”เบˆเบธเบšเบฑเบ™, เบˆเบปเบ™เบเปˆเบงเบฒ 1 เบžเบถเบ”เบชเบฐเบžเบฒ. เบซเบปเบงเบ‚เปเป‰เบ‚เบญเบ‡เบ›เบตเบ™เบตเป‰เบˆเบฐเป€เบ›เบฑเบ™ bioinformatics เปƒเบ™เบŠเบตเบงเบฐเบชเบฒเบ”เบเบฒเบ™เบžเบฑเบ”เบ—เบฐเบ™เบฒเปเบฅเบฐเบเบฒเบ™เบ„เบปเป‰เบ™เบ„เบงเป‰เบฒเบœเบนเป‰เบชเบนเบ‡เบญเบฒเบเบธ.

เบชเปเบฒเบฅเบฑเบšเบœเบนเป‰เบ—เบตเปˆเบ•เป‰เบญเบ‡เบเบฒเบ™เบชเบถเบเบชเบฒเบŠเบตเบงเบฐเบงเบดเบ—เบฐเบเบฒเปƒเบ™เบ„เบงเบฒเบกเป€เบฅเบดเบ, เบžเบงเบเป€เบฎเบปเบฒเบเบฑเบ‡เบฎเบฑเบšเบ„เปเบฒเบฎเป‰เบญเบ‡เบชเบฐเบซเบกเบฑเบเบ‚เบญเบ‡เบžเบงเบเป€เบฎเบปเบฒ เป‚เบ„เบ‡เบเบฒเบ™เบ›เบฐเบˆเบณเบ›เบตเป€เบ•เบฑเบกเป€เบงเบฅเบฒ เปƒเบ™ St. Petersburg. เบซเบผเบทเบ•เบดเบ”เบ•เบฒเบกเบ‚เปˆเบฒเบงเบ‚เบญเบ‡เบžเบงเบเป€เบฎเบปเบฒเบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบšเบเบฒเบ™เป€เบ›เบตเบ”เป‚เบ„เบ‡เบเบฒเบ™เปƒเบ™ Moscow เปƒเบ™เบฅเบฐเบ”เบนเปƒเบšเป„เบกเป‰เบ›เบปเปˆเบ‡เบ™เบตเป‰.

เบชเปเบฒเบฅเบฑเบšเบœเบนเป‰เบ—เบตเปˆเบšเปเปˆเป„เบ”เป‰เบขเบนเปˆเปƒเบ™ St. Petersburg เบซเบผเบท Moscow, เปเบ•เปˆเบเปเปˆเบ•เป‰เบญเบ‡เบเบฒเบ™เบ—เบตเปˆเบˆเบฐเบเบฒเบเป€เบ›เบฑเบ™ bioinformatician, เบžเบงเบเป€เบฎเบปเบฒเป„เบ”เป‰เบเบฐเบเบฝเบก เบšเบฑเบ™โ€‹เบŠเบตโ€‹เบฅเบฒเบโ€‹เบŠเบทเปˆโ€‹เบ‚เบญเบ‡โ€‹เบซเบ™เบฑเบ‡โ€‹เบชเบทโ€‹เปเบฅเบฐโ€‹เบ›เบถเป‰เบกโ€‹เปเบšเบšโ€‹เบฎเบฝเบ™โ€‹ เปƒเบ™เบชเบนเบ”เบเบฒเบ™เบ„เบดเบ”เป„เบฅเปˆ, เบเบฒเบ™เบ‚เบฝเบ™เป‚เบ›เบฅเปเบเบฅเบก, เบžเบฑเบ™เบ—เบธ เบเบณ เปเบฅเบฐเบŠเบตเบงเบฐเบชเบฒเบ”.

เบžเบงเบเป€เบฎเบปเบฒเบเบฑเบ‡เบกเบตเบซเบฅเบฒเบเบชเบดเบšเบ„เบปเบ™ เป€เบ›เบตเบ”เปเบฅเบฐเบšเปเปˆเป€เบชเบเบ„เปˆเบฒเบซเบผเบฑเบเบชเบนเบ”เบญเบญเบ™เป„เบฅเบ™เปŒเบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบš Stepik, เบ—เบตเปˆเบ—เปˆเบฒเบ™เบชเบฒเบกเบฒเบ”เป€เบฅเบตเปˆเบกเบ•เบปเป‰เบ™เบœเปˆเบฒเบ™เปƒเบ™เบ›เบฑเบ”เบˆเบธเบšเบฑเบ™.

เปƒเบ™เบ›เบต 2018, เป‚เบฎเบ‡เบฎเบฝเบ™ summer เปƒเบ™ bioinformatics เป„เบ”เป‰เบˆเบฑเบ”เบ‚เบถเป‰เบ™เป‚เบ”เบเบเบฒเบ™เบชเบฐเบซเบ™เบฑเบšเบชเบฐเบซเบ™เบนเบ™เบ‚เบญเบ‡เบ„เบนเปˆเบฎเปˆเบงเบกเบ‡เบฒเบ™เบ›เบปเบเบเบฐเบ•เบดเบ‚เบญเบ‡เบžเบงเบเป€เบฎเบปเบฒ - เบšเปเบฅเบดเบชเบฑเบ” JetBrains, BIOCAD เปเบฅเบฐ EPAM, เบ—เบตเปˆเบžเบงเบเป€เบฎเบปเบฒเบ‚เปเบ‚เบญเบšเปƒเบˆเบžเบงเบเป€เบ‚เบปเบฒเบซเบผเบฒเบ.

Bioinformatics เบ—เบธเบเบ„เบปเบ™!

PS เบ–เป‰เบฒเป€เบˆเบปเป‰เบฒเบ„เบดเบ”เบงเปˆเบฒเบกเบฑเบ™เบšเปเปˆเบžเบฝเบ‡เบžเป, เบ™เบตเป‰เปเบกเปˆเบ™เบšเบปเบ”เบ„เบงเบฒเบกเบ—เบตเปˆเบกเบตเบเบฒเบ™เบšเบฑเบ™เบเบฒเบเบˆเบฒเบเป‚เบฎเบ‡เบฎเบฝเบ™เบเปˆเบญเบ™เบชเบธเบ”เบ—เป‰เบฒเบ ะธ เบญเบตเบเบชเบญเบ‡เบชเบฒเบกเป‚เบฎเบ‡เบฎเบฝเบ™เปƒเบ™เบ›เบตเบเปˆเบญเบ™เปœเป‰เบฒเบ™เบตเป‰.

เบˆเบฒเบ algorithms เบเบฑเบšเบกเบฐเป€เบฎเบฑเบ‡: เบเบฒเบ™เบšเบฑเบ™เบเบฒเบเบˆเบฒเบเป‚เบฎเบ‡เบฎเบฝเบ™เบเปˆเบฝเบงเบเบฑเบš bioinformatics

เปเบซเบผเปˆเบ‡เบ‚เปเป‰เบกเบนเบ™: www.habr.com

เป€เบžเบตเปˆเบกเบ„เบงเบฒเบกเบ„เบดเบ”เป€เบซเบฑเบ™