Kompania Google DeepMind publikoi tekstet burimore tĂ« sistemit tĂ« mĂ«simit tĂ« makinĂ«s AlphaFold 3, i cili Ă«shtĂ« projektuar pĂ«r tĂ« parashikuar strukturĂ«n tredimensionale tĂ« proteinave dhe pĂ«r modelimin e ndĂ«rveprimeve tĂ« proteinave me lloje tĂ« tjera molekulash. PĂ«r krijimin e algoritmeve tĂ« mĂ«simit tĂ« makinĂ«s, tĂ« realizuara nĂ« versionin e dytĂ« tĂ« AlphaFold, kĂ«tĂ« vit iu dha Ămimi Nobel nĂ« Kimie. Instrumentet e lidhura me AlphaFold 3 janĂ« shkruar nĂ« Python dhe C++, dhe shpĂ«rndahen nĂ«n licencĂ«n CC BY-NC-SA 4.0. Modelet e stĂ«rvitura ofrohen nĂ« bazĂ« tĂ« marrĂ«veshjes sĂ« pĂ«rdoruesit. PjesĂ«risht Ă«shtĂ« startuar server, duke lejuar eksperimente me AlphaFold 3 nĂ« mĂ«nyrĂ« online.
Modeli, i cili është stërvitur në një koleksion me përshkrimin e strukturave të të gjitha proteinave të njohura dhe sekuencave të aminoacideve, zgjidh problemin e konfigurimit të proteinave dhe lejon parashikimin e strukturës tredimensionale të proteinave të reja me një saktësi që, të paktën, nuk i bie pas analizës laboratorike, ndërsa në vlerësimin e ndërveprimeve të proteinave me lloje të tjera molekulash e tejkalon ndjeshëm metodat ekzistuese të parashikimit. Versioni i tretë i modelit AlphaFold karakterizohet nga përdorimi i një arkitekture të re
Pairformer
, që zhvillon idenë e arkitekturës "transformer". Ndryshe nga AlphaFold 2, versioni i ri nuk kufizohet në proteina që përbëhen nga një zinxhir polipeptidik dhe mund të përdoret për parashikimin e komplekseve proteinike me ADN dhe ARN, si dhe për modelimin e varianteve të modifikuara të këtyre molekulave. Në hyrje të AlphaFold jepet një listë molekulash, ndërsa në daljen formohet një strukturë 3D e përbashkët, e cila përcakton ndërveprimin më të mundshëm të këtyre molekulave.
Burimi: opennet.ru
