Fojuinu pe o n ṣe ifilọlẹ iṣowo iṣoogun tuntun kan - yiyan kọọkan ti awọn oogun ti o da lori igbekale jiini eniyan. Alaisan kọọkan ni awọn orisii jiini 3 bilionu, ati olupin deede lori awọn ilana x86 yoo gba awọn ọjọ pupọ lati ṣe iṣiro. O mọ pe o le mu ilana naa pọ si lori olupin pẹlu ero isise FPGA ti o ṣe afiwe awọn iṣiro kọja ẹgbẹẹgbẹrun awọn okun. Yoo pari iṣiro genome ni bii wakati kan. Iru awọn olupin le wa ni iyalo lati Amazon Web Services (AWS). Ṣugbọn eyi ni ohun naa: alabara, ile-iwosan, jẹ iyasọtọ lodi si gbigbe data jiini sinu awọsanma olupese. Kini o yẹ ki n ṣe? Kingston ati ibẹrẹ awọsanma ṣe afihan faaji ni ifihan Supercomputing-2019 , eyi ti o yanju iṣoro yii.
![[Supercomputing 2019]. Ibi ipamọ awọsanma pupọ bi agbegbe ohun elo fun awọn awakọ Kingston DC1000M tuntun](/wp-content/uploads/2019/12/fd3773f1ac6b197bd54218061b5dd4ec.jpg)
Awọn ipo mẹta fun ṣiṣe iṣiro iṣẹ giga
Iṣiro jiini eniyan kii ṣe iṣẹ-ṣiṣe nikan ni aaye ti iširo iṣẹ-giga (HPC, Iṣiro Iṣẹ ṣiṣe giga). Awọn onimo ijinlẹ sayensi ṣe iṣiro awọn aaye ti ara, awọn onimọ-ẹrọ ṣe iṣiro awọn apakan ọkọ ofurufu, awọn oluṣowo ṣe iṣiro awọn awoṣe eto-ọrọ, ati papọ wọn ṣe itupalẹ data nla, kọ awọn nẹtiwọọki nkankikan, ati ṣe ọpọlọpọ awọn iṣiro idiju miiran.
Awọn ipo mẹta ti HPC jẹ agbara iširo nla, ibi ipamọ ti o tobi pupọ ati iyara, ati ṣiṣe nẹtiwọọki giga. Nitorinaa, adaṣe boṣewa fun ṣiṣe awọn iṣiro LPC wa ni ile-iṣẹ data ti ile-iṣẹ (lori-ile) tabi ni olupese ninu awọsanma.
Ṣugbọn kii ṣe gbogbo awọn ile-iṣẹ ni awọn ile-iṣẹ data tiwọn, ati pe awọn ti o ṣe nigbagbogbo kere si awọn ile-iṣẹ data iṣowo ni awọn ofin ti ṣiṣe awọn orisun (awọn inawo-owo ni a nilo lati ra ati imudojuiwọn ohun elo ati sọfitiwia, sanwo fun oṣiṣẹ ti o ni oye giga, ati bẹbẹ lọ) . Awọn olupese awọsanma, ni ilodi si, nfunni awọn orisun IT ni ibamu si awoṣe iye owo iṣẹ “Sanwo-bi-o-lọ”, ie. iyalo gba agbara nikan fun akoko lilo. Nigbati awọn iṣiro ba ti pari, awọn olupin le yọkuro lati akọọlẹ naa, nitorinaa fifipamọ awọn isuna IT. Ṣugbọn ti ofin ba wa tabi wiwọle ile-iṣẹ lori gbigbe data si olupese, HPC iširo ninu awọsanma ko si.
Ikọkọ MultiCloud Ibi ipamọ
Ile-iṣọna Ibi ipamọ MultiCloud Aladani jẹ apẹrẹ lati pese iraye si awọn iṣẹ awọsanma lakoko ti ara ti n lọ kuro ni data funrararẹ lori aaye ile-iṣẹ tabi ni iyẹwu aabo lọtọ ti ile-iṣẹ data nipa lilo iṣẹ iṣipopada kan. Ni pataki, o jẹ awoṣe iširo pinpin data-centric nibiti awọn olupin awọsanma n ṣiṣẹ pẹlu awọn eto ibi ipamọ latọna jijin lati awọsanma ikọkọ. Nitorinaa, ni lilo ibi ipamọ data agbegbe kanna, o le ṣiṣẹ pẹlu awọn iṣẹ awọsanma lati ọdọ awọn olupese ti o tobi julọ: AWS, MS Azure, Google Cloud Platform, bbl
Ni afihan apẹẹrẹ ti imuse ti PMCS ni ifihan Supercomputing-2019, Kingston ṣe afihan apẹẹrẹ ti eto ibi ipamọ data iṣẹ-giga (SSD) ti o da lori awọn awakọ DC1000M SSD, ati ọkan ninu awọn ibẹrẹ awọsanma ṣafihan sọfitiwia iṣakoso StorOne S1 fun sọfitiwia- ibi ipamọ asọye ati awọn ikanni ibaraẹnisọrọ igbẹhin pẹlu awọn olupese awọsanma pataki.
O yẹ ki o ṣe akiyesi pe PMCS, gẹgẹbi awoṣe ṣiṣẹ ti iširo awọsanma pẹlu ibi ipamọ ikọkọ, jẹ apẹrẹ fun ọja Ariwa Amerika pẹlu isopọpọ nẹtiwọọki ti o dagbasoke laarin awọn ile-iṣẹ data ti o ni atilẹyin lori awọn amayederun AT&T ati Equinix. Nitorinaa, ping laarin eto ibi ipamọ awọ ni eyikeyi Equinix Cloud Exchange node ati awọsanma AWS kere ju milimita 1 (orisun: ).
Ninu ifihan ti faaji PMCS ti o han ni ifihan, eto ibi ipamọ lori awọn disiki DC1000M NVMe wa ni agbegbe, ati awọn ẹrọ foju ti a fi sori ẹrọ ni awọn awọsanma AWS, MS Azure, ati Google Cloud Platform, eyiti o wọ ara wọn. Ohun elo olupin-olupin ṣiṣẹ latọna jijin pẹlu eto ipamọ Kingston ati awọn olupin HP DL380 ni ile-iṣẹ data ati, nipasẹ awọn amayederun ikanni ibaraẹnisọrọ Equinix, wọle si awọn iru ẹrọ awọsanma ti awọn olupese pataki ti a mẹnuba loke.
![[Supercomputing 2019]. Ibi ipamọ awọsanma pupọ bi agbegbe ohun elo fun awọn awakọ Kingston DC1000M tuntun](/wp-content/uploads/2019/12/a0204cb962dbb632b0175758073baf94.jpg)
Gbe lati igbejade ti Ibi ipamọ MultiCloud Aladani ni ifihan Supercomputing-2019. Orisun: Kingston
Sọfitiwia ti iṣẹ ṣiṣe kanna fun iṣakoso faaji ti ibi ipamọ multicloud ikọkọ jẹ funni nipasẹ awọn ile-iṣẹ oriṣiriṣi. Awọn ofin fun faaji yii tun le dun ni oriṣiriṣi - Ibi ipamọ MultiCloud Aladani tabi Ibi ipamọ Aladani fun Awọsanma.
"Awọn supercomputers ti ode oni nṣiṣẹ ọpọlọpọ awọn ohun elo HPC ti o wa ni iwaju ti awọn ilọsiwaju, lati epo ati gaasi ṣawari si asọtẹlẹ oju ojo, awọn ọja owo ati idagbasoke imọ-ẹrọ titun," Keith Schimenti, alakoso iṣakoso SSD iṣowo ni Kingston sọ. “Awọn ohun elo HPC wọnyi nilo ibaamu ti o tobi pupọ laarin iṣẹ ṣiṣe ati iyara I/O. A ni igberaga lati pin bi awọn ojutu Kingston ṣe n ṣe iranlọwọ fun wiwakọ awọn aṣeyọri ni ṣiṣe iṣiro, jiṣẹ iṣẹ ti o nilo ni awọn agbegbe iširo ti o ga julọ ati awọn ohun elo.”
DC1000M wakọ ati apẹẹrẹ ti eto ipamọ ti o da lori rẹ
DC1000M U.2 NVMe SSD jẹ apẹrẹ nipasẹ Kingston fun ile-iṣẹ data ati pe o jẹ apẹrẹ pataki fun data-lekoko ati awọn ohun elo HPC gẹgẹbi itetisi atọwọda (AI) ati awọn ohun elo ikẹkọ ẹrọ (ML).
![[Supercomputing 2019]. Ibi ipamọ awọsanma pupọ bi agbegbe ohun elo fun awọn awakọ Kingston DC1000M tuntun](/wp-content/uploads/2019/12/e1409a4232f46335a84d69412009e5f6.jpg)
DC1000M U.2 NVMe 3.84TB wakọ. Orisun: Kingston
Awọn awakọ DC1000M U.2 da lori 96-Layer Intel 3D NAND iranti, ti iṣakoso nipasẹ Silicon Motion SM2270 oludari (PCIe 3.0 ati NVMe 3.0). Ohun alumọni išipopada SM2270 jẹ oluṣakoso NVMe ile-iṣẹ 16-lane kan pẹlu wiwo PCIe 3.0 x8, ọkọ akero data 32-bit DRAM meji ati awọn ilana ARM Cortex R5 meji.
DC1000M ti awọn agbara oriṣiriṣi ni a funni fun itusilẹ: lati 0.96 si 7.68 TB (awọn agbara olokiki julọ ni a gbagbọ pe 3.84 ati 7.68 TB). Iṣẹ ṣiṣe awakọ naa jẹ 800 ẹgbẹrun IOPS.
![[Supercomputing 2019]. Ibi ipamọ awọsanma pupọ bi agbegbe ohun elo fun awọn awakọ Kingston DC1000M tuntun](/wp-content/uploads/2019/12/9f886001f918e4d1f9ba5cfb2bbc3ae4.jpg)
Eto ipamọ pẹlu 10x DC1000M U.2 NVMe 7.68 TB. Orisun: Kingston
Gẹ́gẹ́ bí àpẹẹrẹ ètò ìpamọ́ fún àwọn ohun èlò HPC, Kingston gbé ojútùú rack-mount kalẹ̀ ní Supercomputing 2019 pẹ̀lú àwọn awakọ̀ DC1000M U.2 NVMe 10, ọ̀kọ̀ọ̀kan pẹ̀lú agbára 7.68 TB. Ètò ìpamọ́ náà dá lórí SB122A-PH, platform form factor 1U láti ọ̀dọ̀ AIC. Àwọn olùṣiṣẹ́: 2x Intel Xeon CPU E5-2660, Kingston DRAM 128 GB (8x16 GB) DDR4-2400 (Nọ́mbà Apá: KSM24RS4/16HAI). Ètò ìṣiṣẹ́ náà jẹ́ Ubuntu 18.04.3 LTS, Linux Ìṣẹ̀dá ìpele kernel 5.0.0-31. Ìdánwò gfio v3.13 (Ẹ̀dánwò I/O tó rọrùn) fi hàn pé iṣẹ́ kíkà rẹ̀ jẹ́ IOPS mílíọ̀nù 5.8 pẹ̀lú agbára ìṣiṣẹ́ 23.8 Gbps.
Eto ibi ipamọ ti a gbekalẹ ṣafihan awọn abuda iwunilori ni awọn ofin kika iduroṣinṣin ti 5,8 million IOPS (awọn iṣẹ igbewọle-jade fun iṣẹju keji). Eyi jẹ awọn aṣẹ titobi meji ni iyara ju awọn SSD fun awọn ọna ṣiṣe ọja lọpọlọpọ. Iyara kika yii nilo fun awọn ohun elo HPC ti n ṣiṣẹ lori awọn ilana pataki.
Awọsanma iširo HPC pẹlu ikọkọ ipamọ ni Russia
Iṣẹ-ṣiṣe ti ṣiṣe iširo iṣẹ-giga ni olupese, ṣugbọn titoju ti ara data lori ile-iṣẹ, tun jẹ pataki fun awọn ile-iṣẹ Russia. Ọrọ miiran ti o wọpọ ni iṣowo ile ni nigbati, nigba lilo awọn iṣẹ awọsanma ajeji, data gbọdọ wa ni agbegbe ti Russian Federation. A beere fun asọye lori awọn ipo wọnyi ni ipo ti olupese awọsanma Selectel gẹgẹbi alabaṣepọ igba pipẹ ti Kingston.
“Ni Russia, o ṣee ṣe lati kọ iru faaji kan, pẹlu iṣẹ ni Ilu Rọsia ati gbogbo awọn iwe ijabọ fun ẹka iṣiro alabara. Ti ile-iṣẹ kan ba nilo lati ṣe iširo iṣẹ ṣiṣe giga nipa lilo awọn eto ibi-itọju agbegbe, a wa ni awọn olupin iyalo Selectel pẹlu awọn ilana ti awọn oriṣiriṣi oriṣiriṣi, pẹlu , tabi olona-mojuto CPUs. Ni afikun, nipasẹ awọn alabaṣiṣẹpọ, a ṣeto fifisilẹ ti ikanni opiti iyasọtọ laarin ọfiisi alabara ati ile-iṣẹ data wa, ”awọn asọye Alexander Tugov, Oludari Idagbasoke Awọn iṣẹ ni Selectel. - Onibara tun le gbe eto ipamọ rẹ sori awọ ni yara kọnputa pẹlu ipo iwọle pataki kan ati ṣiṣe awọn ohun elo mejeeji lori awọn olupin wa ati ninu awọn awọsanma ti awọn olupese agbaye AWS, MS Azure, Google Cloud. Nitoribẹẹ, idaduro ifihan agbara ni ọran igbeyin yoo ga ju ti eto ibi ipamọ alabara wa ni AMẸRIKA, ṣugbọn asopọ asopọ awọsanma pupọ kan yoo pese. ”
Ninu nkan ti o tẹle a yoo sọrọ nipa ojutu Kingston miiran, eyiti a gbekalẹ ni ifihan Supercomputing 2019 (Denver, Colorado, AMẸRIKA) ati pe a pinnu fun awọn ohun elo ikẹkọ ẹrọ ati itupalẹ data nla nipa lilo awọn GPUs. Eyi jẹ imọ-ẹrọ Ibi ipamọ GPUDirect, eyiti o pese gbigbe data taara laarin ibi ipamọ NVMe ati iranti ero isise GPU. Ati ni afikun, a yoo ṣe alaye bi a ṣe ṣakoso lati ṣaṣeyọri iyara kika data ti 5.8 milionu IOPS ni eto ibi ipamọ agbeko lori awọn disiki NVMe.
Fun alaye diẹ sii nipa awọn ọja Imọ-ẹrọ Kingston, jọwọ ṣabẹwo .
orisun: www.habr.com
