Xagaagii 2018, dugsi xagaaga oo sannadle ah oo bioinformatics ah ayaa lagu qabtay agagaarka St. Petersburg, halkaas oo 100 arday oo shahaadada koowaad ah iyo kuwa ka qalin jabiyay ay u yimaadeen inay bartaan bioinformatics oo ay bartaan isticmaalka qaybaha kala duwan ee bayoloji iyo dawooyinka.
Ujeeddada ugu weyn ee dugsigu waxay ahayd cilmi-baadhista kansarka, laakiin waxaa jiray muxaadarooyin ku saabsan qaybaha kale ee bioinformatics, oo u dhexeeya horumarinta ilaa falanqaynta xogta taxanaha unugyada hal unug. Toddobaadka dhexdiisa, nimanku waxay barteen inay la shaqeeyaan xogta isku xigxiga ee jiilka soo socda, oo lagu qorsheeyay Python iyo R, waxay isticmaaleen aaladaha bioinformatics caadiga ah iyo qaab-dhismeedka, waxay barteen hababka bayoolajiga nidaamka, genetics dadweynaha iyo qaabaynta daroogada markii ay baranayeen burooyinka, iyo qaar kaloo badan.
Hoos waxaad ka heli doontaa muuqaal 18 muxaadaro ah oo laga bixiyo dugsiga, oo leh sharraxaad kooban iyo sawirro. Kuwa lagu calaamadeeyay calaamad "*" waa kuwo aasaasi ah waxaana la daawan karaa iyada oo aan la diyaarin.
1*. Oncogenomics iyo Kansarka shakhsi ahaaneed | Mikhail Pyatnitsky, Machadka Cilmi-baarista ee Kiimikada Biomedical
|
Mikhail wuxuu si kooban uga hadlay genomics-ka burada iyo sida fahamka horumarka unugyada kansarka uu noo ogolaado inaan xallino dhibaatooyinka la taaban karo ee kansarka. Macallinku wuxuu si gaar ah u fiirsaday si uu u sharaxo farqiga u dhexeeya oncogenes iyo burooyinka xakamaynta, hababka raadinta "genes-ka kansarka" iyo aqoonsiga noocyada hoose ee unugyada unugyada. Gabagabadii, Mikhail ayaa fiiro gaar ah u leh mustaqbalka oncogenomics iyo dhibaatooyinka laga yaabo inay soo baxaan.
2*. Cilad-sheegid hidde-sideyaasha burooyinka la iska dhaxlo | Andrey Afanasyev, Khatarta
|
Andrey wuxuu ka hadlay xanuunka burooyinka ee la iska dhaxlo wuxuuna ka hadlay bayolojigooda, cudurada faafa iyo muuqaalada kiliinikada. Qayb ka mid ah muxaadarada waxaa lagu go'aamiyay arrinta baaritaanka hidda-socodka - yaa u baahan in la maro, maxaa loo sameeyaa tan, maxaa dhib ah ee ka soo baxa habka xogta iyo fasiraadda natiijooyinka, iyo, ugu dambeyntii, faa'iidooyinka ay u leedahay bukaannada iyo qaraabadooda .
3*. The Pan-Cancer Atlas | Jarmal Demidov, BIST/UPF
|
Inkastoo tobanaan sano oo cilmi baaris ah oo ku saabsan genomics-ka kansarka iyo epigenomics, jawaabta su'aasha "sidee, meesha iyo sababta xanuunka burooyinka" weli waa mid aan dhamaystirnayn. Mid ka mid ah sababaha tani waa baahida loo qabo helitaanka jaangooyo iyo habaynta tiro badan oo xog ah si loo ogaado saamaynta baaxadda yar ee ay adagtahay in lagu ogaado xog xaddidan (xajmiga u dhigma daraasadda gudaha hal ama dhowr shaybaar) , laakiin taas oo marka la isku daro door weyn ka ciyaara sida cudurada kakan iyo noocyada badan sida kansarka.
Dhowrkii sano ee la soo dhaafay, qaar badan oo ka mid ah kooxaha cilmi-baarista ugu awoodda badan adduunka, iyagoo og dhibaatadan, ayaa bilaabay inay ku biiraan xoogga isku dayga inay ogaadaan oo ay qeexaan dhammaan saameyntan. Herman wuxuu ka hadlay mid ka mid ah hindisayaashan (The PanCancer Atlas) iyo natiijooyinka la helay oo qayb ka ah shaqada ururkan shaybaadhada oo lagu daabacay arrin gaar ah oo Cell ah muxaadaradan.
4. ChIP-Seq ee daraasadda hababka epigenetic | Oleg Shpynov, JetBrains Research
|
Nidaaminta muujinta hiddaha waxaa loo fuliyaa siyaabo kala duwan. Muxaadaradiisa, Oleg wuxuu ka hadlay xeerka epigenetic iyada oo loo marayo isbeddelka histone, daraasadda hababkan iyadoo la adeegsanayo habka ChIP-seq iyo hababka falanqaynta natiijooyinka la helay.
5. Multiomics in Cancer Research | Konstantin Okonechnikov, Xarunta Cilmi-baarista Kansarka ee Jarmalka
|
Horumarinta tikniyoolajiyada tijaabada ah ee bayoolajiga molecular ayaa suurtogal ka dhigtay in la isku daro daraasadda hababka kala duwan ee hawlaha unugyada, xubnaha ama xitaa dhammaan noolaha. Si loo dhiso isku xirka qaybaha hababka bayoolojiga, waxaa lagama maarmaan ah in la isticmaalo multiomics, kaas oo isku daraya xog tijaabo ah oo weyn oo ka socota genomics, transcriptomics, epigenomics iyo proteomics. Konstantin wuxuu bixiyay tusaalooyin cad oo ku saabsan isticmaalka multi-omics ee goobta cilmi-baarista kansarka iyadoo diiradda la saarayo kansarka carruurta.
6. Kala Duwanaanshaha iyo Xaddidaadda Falanqaynta Unug Keliya | Konstantin Okonechnikov
|
Muxaadaro aad u faahfaahsan oo ku saabsan hal unug RNA-seq iyo hababka falanqaynta xogtan, iyo sidoo kale siyaabaha looga gudbi karo dhibaatooyinka muuqda iyo kuwa qarsoon marka la baranayo.
7. Falanqaynta xogta hal unug ee RNA-seq | Konstantin Zaitsev, Jaamacadda Washington ee St. Louis
|
Muxaadaro horudhac ah oo ku saabsan isku xigxiga hal unug. Konstantin wuxuu ka hadlayaa hababka isku xigxiga, dhibaatooyinka shaqada shaybaarka iyo falanqaynta bioinformatics, iyo siyaabaha looga gudbi karo.
8. ogaanshaha murqaha dystrophy iyadoo la isticmaalayo nanopore sequencing | Pavel Avdeev, Jaamacadda George Washington
|
Isku xigxiga iyadoo la adeegsanayo tignoolajiyada Oxford Nanopore waxay leedahay faa'iidooyin loo isticmaali karo in lagu aqoonsado sababaha hidda-socodka ee cudurrada sida dystrophy muruqa. Muxaadaradiisa, Pavel wuxuu ka hadlay horumarinta dhuumaha lagu ogaanayo cudurkan.
9*. Tusmada garaafka ee genome | Ilya Minkin, Jaamacadda Gobolka Pennsylvania
|
Moodooyinka garaafku waxay oggolaadaan matalaad kooban oo tiro badan oo isku xigxig ah waxaana badanaa loo adeegsadaa genomics. Ilya ayaa si faahfaahsan uga hadlay sida taxanaha genomic dib loo dhisay iyadoo la isticmaalayo garaafyada, sida iyo sababta loo isticmaalo garaafyada de Bruin, intee in le'eg ee habka "garaafka" ee noocan oo kale ah ayaa kordhiya saxnaanta raadinta isbeddelka, iyo dhibaatooyinka aan la xalin ee isticmaalka garaafyada weli.
10*. Maadada Proteomics | Pavel Sinitsyn, Max Planck Institute of Biochemistry (2 qaybood)
, |,
Barootiinadu waxay mas'uul ka yihiin inta badan hababka biochemical ee noolaha, iyo ilaa hadda proteomics waa habka kaliya ee falanqaynta caalamiga ah ee xaaladda kumanaan borotiinada isku mar. Dhibaatooyinka kala duwan ee la xalliyo waa mid cajiib ah - laga bilaabo aqoonsiga unugyada difaaca jirka iyo antigens si loo go'aamiyo meelaynta dhowr kun oo borotiinno ah. Muxaadarooyinka, Pavel wuxuu ka hadlay kuwan iyo codsiyada kale ee proteomics, horumarkeeda hadda iyo dhibaatooyinka falanqaynta xogta.
kow iyo toban*. Mabaadi'da aasaasiga ah ee jilitaanka molecular | Pavel Yakovlev, BIOCAD
|
Muxaadaro horudhac ah oo ku saabsan dhaqdhaqaaqa molecular: sababta loogu baahan yahay, waxa ay qabato iyo sida loo isticmaalo ee la xidhiidha horumarinta daroogada. Pavel ayaa fiiro gaar ah u leh hababka dhaqdhaqaaqa molecular, sharaxaadda xoogagga molecular, sharaxaadda isku xirka, fikradaha "goobta xoogga" iyo "isdhexgalka", xaddidaadaha qaabeynta, iyo wax ka badan.
12*. Biology iyo Hidde-sideyaasha Molecular | Yuri Barbitov, Machadka Bioinformatics
, , |
Hordhac saddex qaybood ka kooban oo ku saabsan bayoolaji molecular iyo genetics ee ardayda injineernimada iyo kuwa qalin jebiyay. Muxaadarada koowaad waxay ka hadlaysaa fikradaha bayoolajiga casriga ah, arrimaha qaab-dhismeedka genome-ga iyo dhacdooyinka isbeddellada. Midda labaad waxay si faahfaahsan u dabooshaa arrimaha shaqada hidda-sidaha, hababka qorista iyo tarjumaadda, saddexaadna waxay daboolaysaa hab-dhaqanka muujinta hidda-wadaha iyo hababka bayooloji ee aasaasiga ah.
13*. Mabaadi'da Falanqaynta Xogta NGS | Yuri Barbitov, Machadka Bioinformatics
|
Muxaadarada ayaa qeexaysa hababka isku xigxiga jiilka labaad (NGS), noocyadooda iyo sifooyinkooda. Macallinku wuxuu si faahfaahsan u sharxayaa sida xogta "soo-saarka" ka soo baxda taxanaha loo habeeyey, sida loogu beddelo falanqaynta, iyo maxay yihiin hababka lagula shaqeeyo.
14*. Isticmaalka khadka taliska, ku celceli | Gennady Zakharov, EPAM
Dulmar wax ku ool ah oo ku saabsan amarrada khadka taliska Linux ee waxtarka leh, xulashooyinka iyo aasaaska isticmaalkooda. Tusaalooyinka ayaa diiradda saaraya falanqaynta taxanaha DNA-da ee isdaba jooga. Marka lagu daro hawlgallada caadiga ah ee Linux (tusaale, bisad, grep, sed, awk), utilities ka shaqaynta taxanaha (samtools, bedtools) ayaa la tixgaliyaa.
15*. Aragtida xogta ee carruurta yaryar | Nikita Alekseev, Jaamacadda ITMO
|
Qof kastaa waxa uu khibrad u lahaa in uu muujiyo natiijooyinka mashruucyadooda cilmiyeed ama fahamka jaantusyada, garaafyada iyo sawirrada dadka kale. Nikita ayaa u sheegay sida saxda ah ee loo turjumo garaafyada iyo jaantusyada, isaga oo muujinaya waxa ugu muhiimsan iyaga; sida loo sawiro sawiro cad. Macalinku waxa kale oo uu xooga saaray waxa la raadinayo marka la akhrinayo maqaal ama daawashada xayaysiis
16*. Xirfadaha Bioinformatics | Victoria Korzhova, Max Planck Institute of Biochemistry
Video: , |
Fiktooriya waxay ka hadashay qaab dhismeedka sayniska akadeemiyadeed ee dibadda iyo waxa aad u baahan tahay inaad fiiro gaar ah u yeelato si aad u dhisto mihnad saynis ama warshadeed sida arday jaamacadeed, qalin jabisay ama qalin jabisay.
17*. Sida CV loogu qoro Saynisyahan | Victoria Korzhova, Max Planck Institute of Biochemistry
Maxaa looga tagayaa CV-ga iyo maxaa la saarayaa? Waa maxay xaqiiqooyinka ay dani ugu jirto maareeyaha shaybaadhka ee suurtogalka ah, keebaa fiican in aan la xusin? Sideed u habayn kartaa macluumaadka si aad resumeygaaga uga dhigto mid muuqda? Muxaadarada ayaa jawaabo ka bixin doonta su'aalahaas iyo kuwa kale.
18*. Sida suuqa bioinformatics u shaqeeyo | Andrey Afanasyev, Khatarta
|
Sidee ayuu suuqu u shaqeeyaa, xageese ka shaqayn karaa bioinformatician? Jawaabta su'aashan waxaa lagu soo bandhigay si faahfaahsan, oo leh tusaalooyin iyo talooyin, muxaadarada Andrey.
Dhammaad
Sida laga yaabo inaad dareentay, muxaadarooyinka dugsiga ayaa aad u ballaadhan mawduucyada - laga bilaabo qaabaynta molecular iyo isticmaalka garaafyada ururinta genome, falanqaynta unugyada kelida ah iyo dhisidda xirfad cilmiyeed. Anagoo ah machadka Bioinformatics waxaan isku daynaa inaan ku darno mowduucyo kala duwan barnaamijka dugsiga si aan u daboolo inta ugu badan ee maadooyinka bioinformatics-ka ee suurtogalka ah, iyo si ka qaybgale kasta u barto wax cusub oo faa'iido leh.
Dugsiga soo socda ee bioinformatics ayaa la qaban doonaa laga bilaabo Luulyo 29 ilaa Agoosto 3, 2019 meel u dhow Moscow. . Mawduuca sanadkan wuxuu noqon doonaa bioinformatics ee bayoolajiga korriinka iyo cilmi-baarista gabowga.
Kuwa raba inay si qoto dheer u bartaan bioinformatics, waxaan wali aqbalnaa codsiyadayada St. Petersburg. Ama la soco wararkayaga ku saabsan furitaanka barnaamijka dayrta ee Moscow.
Kuwa aan ku jirin St. Petersburg ama Moscow, laakiin dhab ahaantii doonaya inay noqdaan bioinformatician, waxaan u diyaarinay algorithms, programming, genetics iyo biology.
Waxaan sidoo kale haynaa daraasiin , oo aad hadda bilaabi karto inaad marto.
Sannadka 2018, dugsiga xagaaga ee bioinformatics ayaa la qabtay iyadoo ay taageerayaan shuraakadayada joogtada ah - shirkadaha JetBrains, BIOCAD iyo EPAM, kuwaas oo aan aad ugu mahadcelineyno.
Bioinformatics qof walba!
PS Haddii aadan u malayn inay ku filan tahay, ΠΈ .
Source: www.habr.com