Kompania Google DeepMind publikoi kodet burimore tĂ« sistemit tĂ« mĂ«simit tĂ« makinerisĂ« AlphaFold 3, i destinuar pĂ«r tĂ« parashikuar strukturĂ«n tridimensionale tĂ« proteinave dhe pĂ«r modelimin e ndĂ«rveprimit tĂ« proteinave me lloje tĂ« tjera molekulash. PĂ«r krijimin e algoritmeve tĂ« mĂ«simit tĂ« makinerisĂ«, tĂ« realizuara nĂ« versionin e dytĂ« tĂ« AlphaFold, kĂ«tĂ« vit u dha Ămimi Nobel nĂ« KimikĂ«. Veglat e lidhura me AlphaFold 3 janĂ« shkruar nĂ« Python dhe C++, dhe shpĂ«rndahen nĂ«n licencĂ«n CC BY-NC-SA 4.0. Modelet e trajnuara jepen mbi bazĂ«n e njĂ« marrĂ«veshjeje pĂ«rdoruesi. NdĂ«rkohĂ«, Ă«shtĂ« aktivizuar server, qĂ« lejon eksperimentimin me AlphaFold 3 nĂ« modalitetin online.
Modeli i trajnuar në një koleksion që përshkruan strukturat e të gjitha proteinave dhe sekuencave të aminoacideve të njohura, zgjidh problemin e palosjes së proteinave dhe lejon parashikimin e strukturës tridimensionale të proteinave të reja me saktësi që nuk është më e ulët se analiza laboratorike, ndërsa në vlerësimin e ndërveprimeve të proteinave me lloje të tjera të molekulave, tejkalon ndjeshëm metodat ekzistuese të parashikimit. Versioni i tretë i modelit AlphaFold karakterizohet nga përdorimi i arkitekturës së re 'Pairformer', e cila zhvillon idenë e arkitekturës 'transformer'.
Ndryshe nga AlphaFold 2, versioni i ri nuk kufizohet vetëm në proteinat që përbëhen nga një zinxhir polipeptidik, por mund të aplikohet për parashikimin e komplekseve proteine me ADN dhe ARN, si dhe për modelimin e varianteve të modifikuara të këtyre molekulave. Në hyrjen e AlphaFold dorëzohet një listë molekulash, dhe në daljen formohet një strukturë 3D e përbashkët, e cila përcakton ndërveprimin më të mundshëm të molekulave të cituara.
Nga një këndvështrim praktik, AlphaFold 3 mund të përdoret për zhvillimin e ilaçeve dhe metodave të trajtimit, si dhe për krijimin e proteinave të reja. Për shembull, me ndihmën e AlphaFold-it është projektuar një proteinë që është në gjendje të lidhet me qeliza të caktuara kanceroze, që mund të përdoret në terapitë anti-kancerore të gjeneratës së re. AlphaFold gjithashtu përdoret aktivisht për studimin e ndërveprimeve të antitrupave me proteinat për të kuptuar përgjigjen immumologjike të njeriut dhe për krijimin e antitrupave të rinj.
Burimi: opennet.ru
