Covid19、你的社會和你——從數​​據科學的角度來看。 譯文 Jeremy Howard 和 Rachel Thomas 的文章 (fast.ai)

嘿哈布爾! 我提請您注意這篇文章的翻譯 “Covid-19、您的社區和您——數據科學的視角” 作者:傑里米·霍華德和雷切爾·托馬斯。

譯者

在俄羅斯,Covid-19的問題目前還沒有那麼嚴重,但值得理解的是,兩週前在義大利,情況還沒有那麼嚴重。 而且提前告知公眾,也比事後後悔好。 在歐洲,許多人並不認真對待這個問題,從而將許多其他人置於危險之中 - 正如現在在西班牙所顯而易見的那樣(病例數量迅速增加)。

文章

我們是資料科學家,我們的工作是分析和解釋數據。 有關 covid-19 的數據令人擔憂。 我們社會中最脆弱的群體,即老年人和低收入人群,面臨的風險最大,但為了控制疾病的傳播和影響,我們都必須改變我們的習慣行為。 經常徹底洗手、避開人群、取消計劃的活動並避免觸摸臉部。 在這篇文章中,我們將解釋為什麼我們擔心——以及為什麼你也應該擔心。 伊森·艾利(Ethan Alley,一家開發降低流行病風險技術的非營利組織主席)所著的《新冠疫情簡述》是一篇出色的文章,總結了所有關鍵訊息。

我們需要一個運作良好的醫療保健系統。

就在幾年前,我們中的一個人(雷切爾)被診斷出患有腦部感染,大約四分之一的感染者因此死亡。 三分之一的人終生遭受精神障礙。 許多人的視力和聽力受到終身損害。 雷切爾抵達醫院停車場時情況非常嚴重,但她很幸運,並得到了她需要的關注、診斷和治療。 直到最近,雷切爾還絕對健康。 快速進入急診室很可能挽救了她的生命。

現在,讓我們來談談 covid-19 以及未來幾週和幾個月內處於類似情況的人可能會發生什麼。 感染 covid-19 的人數每 3-6 天就會翻倍。 以每三天翻一番的速度,感染人數可能在三週內增加3倍(實際上沒那麼簡單,但我們不要被細節沖昏了頭)。 十分之一 感染者需要住院數週,其中許多人需要吸氧氣。 儘管這只是病毒傳播的開始,但有些地區的醫院已經沒有空床位了,人們無法接受必要的治療(不僅針對冠狀病毒,還針對其他疾病,例如,雷切爾需要的重要療法)。 例如,在義大利,就在一週前,政府宣佈局勢已得到控制,現在約有 16 萬人被鎖在家裡(更新:本文發布 6 小時後,義大利封鎖了整個國家),以及類似的帳篷正在建立,以便以某種方式應對病人的流動:

Covid19、你的社會和你——從數​​據科學的角度來看。 譯文 Jeremy Howard 和 Rachel Thomas 的文章 (fast.ai)
義大利的醫療帳篷。
負責義大利北部危機局勢的地區部門負責人安東尼奧佩森蒂博士, 他說,:“我們別無選擇,只能在走廊、手術室、病房組織重症監護……倫巴第最好的衛生系統之一正處於崩潰的邊緣。”

這不像流感

流感的死亡率估計為0.1%。 馬克‧利普斯蒂奇 (Mark Lipstitch),哈佛大學傳染病動力學中心主任 評估 冠狀病毒的死亡率為 1-2%。 最新流行病學模型 研究發現,中國 1.6 月的死亡率為 16%,是流感的 10 倍(這項估計可能不準確,因為當醫療保健系統失效時,死亡率會上升)。 正面評估:今年死於冠狀病毒的人數是死於流感的人數的 XNUMX 倍(並且 прогноз Airbnb 前數據科學總監 Elena Grewal 表示,在最壞的情況下,死亡人數可能會增加 100 倍)。 而且這還沒有考慮到如上所述對醫療系統的巨大影響。 可以理解的是,有些人試圖說服自己這種情況並不新鮮,這種疾病與流感非常相似——因為他們確實不想接受一個陌生的現實。

我們的大腦無法直觀地理解患病人數的指數增長。 因此,我們必須以科學家的身份來分析這種情況,而不是訴諸直覺。

Covid19、你的社會和你——從數​​據科學的角度來看。 譯文 Jeremy Howard 和 Rachel Thomas 的文章 (fast.ai)
兩週後會是什麼樣子? XNUMX個月?

平均而言,每個流感患者會感染約 1.3 人。 這被稱為“R0”流感。 如果 R0 小於 1.0,感染不會擴散並停止。 值較高時,感染會擴散。 目前,冠狀病毒在中國境外的 R0 為 2-3。 差異看似很小,但經過 20 個「代」的感染者傳遞感染後,將有 0 人感染 R1.3 146,而 0 萬人將感染 R2.5 36! (當然,這是非常近似的,而且這種計算忽略了許多因素,但在所有其他條件相同的情況下,它合理地說明了冠狀病毒和流感之間的相對差異)。

請注意,R0 不是基本疾病參數。 它取決於響應,並且可能隨時間而變化。 值得注意的是,在中國,冠狀病毒的R0已大幅下降,現已接近1.0! 如何? - 你問。 以在美國等國家難以想像的規模採取所有必要的措施:完全關閉特大城市並開發一個可以每週監測超過一百萬人狀況的測試系統。

社群媒體(包括像伊隆馬斯克這樣的熱門人物)對於後勤成長和指數成長之間的差異存在著許多困惑。 邏輯成長是指S形式的流行病傳播模式。指數成長當然不可能永遠持續下去-那樣的話,感染人數就會比地球上的總人口還要多! 因此,感染率總是會減慢,隨著時間的推移,我們會出現 S 形(稱為 S 形)增長。 同時,身高的降低並不是無緣無故的──這不是魔法。 主要原因:

  • 社會的大規模、有效的行動。
  • 感染者人數較多,由於缺乏健康人,導致潛在受害者人數較少。

因此,依賴物流成長來控制疫情是不符合邏輯的。

很難憑直覺了解冠狀病毒對當地社區的影響的另一個原因是感染和住院之間的時間間隔很長——通常為 11 天左右。 這似乎是一個很短的時期,但當你注意到醫院人滿為患時,感染人數將達到感染人數的 5 至 10 倍的水平。

請注意,一些早期跡象表明,對您所在地區的影響可能在一定程度上取決於氣候。 在文章《溫度和緯度分析可預測 COVID-19 的潛在傳播和季節性「它說,到目前為止,這種疾病已經在溫帶氣候中傳播(對我們來說不幸的是,我們居住的舊金山的氣溫正好在這個範圍內;包括倫敦在內的歐洲主要中心也落在這個範圍內)。

“不要恐慌。 「保持冷靜」沒有幫助

對社群媒體上呼籲保持警惕的最常見反應之一是「不要驚慌」或「保持冷靜」。 至少可以說,這沒有幫助。 沒有人認為恐慌是擺脫困境的最好方法。 然而,出於某種原因,「保持冷靜」在某些圈子裡是一種非常流行的反應(但在流行病學家中卻不然,他們的工作就是追蹤這些事情)。 也許「保持冷靜」可以幫助人們為自己的不作為辯護,或者感覺自己比想像中處於恐慌狀態的人優越。

但「保持冷靜」很容易導致無法做好準備和應對。 在中國,到今天的美國州時,已有10萬人被隔離,並建造了兩家新醫院。 義大利等太久了,就在今天(8 月 1492 日星期日),儘管有 133 萬人被封鎖,但他們還是宣布新增 16 例感染病例和 2 例死亡。 根據我們目前所能確認的最佳訊息,就在兩到三週前,義大利的情況與今天的美國和英國類似(就感染統計而言)。
請注意,幾乎所有與冠狀病毒有關的事情都懸而未決。 我們不知道感染率或死亡率,我們不知道它在表面存活多久,我們不知道它是否能存活或在炎熱的氣候中如何傳播。 我們所擁有的只是基於我們所能掌握的最佳資訊的最佳猜測。 請記住,大部分資訊都在中國,用中文提供。 現在了解中國經驗的最好方法就是閱讀報告 2019年世界衛生組織-中國冠狀病毒病聯合​​考察團,基於來自中國、德國、日本、韓國、奈及利亞、俄羅斯、新加坡、美國和世界衛生組織的 25 名專家的聯合研究。

當存在一些不確定性時——也許不會出現全球大流行,也許一切都會過去而不會導致醫院系統崩潰——這並不意味著正確的決定是不採取任何行動。 在任何情況下,這都過於投機且不是最理想的。 義大利和中國等國家似乎也不太可能在沒有充分理由的情況下關閉其大部分經濟。 而這與我們在醫療系統無法應對的疫區看到的情況並不相符(例如,在義大利,462個帳篷用於預檢,重症監護病人被 搬家了 來自受污染地區)。

相反,深思熟慮、明智的答案是遵循專家建議的步驟來防止感染傳播:

  • 避開人群。
  • 取消活動。
  • 遠端工作(如果可能)。
  • 進出家門時要洗手,外出時也要經常洗手。
  • 避免觸摸你的臉,尤其是在外面(不容易!)。
  • 對錶面和袋子進行消毒(病毒可能在表面上存活長達 9 天,儘管尚不確定)。

這不僅僅關係到你

如果您年齡在 50 歲以下,並且沒有免疫系統薄弱、心血管疾病、吸煙或其他慢性病等危險因素,那麼您可以放心:您不太可能死於冠狀病毒。 但你如何反應仍然非常重要。 您被感染的可能性仍然很高 - 如果您被感染,您也很有可能會感染其他人。 平均而言,每個感染者會傳染兩個以上的人,並且在症狀出現之前就具有傳染性。 如果您有照顧的父母或祖父母,並且您計劃與他們共度時光,您可能會在稍後發現您感染了冠狀病毒。 這是一個將伴隨一生的沉重負擔。

即使您沒有與 50 歲以上的人接觸,您患有慢性病的同事和熟人可能比您意識到的還要多。 研究顯示由於以下原因,很少有人在工作中談論他們的健康 害怕受到歧視。 我們都處於危險之中,但與我們交往的許多人可能不知道這一點。

當然,這不僅適用於您周圍的人。 這也是一個非常重大的倫理問題。 任何努力減緩病毒傳播的人都可以幫助整個社區減少病毒的傳播。 正如 Zeynep Tufekci 所寫: 在《科學美國人》中:“為幾乎肯定會在全球範圍內傳播的病毒做好準備……是你能做的對社會最有益、最無私的事情之一。” 她繼續說:

我們必須做好準備——不是因為我們個人感到危險,而是為了減少我們每個人的危險。 我們必須做好準備,不是因為世界末日即將到來,而是因為我們可以改變社會所面臨風險的各個面向。 確實,您需要做好準備,因為您的鄰居需要它 - 尤其是您年老的鄰居、在醫院工作的鄰居、患有慢性病的鄰居以及由於缺乏時間或資源而無法做好準備的鄰居。

它影響了我們個人。 我們在 fast.ai 完成的最大、最重要的課程代表了我們多年工作的頂峰,並計劃於一周後在舊金山大學開始。 上週三(4 月 XNUMX 日)我們決定在線上提供整個課程。 我們是最早切換的課程之一 онлайн。 我們為什麼要這樣做? 因為上周初我們意識到,透過舉辦這門課程,我們間接鼓勵了數百人在封閉的空間內進行大規模聚集,在幾週的時間內多次聚集。 在這種情況下,將一群人聚集在封閉的空間中是最糟糕的事情。 我們覺得有義務阻止這種情況發生。 這個決定是極為困難的。 每年與學生一起工作的時間是我最大的快樂和最有成效的時間之一。 我們的學生將從世界各地飛來參加這門課程 - 我們不想讓他們失望。

但我們知道這是正確的決定,因為否則我們可能會增加疾病在我們社區的傳播。

我們必須拉平曲線

這非常重要,因為如果我們減少社區中的感染傳播,我們將為該社區的醫院提供時間來應對受感染的患者和他們必須治療的常規患者。 這稱為“壓平曲線”,下圖清楚地顯示了這一點:

Covid19、你的社會和你——從數​​據科學的角度來看。 譯文 Jeremy Howard 和 Rachel Thomas 的文章 (fast.ai)

前國家衛生資訊技術協調員法爾扎德·莫斯塔哈里(Farzad Mostashari)解釋說:「每天都有新病例,沒有旅行史或與已知病例有聯繫,我們知道,由於檢測延誤,這些病例只是冰山一角。 這意味著感染人數將在未來兩週內大幅增加……面對指數級傳播試圖施加小限制,就像房子著火時集中精力尋找火花一樣。 當這種情況發生時,策略需要改變為緩解預防措施,以減緩傳播並減少對公共健康的影響。” 如果我們能夠大幅減少傳播,使我們的醫院能夠應對這種壓力,那麼人們就能獲得治療。 但如果生病的人太多,許多需要住院的人就得不到治療。

從數學角度看是這樣的 根據 莉茲·斯佩克特:

在美國,每 1000 人擁有 2.8 張病床。 擁有330億人口,我們約有65萬個座位。 通常這些地方的 330% 已被佔用。 這使得全國有10萬張免費病床(考慮到季節性疾病,這段時期可能會略少一些)。 我們以義大利的數據為基礎,假設有8%的病例需要住院治療。 (請記住,對於許多患者來說,住院治療會持續數週,換句話說,隨著床位擠滿了冠狀病毒患者,週轉速度將極其緩慢)。 據此預計,到6月20日,美國醫院所有空床位將被填滿。 (當然,這並不是說醫院床位的配備有多好,可以隔離具有高度傳染性病毒的患者。)如果我們對嚴重病例的數量有誤,這只會改變醫院床位填滿所需的時間,即每個方向2天。 如果 5% 的病例需要住院治療,那麼 14 月 2.5 日左右,床位就會用完。 如果只有 20%——~XNUMX 月 XNUMX 日。 XNUMX% 將我們帶到 XNUMX 月 XNUMX 日。 當然,這是假設不迫切需要醫院床位(不是針對冠狀病毒),這是值得懷疑的。 醫療保健系統超負荷、處方短缺等,通常是獨立和自我組織的慢性病患者可能會病情嚴重,需要重症監護和住院治療。

差異在於社會的反應

正如我們已經討論過的,這個數學並不準確——中國已經表明,可以透過緊急措施來減少傳播。 成功應對的另一個很好的例子是越南,其中,除其他外,一則全國性廣告(帶有一首朗朗上口的歌曲!)迅速動員了社會,並說服人們改變自己的行為,使其在這種情況下更容易被接受。

這不僅僅是一個假設的情況,1918 年西班牙流感期間就清楚地表明了這一點。 在美國,兩個城市對疫情表現出截然不同的反應:費城計劃舉行200.000萬人遊行,為戰爭籌集資金;聖路易斯啟動了盡量減少社交接觸的策略,以減少病毒的傳播;而聖路易斯則啟動了一項減少社交接觸的策略,以減少病毒的傳播。 所有公共活動都被取消。 這就是每個城市的死亡統計數據,如圖所示 訴訟中的國家科學院院士:

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對 1918 年西班牙流感的不同反應

費城的局勢很快就失控了 甚至沒有棺材或太平間 為了埋葬這麼多死者。

理查德貝瑟 (Richard Besser) 在 1 年 H1N2009 流感大流行期間擔任疾病預防與控制中心主任, 索賠在美國,“你的危險風險以及保護自己和家人的能力取決於收入、獲得醫療保健的機會、移民身份和其他參數。” 它表明:

當老年人和殘疾人士的日常節奏和支持系統無法正常運作時,他們面臨的風險就會增加。 那些無法獲得醫療保健的人,包括村莊和當地社區,也將受到最近中心的距離問題的影響。 生活在封閉區域(社會住宅、監獄、庇護所甚至無家可歸者)的人們可能會一波又一波地受到感染,正如我們在華盛頓州所看到的那樣。 而低薪工人、無合法身分工人和不穩定的工作時間等脆弱性將在這場危機中暴露出來。 問問 60% 的美國小時工,他們休假或休假有多容易。

美國就業統計局顯示, 少於三分之一 薪資較低的人有薪病假。

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大多數低收入美國人沒有帶薪病假,因此他們必須去工作。

我們沒有關於美國 Covid-19 的可靠信息

美國最大的問題之一是缺乏檢查。 而所進行的檢查結果並沒有正確發布,這意味著我們不知道到底發生了什麼事。 美國食品和藥物管理局前局長斯科特·戈特利布(Scott Gottlieb) 解釋說,西雅圖的檢測效果更好,因此我們掌握了有關該地區感染的信息:「我們之所以知道西雅圖早期的covid -19 感染情況,是因為西雅圖的密切關注獨立研究人員。 其他城市從未有過如此全面的監控。 所以目前可能找不到美國的其他熱點。” 根據 大西洋副總統彭斯承諾本週將進行約 1.5 萬次檢測,但在整個美國,迄今為止只有 2000 人接受了檢測。 基於工作 COVID跟踪項目《大西洋月刊》的羅賓遜·邁耶和亞歷克西斯·馬德里加爾說:

我們收集的資訊表明,美國對 covid-19 及其引起的感染的反應慢得驚人,尤其是與其他已開發國家相比。 美國疾病管制與預防中心 8 天前證實,該病毒正在美國社區內傳播,感染的美國人沒有出國旅行過,也沒有與出國旅行的人接觸過。 在韓國,在首次國內感染後的第一周內,就有超過 66.650 人接受了檢測,並且很快就學會了每天檢測 10.000 人。

部分問題在於它已經達到了政治層面。 尤其是唐納德·川普明確表示,他希望將「數字」(即美國的感染人數)保持在較低水平。 (如果您想了解有關此主題的更多信息,請閱讀有關數據科學倫理的文章“指標問題是人工智慧的一個基本問題」)。Google人工智慧主管, 傑夫·迪恩,寫道 鳴叫 關於政治假資訊問題:

當我在世界衛生組織工作時,我是國際愛滋病計畫(現為聯合國愛滋病規劃署)的一部分,該計畫是為對抗愛滋病大流行而創建的。 工作人員、醫生和科學家都完全專注於解決這個問題。 在危機期間,需要清晰準確的資訊來幫助每個人(國家、州、地方政府、公司、非營利組織、學校、家庭和個人)就如何採取行動做出明智的決定。 有了正確的資訊和措施來聽取最優秀的專家和科學家的意見,我們就可以克服愛滋病毒/愛滋病或 COVID-19 等挑戰。 由於政治利益驅動的虛假訊息,如果在疫情日益嚴重的情況下不迅速、果斷地做出反應,以及積極鼓勵使疾病更快傳播的行為,則確實存在使情況變得更糟的威脅。 目睹這種情況的發展令人難以忍受。

在透明度方面,政客似乎並不熱衷於改變現狀。 衛生部長亞歷克斯·阿扎爾 據《連線》報道 「開始談論醫務人員為了解患者是否感染新型冠狀病毒而進行的測試。 缺乏這些測試意味著有關該疾病在美國的傳播和兇猛程度的流行病學資訊存在危險的差距,而政府缺乏透明度則使情況變得更加嚴重。 阿扎爾試圖說已經訂購了新的測試,唯一缺少的是進行測試的品質控制。” 但是,他們繼續:

川普隨後突然打斷了阿札爾的話。 「但我認為,這一點很重要,任何今天或昨天需要測試的人都會得到測試。 他們在這裡,他們有測試,而且測試很棒。 任何需要測試的人都會得到測試,」川普說。 這不是真的。 副總統彭斯告訴記者,美國的檢測供不應求。

其他國家的反應比美國更快、更顯著。 東南亞許多國家都表現不錯,包括R0達到0.3的台灣,以及已被提議計入的新加坡 COVID-19 反應模型。 但現在不只是亞洲;還有亞洲。 例如,在法國,任何超過 1000 人的集會都是被禁止的,三個區域的學校也被關閉。

結論

Covid-19 是一個重要的社會議題,我們可以而且必須努力減少疾病的傳播。 它的意思是:

  • 避開大量人群
  • 取消活動
  • 如果可能的話在家工作
  • 進出家門時要洗手,外出時也要經常洗手。
  • 避免觸摸臉部,尤其是在戶外

注意:由於必須儘早發表本文,因此我們在編制我們所依據的引文和作品列表時沒有那麼仔細。

如果我們錯過了什麼,請告訴我們。

感謝 Sylvain Gugger 和 Alexis Gallagher 的回饋和評論。

來源: www.habr.com

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