2018 áá¯ááŸá Ạááœá±áá¬áá®ááœáẠáá®ááááºážááá¬ááá¯ááºáᬠááŸá áºáááºááẠááœá±áá¬áá®áá»á±á¬ááºážááᯠá ááá·áºáá®áá¬á áááºá¡áá®ážááœáẠáá»ááºážááá²á·ááŒá®áž ááœá²á·ááŒáá¯ááŸáá·áº ááœá²á·ááá»á±á¬ááºážáá¬áž 100 ááẠáá®ááá±áááá¬áááºááᯠáá±á·áá¬áᬠáá®ááá±áááŸáá·áº áá±ážááá¬áááºáááºá¡áá®ážáá®ážááœáẠáááºážáá¡áá¯á¶ážááŒá¯ááŸá¯á¡ááŒá±á¬ááºážááᯠáá±á·áá¬áá²á·ááŒáááºá
áá»á±á¬ááºážáá¡áááá¡á¬áá¯á¶ááŸá¬ áááºáá¬áá¯áá±ááá¡ááœááºáá¬ááŒá áºááŒá®ážá ááá·áºáá²ááŒá áºá ááºá០áá²ááºáá áºáá¯á á®ááœá²ááŒááºážáá±áá¬ááᯠááœá²ááŒááºážá áááºááŒá¬ááŒááºážá¡áá áá®ááááºážááá¬ááá¯ááºáᬠá¡ááŒá¬ážáááºáááºáá»á¬ážááœáẠáá±á¬ááŒá±á¬ááœá²áá»á¬áž ááŒá¯áá¯ááºáá²á·áá«áááºá áá áºáááºáá¬áá¬áá¡ááœááºážá á¡áá»áá¯ážáá¬ážáá»á¬ážááẠPython ááŸáá·áº R ááœáẠáááá¯ááááºááŒá¯áá¯ááºáá¬ážáá±á¬ áá»áá¯ážáááºáá Ạsequencing data ááŸáá·áº á¡áá¯ááºáá¯ááºááẠáááºáá°áá²á·ááŒá®áž á á¶áá®ááááºážááá¬ááá¯ááºáá¬áááááá¬áá»á¬ážááŸáá·áº áá°áá±á¬ááºáá»á¬ážááᯠá¡áá¯á¶ážááŒá¯áᬠá¡áá»áááºáá»á¬ážáá±á·áá¬ááá·áºá¡áá« á áá áºáá®ááá±ááááºážáááºážáá»á¬ážá ááŒá®ážáá±á¬á·áá±á¬ááºáááºá¡áá»á¬ážááŒá®ážáá²á
á¡á±á¬ááºááœáẠá¡ááá¯áá»á¯á¶ážáá±á¬áºááŒáá»ááºááŸáá·áº áááá¯ááºáá»á¬ážááŒáá·áº áá»á±á¬ááºážááœáẠááá¯á·áá»áá±ážááá·áº áá±á¬ááŒá±á¬ááœá² áá áá¯á áá®áá®ááá¯ááᯠáááºááœá±á·ááá«áááºá ááá±ááœáá·áº â*â ááŒáá·áº á¡ááŸááºá¡áá¬ážááŒá¯áá¬ážáá°áá»á¬ážááẠá¡ááœááºá¡ááŒá±áá¶ááŸáááŒá®áž ááŒáá¯áááºááŒááºáááºááŸá¯áááŸááá² ááŒáá·áºááŸá¯ááá¯ááºáá«áááºá
1* Oncogenomics ááŸáá·áº áá¯áá¹ááá¯ááºáá±ážáá®ážááá·áºáááºáá¬áá±á¬áá« | Mikhail Pyatnitsky, áá®ááá±ážááá¬áá¬áá¯áá±ááá¯áá±áááá¬á
Mikhail ááẠá¡áá»áááºáá»áá¯ážááá¯ážáá®ááá»á¬ážá¡ááŒá±á¬ááºážááŸáá·áº áááºáá¬áá²ááºáá»á¬ážá ááá·áºáá²ááŒá áºá ááºááᯠáá¬ážáááºááá±á¬áá±á«ááºááŒááºážá áááºáá¬áá±á¬áá«áá±áááœáẠáááºááœá±á·áá»áá±á¬ááŒá¿áá¬áá»á¬ážááᯠááŒá±ááŸááºážááá¯ááºáá¯á¶ááᯠá¡áá»ááºážáá»á¯á¶ážááŒá±á¬áá²á·áááºá ááááááẠoncogenes ááŸáá·áº tumor suppressors áá»á¬ážááŒá¬ážááŒá¬ážáá¬ážáá»ááºá "áááºáá¬áá»áá¯ážááá¯ážáá®á" ááá¯ááŸá¬ááœá±ááŒááºážááŸáá·áº á¡áá»áááºáá»á¬ážá áá±á¬áºáá®áá»á°ážá¡áá»áá¯ážá¡á á¬ážááœá²áá»á¬ážááᯠááœá²ááŒá¬ážáááºááŸááºááŒááºážááá¯ááºáᬠáááºážáááºážáá»á¬ážá¡ááŒá±á¬ááºáž ááŸááºážááŒááẠá¡áá°ážá¡á¬áá¯á¶á áá¯ááºáá²á·áá«áááºá áááá¯á¶ážáá»á¯ááºá¡á¬ážááŒáá·áºá Mikhail ááẠoncogenomics áá¡áá¬áááºááŸáá·áº ááŒá áºáá±á«áºáá¬ááá¯ááºááá·áºááŒá¿áá¬áá»á¬ážááᯠá¡á¬áá¯á¶á áá¯ááºáá²á·áááºá
á*á áá»áá¯ážááá¯ážááá¯ááºá¡áá»áááºááá¹ááá¬á
á¯áá»á¬áž | áá»áá¯ážááá¯ážáá®áááá¯ááºáá¬áá±á¬áá«ááŸá¬ááœá±ááŒááºážá Andrey Afanasyevá yRisk
Andrey ááẠáá»áá¯ážááá¯ážááá¯ááºáá±á¬ á¡áá»áááºáá±á¬áá«áá»á¬ážá¡ááŒá±á¬ááºáž ááŒá±á¬ááá¯áá²á·ááŒá®áž áááºážááá¯á·á áá®ááá±áá áá°ážá ááºáá±á¬áá«ááŸáá·áº áááºááœá±á·ááá¯ááºáá»á¬ážááᯠááœá±ážááœá±ážáá²á·áááºá áá±á¬ááŒá±á¬ááœá²ááá áºá áááºáá áºááá¯ááºážááẠáá»áá¯ážááá¯ážáá®áá á áºáá±ážááŒááºážááá¯ááºáá¬ááá á¹á áááºááᯠáááºááœáŸááºážáááº- áááºážááᯠáááºáá°áá¶áá°ááẠááá¯á¡ááºááááºážá áááºážá¡ááœáẠáá¯ááºáá±á¬ááºáááá·áºá¡áá¬á áá±áá¬áá¯ááºáá±á¬ááºááŒááºážááŸáá·áº ááááºáá»á¬ážááᯠáá¬áá¬ááŒááºáá¬ááœáẠá¡áááºá¡áá²áá»á¬áž ááŒá áºáá±á«áºáá¬ááŒááºážááŸáá·áº áá±á¬ááºáá¯á¶ážááœáẠáá°áá¬áá»á¬ážááŸáá·áº áááºážááá¯á·áááœá±áá»áá¯ážáá»á¬ážáᶠáááºááá¯á·á¡áá»áá¯ážáá»á±ážáá°ážáá»á¬áž áá±á¬ááºááŒááºážáá±ážáááºáááºážá .
á*á Pan-Cancer Atlas | áá»á¬ááẠDemidová BIST/UPF
áááºáá¬áá»áá¯ážááá¯ážáá®áááŸáá·áº epigenomics áááºáááºááœáẠáááºá á¯ááŸá áºáá»á¬ážá áœá¬ áá¯áá±ááááŒá¯áá²á·áá±á¬áºáááºážá "áááºáá²á·ááá¯á·á áááºááá·áºáá±áá¬ááŸáá·áº á¡áááºááŒá±á¬áá·áº á¡áá»áááºáá±á¬áá«áá»á¬áž áá±á«áºáá±á«ááºáá¬ááááºáž" áá±ážááœááºážá á¡ááŒá±ááŸá¬ áááŒáá·áºá á¯á¶áá±ážáá«á áááºážá¡ááœáẠá¡ááŒá±á¬ááºážáááºážáá áºáá¯ááŸá¬ á¡ááá·áºá¡áááºááŸááá±á¬ áá±áá¬á¡á á¯á¶ááœáẠááŸá¬ááœá±áááºáááºáá²áá±á¬ ááá¬áá¡áá±ážá á¬ážá áááºáá±á¬ááºááŸá¯ááᯠááááŸáááá¯ááºá á±áááºá¡ááœáẠá á¶áá»áááºá á¶ááœáŸááºážáááºááŸááºáá¬ážáá±á¬ áá±áá¬ááá¬áááᯠááá°ááŒááºážááŸáá·áº á á®áá¶áá±á¬ááºááœááºááŒááºážááá¯á· ááá¯á¡ááºááŒááºáž (áá¬ááºááœá²áááºážáá áºáᯠááá¯á·ááá¯áẠá¡áá»á¬ážá¡ááŒá¬ážá¡ááœááºáž áá±á·áá¬ááŸá¯áá áºáá¯á¡ááœáẠáá¯á¶ááŸááºá¡ááœááºá¡á á¬áž)á ááá¯á·áá±á¬áº á¡á á¯ááá¯ááºá¡á ááºážááœáẠáááºáá¬áá²á·ááá¯á· ááŸá¯ááºááœá±ážááŒá®áž áá»á¬ážááŒá¬ážááŸáá±á¬ áá±á¬áá«áá áºáá¯ááœáẠá¡áá±ážáá«áá±á¬ á¡áááºážááá¹áá០ááŒá®ážáá¬ážáá±á¬ á¡áááºážááá¹áá០áá«áááºáá±áááºá
ááŒá®ážáá²á·áá±á¬ááŸá áºá¡áááºážáááºá¡ááœááºážá á€ááŒá¿áá¬ááᯠááááŸááá¬ážáááºááá·áº ááá¹áá¬á·á¡ááºá¡á¬ážááŒá®áž áá¯áá±ááá¡ááœá²á·á¡áá»á¬ážá¡ááŒá¬ážááẠá€áááºáá±á¬ááºááŸá¯á¡á¬ážáá¯á¶ážááᯠááŸá¬ááœá±áá±á¬áºáá¯ááºáá±á¬áºááŒááẠááŒáá¯ážáááºážááŸá¯ááœáẠá¡ááºá¡á¬ážá á¯áá»á¬áž áá°ážáá±á«ááºážáá«áááºáá¬ááŒáááºá Herman ááẠá¡ááá¯áá« ááá¬áááŒá±ááŸááºážáá»á¬ážáá²á០áá áºáᯠ(The PanCancer Atlas) á¡ááŒá±á¬ááºážááŸáá·áº á€áá¬ááºááœá²áááºáž áá¯ááºáááºážá á¯á áá¯ááºáááºážá á¯á áá áºá áááºáá áºááá¯ááºážá¡ááŒá ẠáááŸááá±á¬ ááááºáá»á¬ážááᯠá€áá±á¬ááŒá±á¬ááœá²á Cell á¡áá°ážáá¯ááºááœáẠáá¯ááºáá±áá²á·áááºá
4. Chip-Seq ááẠepigenetic ááá¹ááá¬ážáá»á¬áž | Oleg Shpynov, JetBrains áá¯áá±áá
áá»áá¯ážááá¯ážáá®ááá±á¬áºááŒááŒááºážááá¯ááºáᬠá ááºážáá»ááºážááᯠáááºážáááºážá¡áá»áá¯ážáá»áá¯ážááŒáá·áº áá±á¬ááºááœááºáááºá áááºážááá±á¬ááŒá±á¬ááœá²ááœáẠOleg ááẠhistone ááŒá¯ááŒááºááœááºážáá¶ááŒááºážááŸáá áºááá·áº epigenetic regulation á¡ááŒá±á¬ááºážá Chip-seq áááºážáááºážááŸáá·áº áááŸááá±á¬ááááºáá»á¬ážááᯠááœá²ááŒááºážá áááºááŒá¬ááŒááºážáááºážáááºážáá»á¬ážááᯠá¡áá¯á¶ážááŒá¯á á€áá¯ááºáááºážá ááºáá»á¬ážááᯠáá±á·áá¬ááŒááºážá¡ááŒá±á¬ááºáž ááŒá±á¬ááŒá¬ážáá²á·áááºá
5. Multiomics in Cancer Research | Konstantin Okonechnikov, áá»á¬áááºáááºáá¬áá¯áá±ááá
ááºáá¬
áá±á¬áºáá®áá»á°áž áá®ááá±áááœáẠá ááºážáááºáááºážááá¬áá»á¬áž ááœá¶á·ááŒáá¯ážááá¯ážáááºáá¬ááŒááºážááŒá±á¬áá·áº áá²ááºáá»á¬ážá ááá¯ááºááœááºážá¡ááºá¹áá«áá»á¬áž ááá¯á·ááá¯áẠáááºááŸááá áºáá¯áá¯á¶ážááœáẠáá»ááºááŒáá·áºáá±á¬ áá¯ááºáá±á¬ááºááŸá¯ááá¯ááºáᬠáá¯ááºáááºážá ááºáá»á¬ážááᯠáá±á«ááºážá ááºáá±á·áá¬ááá¯ááºá á±áá²á·áááºá áá®áááŒá áºá ááºáá»á¬ážá á¡á áááºá¡ááá¯ááºážáá»á¬ážá¡ááŒá¬áž áá»áááºáááºááŸá¯áá»á¬ážááᯠáá°áá±á¬ááºáááºá áá»áá¯ážáá®áá á¡ááœááºááŒá±á¬ááºážá á¡á®áá®áá»á®ááá¯áá áºááŸáá·áº áááá¯áá®á¡áá¯áá áºáá»á¬ážá០ááŒá®ážáá¬ážáá±á¬ á ááºážáááºáá±áá¬áá»á¬ážááᯠáá±á«ááºážá ááºáá¬ážááá·áº multiomics ááᯠá¡áá¯á¶ážááŒá¯ááẠááá¯á¡ááºáá«áááºá Konstantin ááẠááá±ážáááºáá¬áá±á¬áá«áá±áááᯠá¡ááááá¬ážá áááºáá¬áá¯áá±áááááºáááºááœáẠmulti-omics á¡áá¯á¶ážááŒá¯ááŸá¯á ááŸááºážáááºážáá±á¬ á¥ááá¬áá»á¬ážááᯠáá±ážáá²á·áááºá
6. áá²ááºáá áºáá¯áááºáž ááœá²ááŒááºážá áááºááŒá¬ááŒááºáž | Konstantin Okonechnikov
single-cell RNA-seq ááŸáá·áº á€áá±áá¬ááᯠááœá²ááŒááºážá áááºááŒá¬ááẠáááºážáááºážáá»á¬ážá¡ááŒáẠáááºážááá¯á·ááᯠáá±á·áá¬ááá·áºá¡áá« áááá¬áááºááŸá¬ážááŒá®áž áá»áŸáá¯á·ááŸááºáá¬ážáá±á¬ ááŒá¿áá¬áá»á¬ážááᯠáá»á±á¬áºááœáŸá¬ážááá¯ááºááá·áº áááºážáááºážáá»á¬ážá
7. single-cell RNA-seq áá±áá¬ááᯠáá±á·áá¬ááŒááºáž | Konstantin Zaitsevá á
ááá·áºáá°ážáá
áºááŸá áá«ááŸááºáááºááá¹áááá¯ááº
áá²ááºáá áºáá¯á á®á á®ááŒááºážááá¯ááºáᬠááááºáááºáá±á¬ááŒá±á¬ááœá²á Konstantin ááẠááá·áºáá²áááºážáááºážáá»á¬ážá áá¬ááºááœá²áááºážá¡áá¯ááºááŸáá·áº áá®ááááºážááá¬ááá¯ááºáᬠááœá²ááŒááºážá áááºááŒá¬ááŸá¯ááœáẠá¡áááºá¡áá²áá»á¬ážááŸáá·áº áááºážááá¯á·ááᯠáá»á±á¬áºááœáŸá¬ážááẠáááºážáááºážáá»á¬ážááᯠááœá±ážááœá±ážáááºá
8. áá¬ááá¯ááá®á¡á
á®á¡á
á¥áºááᯠá¡áá¯á¶ážááŒá¯á ááŒáœááºáá¬ážáá»á¬áž ááá±á¬ááºááááŒá
áºááŸá¯ááᯠáá±á¬áºáá¯ááºááŒááºáž | Pavel Avdeevá George Washington ááá¹áááá¯ááº
Oxford Nanopore áááºážááá¬ááᯠá¡áá¯á¶ážááŒá¯á áá±á«ááºážá ááºááŒááºážááẠááŒáœááºáá¬áž dystrophy áá²á·ááá¯á·áá±á¬ áá±á¬áá«áá»á¬ážá áá»áá¯ážááá¯ážáá®áááá¯ááºáᬠá¡ááŒá±á¬ááºážáááºážáá»á¬ážááᯠááŸá¬ááœá±áá±á¬áºáá¯ááºááẠá¡áá»áá¯ážáá»á±ážáá°ážáá»á¬ážááŸááá«áááºá áá°ááá±á¬ááŒá±á¬ááœá²á Pavel áááºá€áá±á¬áá«ááá¯ááŸá¬ááœá±áááºá¡ááœááºááá¯ááºááá¯ááºážáá áºáá¯ááœá¶á·ááŒáá¯ážááá¯ážáááºááŸá¯á¡ááŒá±á¬ááºážááŒá±á¬áá²á·áááºá
á*á áá»á®ááá¯áẠ| áááááºáá
áºááá¯ááºá
á¬ážááŒá¯ááŸá¯ Ilya Minkin, Pennsylvania ááŒááºáááºááá¹áááá¯ááº
ááááºááºáá¯á¶á á¶áá»á¬ážááẠáááºáá°áá±á¬ á¡á á®á¡á á¥áºá¡áá»á¬ážá¡ááŒá¬ážááᯠáá»á áºáá»á áºáá»á áºáá»á Ạááá¯ááºá á¬ážááŒá¯ááá¯ááºá á±ááŒá®áž áá»áá¯ážááá¯ážáá®áááœáẠáááŒá¬áá á¡áá¯á¶ážááŒá¯áá±á·ááŸááááºá Ilya ááẠááááºáá»á¬ážááᯠá¡áá¯á¶ážááŒá¯á áá»áá¯ážááá¯ážáá®áá¡á á®á¡áá¶áá»á¬ážááᯠááŒááºáááºáááºáá±á¬ááºáá¯á¶á de Bruin ááááºááᯠá¡áá¯á¶ážááŒá¯áá¯á¶ááŸáá·áº á¡áááºááŒá±á¬áá·áºáááºážá ááá¯áá²á·ááá¯á·áá±á¬ "ááááºáá áº" áá»ááºážáááºááŸá¯ááẠáá®áááŸá¬ááœá±ááŸá¯áá»á¬ážá áááá»ááŸá¯ááᯠááá¯ážááŒáá·áºá á±áááºá ááááºááºá¡áá¯á¶ážááŒá¯ááŸá¯ááœáẠáááŒá±ááŸááºážááá¯ááºáá±á¬ ááŒá¿áá¬áá»á¬áž áá»ááºááŸááá±áá«áá±ážáááºá
10* áá»á±á¬áºááŒá±áá±áž proteomics | Pavel Sinitsyná Max Planck Institute of Biochemistry (á¡ááá¯ááºáž á ááá¯ááºáž)
áááá¯áááºážáá»á¬ážááẠáááºááŸááááºááŸááá»á¬ážááœáẠáá®ááá¬áá¯ááŒá áºá ááºá¡áá»á¬ážá á¯á¡ááœáẠáá¬áááºááŸáááŒá®áž ááá¯á¡áá»áááºá¡áá áááá¯ááááºážáá¬ááºááẠáá±á¬ááºáá±á«ááºážáá»á¬ážá áœá¬áá±á¬ áááá¯ááááºážáá»á¬ážáá¡ááŒá±á¡áá±ááᯠáá áºááŒáá¯ááºááẠááá¹áá¬áá¯á¶ážááá¯ááºáá¬ááœá²ááŒááºážá áááºááŒá¬ááŸá¯á¡ááœáẠáá áºáá¯áááºážáá±á¬áááºážáááºážááŒá áºáááºá ááŒá±ááŸááºážááá¯ááºáá±á¬ ááŒá¿áá¬áá»á¬ážá á¡ááœá¬á¡áá±ážááẠá¡áááºááŒá®ážá áá¬áá±á¬ááºážááẠ- ááááá á¹á ááºážáá»á¬ážááŸáá·áº á¡ááºáá®áá»ááºáá»á¬ážááᯠááœá²ááŒá¬ážáááºááŸááºááŒááºážá០áááá¯áááºážáá±á¬ááºáá±á«ááºážáá»á¬ážá áœá¬á áá±áááœááºááŒááºážááᯠáá¯á¶ážááŒááºááŒááºážá¡áá ááŒá áºáááºá áá°á áá±á¬ááŒá±á¬ááœá²áá»á¬ážááœáẠPavel ááẠá¡ááá¯áá« proteomics ááŸáá·áº á¡ááŒá¬ážáá±á¬ á¡áá¯á¶ážáá»ááŸá¯áá»á¬ážá áááºážá áááºááŸá ááœá¶á·ááŒáá¯ážááá¯ážáááºááŸá¯ááŸáá·áº áá±áá¬ááœá²ááŒááºážá áááºááŒá¬ááŸá¯ááœáẠá¡ááŸá¬ážá¡ááœááºážáá»á¬ážá¡ááŒá±á¬ááºáž ááŒá±á¬ááá¯áá²á·áááºá
ááá·áºáá
áº*á áá±á¬áºáá®áá»á°áž ááá¯ááºááááºáá»á¬áž | Pavel Yakovlev, BIOCAD
áá±á¬áºáá®áá»á°ážááá¯ááºážááá áºááá¯ááºáᬠáááá«ááºážáá®á¡áá¯áá® ááá¯á·áá»áá»ááº- á¡áááºááŒá±á¬áá·áº ááá¯á¡ááºááááºážá áááºážááẠá¡áááºá¡áá¬ááŸáá·áº áááºážááᯠáá±ážáá«ážááœá¶á·ááŒáá¯ážááá¯ážáááºááŸá¯ááŸáá·áº á ááºáá»ááºážá áááºááá¯á·á¡áá¯á¶ážááŒá¯ááááºážá Pavel ááẠáá±á¬áºáá®áá»á°ážááá¯ááºážááá áºáááºážáááºážáá»á¬ážá áá±á¬áºáá®áá»á°ážá¡ááºá¡á¬ážá á¯áá»á¬ážá ááŸááºážáááºážáá»ááºá áá»áááºáááºááŸá¯áá»á¬ážááá±á¬áºááŒáá»ááºá "force field" ááŸáá·áº "integration" á áá±á¬áºáááºá¡ááœáẠááá·áºáááºáá»ááºáá»á¬áž ááŸáá·áº á¡ááŒá¬ážá¡áá¬áá»á¬ážááᯠá¡á¬áá¯á¶á áá¯ááºáá²á·áááºá
12*á áá±á¬áºáá®áá»á°áž áá®ááá±áááŸáá·áº áá»áá¯ážááá¯ážáá®á | Yuri Barbitov, áá®ááááºážááá¬áááá¹áá¶
á¡ááºáá»ááºáá®áá¬áá»á±á¬ááºážáá¬ážáá»á¬ážááŸáá·áºááœá²á·ááá»á¬ážá¡ááœáẠáá±á¬áºáá®áá»á°ážáá®ááá±áááŸáá·áº áá»áá¯ážááá¯ážáá®áááá¯ááºáᬠáá¯á¶ážááá¯ááºáž ááááºáááºá ááá áá±á¬ááŒá±á¬ááœá²ááœáẠáá±ááºáá áºáá®ááá±á ááá±á¬ááá¬ážáá»á¬ážá áá»á®ááá¯ááºááœá²á·á ááºážáá¯á¶ááá¯ááºáᬠááŒá¿áá¬áá»á¬ážááŸáá·áº áá®áááŒá±á¬ááºážáá²ááŸá¯áá»á¬áž ááŒá áºááœá¬ážáá¯á¶ááá¯á·ááᯠááœá±ážááœá±ážáá¬ážáááºá áá¯áááááœáẠáá»áá¯ážáá®ááá¯ááºáá±á¬ááºááŸá¯ááá¯ááºáᬠááŒá¿áá¬áá»á¬ážá áá°ážáá°áá±á¬áºááŒááŒááºážááŸáá·áº áá¬áá¬ááŒááºááŒááºážááá¯ááºáᬠáá¯ááºáááºážá ááºáá»á¬ážááᯠá¡áá±ážá áááºáá±á¬áºááŒáá¬ážááŒá®ážá ááááááŸá¬ áá»áá¯ážááá¯ážáá®ááá±á¬áºááŒááŒááºážááá¯ááºáᬠá ááºážáá»ááºážááŸáá·áº á¡ááŒá±áá¶áá±á¬áºáá®áá»á°ážáá®ááá±ááááºážáááºážáá»á¬ážááᯠá¡áá»á¯á¶ážáááºáá«áááºá
13* NGS áá±áá¬ááœá²ááŒááºážá áááºááŒá¬ááŒááºážááá¯ááºáᬠá¡ááŒá±áá¶áá°áá»á¬áž | Yuri Barbitov, áá®ááááºážááá¬áááá¹áá¶
áá±á¬ááŒá±á¬ááœá²ááẠáá¯ááááá»áá¯ážááẠsequencing (NGS) áááºážáááºážáá»á¬ážá áááºážááá¯á·á á¡áá»áá¯ážá¡á á¬ážáá»á¬ážááŸáá·áº ááá¹ááá¬áá»á¬ážááᯠáá±á¬áºááŒáááºá ááááá០sequencer á០data "output" ááᯠáááºááá¯á·ááœá²á·á ááºážáá¯á¶á áááºážááᯠááœá²ááŒááºážá áááºááŒá¬áááºá¡ááœáẠáááºááá¯á·áá°ážááŒá±á¬ááºážááŒá±á¬ááºážá áááºážááŸáá·áº áááºááá¯á·áá¯ááºáá±á¬ááºááááºááᯠá¡áá±ážá áááºááŸááºážááŒáá¬ážáááºá
áá*á command line ááá¯á¡áá¯á¶ážááŒá¯á áááºááœá±á· | Gennady Zakharov, EPAM
á¡áá¯á¶ážáááºáá±á¬ Linux command line commandsá ááœá±ážáá»ááºá áá¬áá»á¬ážááŸáá·áº áááºážááá¯á·ááᯠá¡áá¯á¶ážááŒá¯ááŒááºážá á¡ááŒá±áá¶áá»á¬ážááᯠáááºááœá±á·áá»áá±á¬ ááŒá¯á¶áá¯á¶áá¯á¶ážáááºáá»ááºá ááá°áá¬áá»á¬ážááẠáá áºáááºáááºáž DNA á ááœá²ááŒááºážá áááºááŒá¬ááŸá¯á¡áá±á«áº á¡á¬áá¯á¶á áá¯ááºáááºá áá¯á¶ááŸáẠLinux áá¯ááºáá±á¬ááºáá»ááºáá»á¬ážá¡ááŒáẠ(á¥ááá¬á catá grepá sedá awk)á sequences (samtoolsá bedtools) ááŸáá·áº á¡áá¯ááºáá¯ááºáááºá¡ááœáẠá¡áá¯á¶ážáááºááŸá¯áá»á¬ážááᯠááá·áºááœááºážá ááºážá á¬ážáá«áááºá
15* ááá±ážáá»á¬ážá¡ááœáẠáá±áá¬á
áááºáá°ážáá¯á¶áá±á¬áºááŒááºáž | Nikita Alekseevá ITMO ááá¹áááá¯ááº
áá°ááá¯ááºážááœáẠáááºážááá¯á·á ááá¯ááºááá¯ááºáááá¹áá¶ááá±á¬áá»ááºáá»á¬ážá ááááºáá»á¬ážááᯠááá¯ááºáá±á¬áºááŒááºáž ááá¯á·ááá¯áẠá¡ááŒá¬ážáá°áá»á¬ážá áá¯á¶áá»á¬ážá ááááºáá»á¬ážááŸáá·áº áá¯á¶áá»á¬ážááᯠáá¬ážáááºááá±á¬áá±á«ááºááŒááºáž á¡ááœá±á·á¡ááŒá¯á¶ááŸááá°ážáááºá Nikita ááẠááááºáá»á¬ážááŸáá·áº áá¯á¶áá»á¬ážááᯠááŸááºáááºá áœá¬á¡áááºááŒááºááá¯áááºážááᯠááŒá±á¬ááŒáá²á·ááŒá®áž áááºážááá¯á·á០á¡áááá¡áá¬á¡á¬áž áá®ážáá±á¬ááºážááá¯ážááŒááŒááºážá ááŒááºáá¬ážáá±á¬áá¯á¶áá»á¬ážááœá²áááºážá ááááááẠáá±á¬ááºážáá«ážáá áºáá¯ááºáááºááŒááºáž ááá¯á·ááá¯áẠááŒá±á¬áºááŒá¬áá áºáá¯ááŒáá·áºááá·áºá¡áá« ááŸá¬ááœá±áááá·áºá¡áá¬ááá¯áááºáž á¡áá±ážáá±ážáá±á¬áºááŒáá²á·áááºá
áá*á Bioinformatics | á¡áááºááœá±ážáááºážááŒá±á¬ááºážá¡áá¯ááºáá»á¬áž Victoria Korzhova, Max Planck Institute of Biochemistry
áá®áá®ááá¯áá»á¬áž:
áá áºááá¯ážáá®ážáá¬ážááẠááá¯ááºáá¶ááŒá¬ážááœáẠááá¬áááºááá¯ááºáᬠáááá¹áá¶ááœá²á·á ááºážáá¯á¶ááŸáá·áº áááá¹áᶠááá¯á·ááá¯áẠá ááºááŸá¯áá¯ááºáááºážááœáẠá¡áááºááœá±ážáááºážááŒá±á¬ááºážááŒá¯áááºá¡ááœáẠááœá²á·ááŒáá¯á ááœá²á·ááœáẠááá¯á·ááá¯áẠááœá²á·ááœááºáá»á±á¬ááºážáá¬ážá¡ááŒá Ạáá°áá±á¬ááºáááºá¡ááœáẠáááºá¡á¬áá¯á¶á áá¯ááºáááá·áºá¡áá¬áá»á¬ážá¡ááŒá±á¬ááºáž ááŒá±á¬ááŒáá²á·áááºá
áá*á áááá¹áá¶ááá¬ááŸááºá¡ááœáẠCV ááᯠáááºááá¯áá±ážáááá² Victoria Korzhova, Max Planck Institute of Biochemistry
CV ááŸá¬ áá¬ááœá±áá»ááºáá¬ážáááá²á áá¬ááœá±ááᯠáááºááŸá¬ážáááá²á ááŒá áºááá¯ááºáá»á±ááŸááá±á¬ áá¬ááºááœá²áááºážáááºáá±áá»á¬áá áºáŠážá¡ááœáẠáááºááá·áºá¡áá»ááºáá»á¬áž á áááºáááºá á¬ážááœááºááŸáááááºážá áááºááá·áºá¡áá¬á ááá¯áá±á¬ááºážáááºááᯠááá±á¬áºááŒáá¬ážáá«á áááºáááá¯ááºáá±ážá¡áá»ááºážááᯠáááºááŸá¬ážáá±á«áºááœááºá á±ááẠá¡áá»ááºá¡áááºáá»á¬ážááᯠáááºááá¯á·á á®á ááºááá·áºááááºážá áá±á¬ááŒá±á¬ááœá²ááẠá€áá±ážááœááºážáá»á¬ážááŸáá·áº á¡ááŒá¬ážáá±ážááœááºážáá»á¬ážá¡ááœáẠá¡ááŒá±áá±ážáááºááŒá áºáá«áááºá
18* bioinformatics á á»á±ážááœááºáááºááá¯á¡áá¯ááºáá¯áẠ| Andrey Afanasyevá yRisk
á á»á±ážááœááºá áááºááá¯á¡áá¯ááºáá¯ááºááá²á áá®áááááºážááá¬ááŸááºá áááºáá±áá¬ááŸá¬ á¡áá¯ááºáá¯ááºááá¯ááºááá²á á€áá±ážááœááºážá¡ááœáẠá¡ááŒá±ááᯠAndrey á áá±á¬ááŒá±á¬ááœá²ááœáẠááá°áá¬áá»á¬ážááŸáá·áº á¡ááŒá¶áá¬ááºáá»á¬ážááŒáá·áº á¡áá±ážá áááºáááºááŒáá¬ážáááºá
á¡áá¯á¶áž
áááºáááááŒá¯ááááá·áºá¡ááá¯ááºážá áá»á±á¬ááºážááœáẠáá±á¬ááŒá±á¬ááœá²áá»á¬ážááẠáá±á¬áºáá®áá»á°ážáá¯á¶á á¶ááŒááŒááºážááŸáá·áº áá»á®ááá¯ááºá á¯áá±ážááŸá¯á¡ááœáẠááááºáá»á¬ážá¡áá¯á¶ážááŒá¯ááŒááºážá áá²ááºáá áºáá¯áááºážááᯠááœá²ááŒááºážá áááºááŒá¬ááŒááºážááŸáá·áº áááá¹áá¶áááºážáá»á¡áááºááœá±ážáááºážáá»á±á¬ááºážáááºáá±á¬ááºááŒááºážá¡áá áá±á«ááºážá ááºáá»á¬ážááŒáá·áº áá»ááºááŒáá·áºáá«áááºá Bioinformatics Institute á០áá»áœááºá¯ááºááá¯á·ááẠBioinformatics áá¬áá¬áááºáá»á¬ážááᯠáááºááá¯ááºááá»áŸ á¡áá»á¯á¶ážáááºá á±áááºá¡ááœáẠáá»á±á¬ááºážáááá¯ááááºááœáẠáá±á«ááºážá ááºá¡áá»áá¯ážáá»áá¯ážááᯠááá·áºááœááºážááẠááŒáá¯ážá á¬ážááŒá®áž áá«áááºáá°ááá¯ááºážááẠá¡áá áºá¡áááºážááŸáá·áº á¡áá¯á¶ážáááºáá±á¬ á¡áá¬áá»á¬ážááᯠáááºáá°ááá¯ááºá á±áááºá
áá®ááááºážááá¬ááá¯ááºáá¬áá±á¬ááºáááºáá»á±á¬ááºážááᯠáá±á¬áºá
ááá¯á¡áá®ážááœáẠáá°ááá¯áẠáá áááºá០ááŒáá¯áẠá áááºá¡áá áá»ááºážááááºááŒá
áºáááºá
Bioinformatics ááᯠáááºáááºáá²áá² áá±á·áá¬ááá¯áá°áá»á¬ážá¡ááœááºá áá»áœááºá¯ááºááá¯á·á áá»áŸá±á¬ááºááœáŸá¬áá»á¬ážááᯠáááºáá¶áá±áá²ááŒá
áºáá«áááºá
á
ááá·áºáá®áá¬á
ááẠ(ááá¯á·) áá±á¬áºá
ááá¯ááœááºáááŸááá±á¬áºáááºáž á¡ááŸááºáááẠáá®ááá±áááá¬ááŸááºááŒá
áºááá¯áá°áá»á¬ážá¡ááœáẠáá»áœááºá¯ááºááá¯á· ááŒááºáááºáá¬ážáá«áááºá
áá«áááºáá²á·áá»á®áááºá
2018 áá¯ááŸá áºááœááºá áá»áœááºá¯ááºááá¯á·ááá¯á¶ááŸááºáá¯ááºáá±á¬áºááá¯ááºáááºáá»á¬ážááŒá áºáá±á¬ JetBrainsá BIOCAD ááŸáá·áº EPAM ááá¯á·ááá¶á·ááá¯ážááŸá¯ááŒáá·áº ááœá±áá¬áá®áá»á±á¬ááºážááᯠáá»áœááºá¯ááºááá¯á·á០á¡áá°ážáá»á±ážáá°ážáááºááŸááá«áááºá
Bioinformatics áá°ááá¯ááºážá
PS ááá¯á¶áá±á¬ááºáá°ážáááºáááº
source: www.habr.com