I te raumati o 2018, he kura raumati-a-tau i roto i te bioinformatics i whakahaerehia e tata ana ki St.
Ko te kaupapa matua o te kura ko te rangahau mate pukupuku, engari he kauhau mo etahi atu wahanga o te koiora, mai i te kukuwhatanga ki te tātaritanga o nga raraunga raupapa-a-ira. I roto i te wiki, i ako nga taane ki te mahi me nga raraunga raupapa reanga e whai ake nei, i whakamaheretia i roto i te Python me te R, i whakamahia nga taputapu me nga anga o te koiora paerewa, kua mohio ki nga tikanga o te koiora punaha, te ira taupori me te whakatauira tarukino i te wa e ako ana i nga pukupuku, me te maha atu.
Kei raro iho ka kite koe i tetahi ataata o nga kauhau 18 i tukuna i te kura, me nga korero poto me nga kiriata. Ko nga mea kua tohua ki te whetūriki "*" he tino maamaa, ka taea te maataki me te kore e whakarite i mua.
1*. Oncogenomics and personalized oncology | Mikhail Pyatnitsky, Te Whare Rangahau mo te Matū Hauora
|
I korero poto a Mikhail mo te mate pukupuku pukupuku me te mohio ki te whanaketanga o nga pūtau mate pukupuku e taea ai e tatou te whakaoti rapanga mahi i roto i te oncology. I aro nui te kaikorero ki te whakamaarama i te rereketanga o te oncogenes me te aukati tumo, nga tikanga mo te rapu "ira mate pukupuku" me te tautuhi i nga momo iti ngota o nga pukupuku. I te mutunga, i aro a Mikhail ki te heke mai o te oncogenomics me nga raruraru ka puta ake.
2*. Te tātaritanga ira o nga mate pukupuku mate tuku iho | Andrey Afanasyev, yRisk
|
I korero a Andrey mo nga mate pukupuku tuku iho me te korero mo o raatau koiora, mate urutomo me nga whakaaturanga haumanu. Ko tetahi waahanga o te kauhau e whakatapua ana ki te take o te whakamatautau ira - ko wai e mate, he aha te mahi mo tenei, he aha nga uaua ka puta ki te tukatuka raraunga me te whakamaori i nga hua, a, ka mutu, he aha nga painga ka kawea mai ki nga turoro me o raatau whanaunga .
3*. Te Pan-Cancer Atlas | Tiamana Demidov, BIST/UPF
|
Ahakoa nga tekau tau o te rangahau mo te mate pukupuku mate pukupuku me te epigenomics, ko te whakautu ki te patai "pehea, kei hea me te aha i puta ai nga mate pukupuku pukupuku" kaore ano kia oti. Ko tetahi take mo tenei ko te hiahia mo te whiwhi paerewa me te tukatuka i te nui o nga raraunga kia kitea ai nga paanga o te rahinga iti e uaua ana ki te kitea i roto i te huinga raraunga iti (te rahi e rite ana mo te rangahau i roto i te kotahi, te maha ranei o nga taiwhanga) , engari i roto i te whakahiato ka whai waahi nui ki roto i te mate uaua me te maha o nga take penei i te mate pukupuku.
I nga tau kua pahure ake nei, he maha nga roopu rangahau tino kaha o te ao, e mohio ana ki tenei raruraru, kua timata ki te hono atu ki te ngana ki te kimi me te whakaahua i enei paanga katoa. I korero a Herman mo tetahi o enei kaupapa (Te PanCancer Atlas) me nga hua i puta hei waahanga o nga mahi a tenei roopu o nga taiwhanga me te whakaputa i roto i tetahi putanga motuhake o Cell i tenei kauhau.
4. ChIP-Seq i roto i te ako o nga tikanga epigenetic | Oleg Shpynov, JetBrains Rangahau
|
He rereke nga huarahi e whakahaerea ana te whakahaeretanga o te whakaaturanga ira. I tana korero, i korero a Oleg mo te ture epigenetic na roto i te whakarereketanga histone, te ako o enei tukanga ma te whakamahi i te tikanga ChIP-seq me nga tikanga mo te tarai i nga hua ka puta.
5. Multiomics in Cancer Research | Konstantin Okonechnikov, Te Whare Rangahau Matepukupuku Tiamana
|
Ko te whakawhanaketanga o nga hangarau whakamatautau i roto i te koiora irapoi i taea ai te whakakotahi i te rangahau o te whānuitanga o nga tikanga mahi i roto i nga pūtau, okana, tae noa ki te rauropi katoa. Hei whakapumau i nga hononga i waenga i nga waahanga o nga tukanga koiora, me whakamahi te multiomics, e whakakotahi ana i nga raraunga whakamatautau nui mai i te ira tangata, te transcriptomics, te epigenomics me te proteomics. I whakaatu a Konstantin i nga tauira maamaa mo te whakamahinga o te maha-omics i roto i te mara o te rangahau mate pukupuku me te aro ki te oncology pediatric.
6. Te Taapiritanga me nga Tepe o te Taatari Waea Kotahi | Konstantin Okonechnikov
|
He kauhau mo te RNA-seq me nga tikanga mo te wetewete i enei raraunga, me nga huarahi ki te hinga i nga raru kitea me nga raru huna i te wa e ako ana.
7. Te tātaritanga o nga raraunga RNA-seq pūtau-kotahi | Konstantin Zaitsev, Te Whare Wananga o Washington i St
|
Kauhau whakataki mo te raupapatanga o nga pūtau kotahi. Ka matapaki a Konstantin i nga tikanga raupapa, nga uauatanga i roto i nga mahi taiwhanga me te tātari bioinformatics, me nga huarahi ki te hinga.
8. Te tātaritanga o te mate pukupuku uaua ma te whakamahi i te raupapa nanopore | Pavel Avdeev, Te Whare Wananga o George Washington
|
Ko te raupapa ma te whakamahi i te hangarau Oxford Nanopore he painga ka taea te whakamahi ki te tautuhi i nga take ira o nga mate penei i te uaua uaua. I roto i tana kauhau, i korero a Pavel mo te whanaketanga o te paipa mo te tirotiro i tenei mate.
9*. Whakaaturanga kauwhata o te iraira | Ilya Minkin, Te Whare Wananga o Pennsylvania State
|
Ka taea e nga tauira kauwhata te whakaatu kiato o te maha o nga raupapa rite, ka whakamahia i te nuinga o nga wa i roto i nga tohu-ira. I korero a Ilya i nga korero mo te hanga ano o nga raupapa ira ma te whakamahi i nga kauwhata, me pehea te whakamahi i te kauwhata de Bruin, he pehea te nui o te huarahi "kauwhata" e piki ake ai te tika o nga rapunga rereke, me nga raruraru kaore ano kia whakatauhia mo te whakamahinga o nga kauwhata kei te noho tonu.
10*. proteomics whakangahau | Pavel Sinitsyn, Max Planck Institute of Biochemistry (2 wahanga)
, |,
Ko nga pūmua te kawenga mo te nuinga o nga mahi matū koiora i roto i te rauropi ora, a tae noa ki tenei wa ko te proteomics anake te tikanga mo te tātari i te ao o te ahua o nga mano o nga pūmua i te wa kotahi. He mea whakamīharo te whānuitanga o nga raru kua whakatauhia - mai i te tautuhi i nga paturopi me nga antigens tae noa ki te whakatau i te waahi o te maha mano nga pūmua. I roto i ana korero, i korero a Pavel mo enei me etahi atu tono o te proteomics, tona whanaketanga o naianei me nga mahanga i roto i te tātari raraunga.
tekau ma tahi*. Nga maapono taketake o te whaihanga ngota | Pavel Yakovlev, BIOCAD
|
Ko te kauhau ariā whakataki mo te hihiko ngota: he aha i hiahiatia ai, he aha te mahi me pehea te whakamahi mo te whanaketanga tarukino. I aro atu a Pavel ki nga tikanga o te hihiko ngota, te whakamaarama o nga kaha ngota, te whakaahuatanga o nga hononga, nga ariā o te "papa kaha" me te "whakakotahi", nga herenga ki te whakatauira, me te maha atu.
12*. Koiora Molecular and Genetics | Yuri Barbitov, Institute of Bioinformatics
, , |
He kupu whakataki e toru nga wahanga ki te koiora rapoi me te ira mo nga tauira miihini me nga paetahi. Ko te kauhau tuatahi e matapaki ana i nga ariā o te koiora hou, nga take o te hanganga ira tangata me te puta mai o nga rerekee. Ko te tuarua e hipoki ana i nga korero mo te mahi ira, nga tukanga o te tuhi me te whakamaoritanga, ko te tuatoru e hipoki ana i te whakaritenga o te whakaaturanga ira me nga tikanga koiora taketake.
13*. Nga Maataapono o te Raraunga Raraunga NGS | Yuri Barbitov, Institute of Bioinformatics
|
Ko te kauhau e whakaatu ana i nga tikanga raupapa reanga tuarua (NGS), o raatau momo me o raatau ahuatanga. Ka whakamāramahia e te kaikorero he pehea te hanganga o nga raraunga "putanga" mai i te kaiwhakaraupapa, me pehea te huri mo te tātari, me nga huarahi hei mahi ki a ia.
14*. Ma te whakamahi i te raina whakahau, parakatihi | Gennady Zakharov, EPAM
He tirohanga whanui mo nga whakahau raina whakahau Linux whai hua, nga whiringa me nga tikanga o te whakamahi. Ko nga tauira e aro ana ki te tātaritanga o nga raupapa DNA raupapa. I tua atu i nga mahinga Linux paerewa (hei tauira, cat, grep, sed, awk), ka whakaarohia nga taputapu mo te mahi me nga raupapa (samtools, bedtools).
15*. Whakaaturanga raraunga mo nga tamariki iti | Nikita Alekseev, Te Whare Wananga o ITMO
|
Kua whai wheako nga tangata katoa ki te whakaatu i nga hua o ana ake kaupapa putaiao, ki te mohio ranei ki nga hoahoa, kauwhata me nga pikitia a etahi atu. I korero a Nikita me pehea te whakamaori tika i nga kauwhata me nga hoahoa, me te whakaatu i te mea nui mai i a raatau; me pehea te tuhi pikitia marama. I whakanuia ano e te kaikorero he aha nga mea hei rapu i a koe e panui ana i tetahi tuhinga, e matakitaki ana ranei i tetahi hokohoko.
16*. Nga Mahi i roto i te Bioinformatics | Victoria Korzhova, Max Planck Institute of Biochemistry
Ataata: , |
I korero a Wikitoria mo te hanganga o te puutaiao matauranga ki tawahi me nga mea e tika ana kia aro koe ki te hanga umanga i roto i nga mahi putaiao, ahumahi ranei hei tauira paetahi, paetahi, tauira paetahi ranei.
17*. Me pehea te tuhi CV mo te kaiputaiao | Victoria Korzhova, Max Planck Institute of Biochemistry
He aha te waiho i roto i te CV me te aha hei tango? He aha nga korero ka pai ki te kaiwhakahaere taiwhanga ka taea, a ko tehea te mea pai kia kaua e whakahua? Me pehea e whakarite ai koe i nga korero kia tu ai to reanga hou? Ka whakautua e te kauhau enei me etahi atu patai.
18*. Me pehea te mahi a te maakete bioinformatics | Andrey Afanasyev, yRisk
|
He pehea te mahi a te maakete me te waahi ka taea e te tohunga koiora te mahi? Ko te whakautu ki tenei patai ka whakaatuhia i roto i nga korero, me nga tauira me nga tohutohu, i roto i te korero a Andrey.
Ko te Whakamutunga
Kua kite pea koe, he tino whanui nga korero o te kura - mai i te whakatauira irapo me te whakamahi kauwhata mo te huihuinga ira tangata, tae atu ki te tātaritanga o nga pūtau kotahi me te hanga umanga putaiao. Ko matou o te Institute of Bioinformatics e ngana ana ki te whakauru i nga momo kaupapa i roto i te kaupapa o te kura kia kapi ai nga marautanga bioinformatics ka taea, kia akohia e ia kaiuru tetahi mea hou me te whai hua.
Ko te kura e whai ake nei i roto i te bioinformatics ka whakahaerehia mai i te 29 o Hurae ki te 3 o Akuhata 2019 e tata ana ki Moscow. . Ko te kaupapa o tenei tau ko te bioinformatics i roto i te koiora whanaketanga me te rangahau taipakeke.
Mo te hunga e pirangi ana ki te ako hohonu ki te bioinformatics, kei te whakaae tonu matou ki nga tono mo a maatau i St. Petersburg. Ka whai ranei i a maatau korero mo te whakatuwheratanga o te kaupapa i Moscow i tenei ngahuru.
Mo te hunga kaore i St. Petersburg, i Moscow ranei, engari e tino hiahia ana ki te noho hei bioinformatician, kua rite taatau i roto i te algorithms, te kaupapa, te ira me te koiora.
He maha hoki a matou , ka taea e koe te timata inaianei.
I te tau 2018, i whakahaeretia te kura raumati mo te bioinformatics me te tautoko a o maatau hoa mahi - ko nga kamupene JetBrains, BIOCAD me EPAM, he mihi nui ki a ratou.
Bioinformatics katoa!
PS Mena kaore koe i whakaaro kua nui, и .
Source: will.com