د 2018 په دوبي کې، د بایو انفارماتیک په برخه کې د دوبي کلنۍ ښوونځی سینټ پیټرزبورګ ته نږدې په لاره واچول شو، چیرې چې 100 فارغ او فارغ شوي زده کونکي د بایو انفارماتیک زده کړې لپاره راغلل او د بیولوژي او طب په مختلفو برخو کې یې د کارولو په اړه زده کړه وکړه.
د ښوونځي اصلي تمرکز د سرطان په څیړنه کې و، مګر د بایو انفارماتیک په نورو برخو کې لیکچرونه شتون درلود، د تکامل څخه نیولې د واحد حجرو ترتیب کولو ډیټا تحلیل پورې. د اونۍ په جریان کې ، هلکانو د راتلونکي نسل ترتیب کولو ډیټا سره کار کول زده کړل ، په Python او R کې برنامه شوي ، د بایو انفارماتیک معیاري وسیلې او چوکاټونه کارول شوي ، د تومورونو مطالعې پرمهال د سیسټم بیولوژي ، نفوس جینیات او د درملو ماډلینګ میتودونو سره آشنا شوي ، او نور زیات.
لاندې به تاسو په ښوونځي کې د ورکړل شوي 18 لیکچرونو ویډیو ومومئ ، د لنډ توضیحاتو او سلایډونو سره. هغه چې د ستوري "*" سره په نښه شوي خورا بنسټیز دي او د مخکینۍ تیاری پرته لیدل کیدی شي.
1*. آنکوجینومکس او شخصي آنکولوژي | میخایل پیانتیتسکي، د بایو میډیکل کیمیا د څیړنې انسټیټیوټ
|
میخایل د تومور جینومیک په اړه په لنډه توګه خبرې وکړې او دا چې څنګه د سرطان حجرو تکامل پوهه موږ ته اجازه راکوي چې په آنکولوژي کې عملي ستونزې حل کړو. استاد د آنکوجینز او تومور ماتونکو ترمنځ توپیر تشریح کولو ته ځانګړې پاملرنه وکړه، د "سرطان جین" لټون کولو میتودونه او د تومور مالیکول فرعي ډولونه پیژندل. په پایله کې، میخایل د oncogenomics راتلونکي ته پاملرنه وکړه او هغه ستونزې چې کیدای شي رامنځته شي.
2* د موروثي تومور سنډرومونو جنیټیک تشخیص | اندری افاناسیف، yRisk
|
انډری د وراثتي تومور سنډرومونو په اړه خبرې وکړې او د دوی بیولوژي، ایپیډیمولوژي او کلینیکي څرګندونې یې بحث وکړ. د لیکچر یوه برخه د جینیاتي ازموینې مسلې ته وقف شوې - څوک چې اړتیا ورته لري، د دې لپاره څه ترسره شوي، د معلوماتو پروسس کولو او د پایلو تشریح کولو کې کومې ستونزې رامینځته کیږي، او بالاخره، دا ناروغانو او د دوی خپلوانو ته کومې ګټې راوړي. .
۳* د پان سرطان اتلس | جرمن ډیمیدوف، BIST/UPF
|
د سرطان د جینومکس او ایپیګینومکس په برخه کې د لسیزو څیړنو سره سره، د دې پوښتنې ځواب چې "څنګه، چیرته او ولې د تومور سنډرومونه رامینځته کیږي" لا تر اوسه نیمګړی دی. د دې لپاره یو دلیل د لوی مقدار ډیټا معیاري استملاک او پروسس کولو اړتیا ده ترڅو د کوچني اندازې اغیزې کشف کړي چې په محدود ډیټا سیټ کې کشف کول ګران دي (هغه اندازه چې په یو یا څو لابراتوارونو کې د مطالعې لپاره ځانګړي وي) ، مګر کوم چې په مجموع کې د سرطان په څیر پیچلې او څو اړخیزه ناروغۍ کې لوی رول لوبوي.
په تیرو څو کلونو کې، د نړۍ ډیری پیاوړو څیړونکو ډلو، چې د دې ستونزې څخه خبر دی، د دې ټولو اغیزو د کشف او تشریح کولو لپاره د ځواکونو سره یوځای کولو هڅې پیل کړې. هرمن د دغو نوښتونو څخه یو (د PanCancer Atlas) او د لابراتوارونو د دې کنسرسیوم د کار د یوې برخې په توګه ترلاسه شوي پایلې په اړه خبرې وکړې او په دې لیکچر کې د سیل په ځانګړې ګڼه کې خپره شوه.
4. ChIP-Seq د ایپی جینیټیک میکانیزمونو په مطالعه کې | اولیګ شپینوف، د جیټ برینس څیړنه
|
د جین بیان تنظیم په مختلفو لارو ترسره کیږي. په خپل لیکچر کې، اولیګ د هسټون تعدیل له لارې د ایپیګینیټیک مقرراتو په اړه خبرې وکړې، د دې پروسو مطالعه د ChIP-seq میتود او میتودونو په کارولو سره د ترلاسه شویو پایلو تحلیل لپاره.
5. د سرطان په څیړنه کې ملټيومکس | Konstantin Okonechnikov، د آلمان د سرطان د څیړنې مرکز
|
په مالیکولر بیولوژي کې د تجربوي ټیکنالوژیو پراختیا دا امکان رامینځته کړی چې په حجرو ، غړو یا حتی ټول ارګانیزم کې د پراخه فعالیت پروسو مطالعه یوځای کړي. د بیولوژیکي پروسو د اجزاوو تر مینځ د اړیکو رامینځته کولو لپاره، دا اړینه ده چې ملټيومکس وکاروئ، کوم چې د جینومکس، ټرانسکریټومکس، ایپیګینومکس او پروټومکس څخه پراخه تجربه لرونکي ډاټا سره یوځای کوي. کونسټنټین د سرطان د څیړنې په برخه کې د ماشومانو د آنکولوژي تمرکز سره د ملټي اومکس کارولو روښانه مثالونه وړاندې کړل.
6. د واحد حجرو تحلیل استقامت او محدودیتونه | کونستانتین اوکونیکوف
|
د واحد-حجري RNA-seq په اړه یو ډیر مفصل لیکچر او د دې ډیټا تحلیل کولو میتودونو ، او همدارنګه د مطالعې پرمهال د څرګندو او پټو ستونزو د لرې کولو لارې.
7. د واحد حجرې RNA-seq ډیټا تحلیل | Konstantin Zaitsev، په سینټ لوئس کې د واشنګټن پوهنتون
|
د واحد حجرو ترتیب په اړه تعارفي لیکچر. کونسټنټین د ترتیب کولو میتودونو ، د لابراتوار کار کې ستونزې او د بایو انفارماتیک تحلیلونو او د دوی د لرې کولو لارې په اړه بحث کوي.
8. د نانوپور ترتیب په کارولو سره د عضلاتو ډیسټروفي تشخیص | پاول Avdeev، د جورج واشنګټن پوهنتون
|
د اکسفورډ نانوپور ټیکنالوژۍ په کارولو سره ترتیب کول ګټې لري چې د ناروغیو د جنیټیک لاملونو پیژندلو لپاره کارول کیدی شي لکه د عضلاتو ډیسټروفي. په خپل لیکچر کې، پاول د دې ناروغۍ د تشخیص لپاره د پایپ لاین د پراختیا په اړه خبرې وکړې.
۹* د جینوم ګراف استازیتوب | الیا منکین، د پنسلوانیا ایالت پوهنتون
|
د ګراف ماډلونه د ډیری ورته ترتیبونو کمپیکٹ نمایش ته اجازه ورکوي او ډیری وختونه په جینومیکونو کې کارول کیږي. الیا په دې اړه په تفصیل سره خبرې وکړې چې څنګه جینومیک ترتیبونه د ګرافونو په کارولو سره بیارغول کیږي، څنګه او ولې د بروین ګراف کارول کیږي، دا ډول "ګراف" طریقه څومره د بدلون لټونونو دقت لوړوي، او د ګرافونو کارولو سره کومې نا حل شوي ستونزې لاهم پاتې دي.
۱۰* په زړه پورې پروټومکس | پاول سینیتسین، د بایو کیمیا د میکس پلانک انسټیټیوټ (10 برخې)
, |,
پروټینونه په ژوندي موجوداتو کې د ډیری بایو کیمیکل پروسو لپاره مسؤل دي، او تر دې دمه پروټومیکونه په یو وخت کې د زرګونو پروټینونو حالت نړیوال تحلیل لپاره یوازینۍ میتود دی. د حل شوي ستونزو لړۍ خورا اغیزمنه ده - د انټي باډیزونو او انټيجنونو پیژندلو څخه د څو زره پروټینونو ځایی کولو ټاکلو پورې. په خپلو لیکچرونو کې، پاول د پروټومکس د دې او نورو غوښتنلیکونو په اړه خبرې وکړې، د دې اوسني پرمختګ او د معلوماتو تحلیل کې نیمګړتیاوې.
یولس*. د مالیکولر سمولیشن اساسی اصول | Pavel Yakovlev، BIOCAD
|
د مالیکولر متحرکاتو په اړه تعارفي تیوریکي لیکچر: ولې ورته اړتیا ده، دا څه کوي او دا څنګه د مخدره توکو د پراختیا په اړه کارول کیږي. پاول د مالیکولر متحرکاتو میتودونو ته پاملرنه وکړه ، د مالیکولر ځواکونو توضیحات ، د ارتباط توضیحات ، د "قوت ساحې" او "انجمن" مفکورې ، په ماډلینګ کې محدودیتونه او نور ډیر څه.
12* مالیکولر بیولوژي او جینیات | یوري باربیتوف، د بایو انفارماتیک انسټیټیوټ
, , |
د انجینرۍ زده کونکو او فارغینو لپاره د مالیکولر بیولوژي او جینیکیک درې برخې پیژندنه. لومړی لیکچر د عصري بیولوژي مفکورې، د جینوم جوړښت مسلې او د تغیراتو پیښو په اړه بحث کوي. دوهم د جین د فعالیت مسلې په تفصیل سره پوښي، د لیږد او ژباړې پروسې، دریم د جین بیان تنظیم او د بنسټیز مالیکول بیولوژیکي میتودونو پوښښ کوي.
13* د NGS د معلوماتو تحلیل اصول | یوري باربیتوف، د بایو انفارماتیک انسټیټیوټ
|
لیکچر د دویم نسل ترتیب کولو (NGS) میتودونه، د هغوی ډولونه او ځانګړتیاوې بیانوي. استاد په تفصیل سره تشریح کوي چې څنګه د ترتیب کونکي څخه ډاټا "آؤټ پوټ" جوړښت لري، دا څنګه د تحلیل لپاره بدلیږي، او د هغې سره د کار کولو لارې کومې دي.
۱۴* د کمانډ لاین په کارولو سره تمرین وکړئ | ګینادي زاخروف، EPAM
د ګټور لینکس کمانډ لاین کمانډونو ، اختیارونو او د دوی کارولو اساساتو عملي کتنه. مثالونه د ترتیب شوي DNA ترتیبونو تحلیل باندې تمرکز کوي. د معیاري لینکس عملیاتو سربیره (د مثال په توګه ، بلی ، ګریپ ، سیډ ، اوک) ، د ترتیبونو سره کار کولو لپاره اسانتیاوې (سمټولز ، بستر اوزار) په پام کې نیول شوي.
۱۵* د کوچنيانو لپاره د معلوماتو لید | نیکیتا الیکسیف، د ITMO پوهنتون
|
هرڅوک د خپلو ساینسي پروژو د پایلو د روښانه کولو یا د نورو خلکو د ډیاګرامونو، ګرافونو او انځورونو د پوهیدو تجربه لري. نیکیتا وویل چې څنګه د ګرافونو او ډیاګرامونو په سمه توګه تشریح کول، د دوی اصلي شی روښانه کول؛ څنګه روښانه انځورونه رسم کړئ. لیکونکي همدارنګه ټینګار وکړ چې د مقالې لوستلو یا سوداګریز لیدو پرمهال څه باید په پام کې ونیول شي.
۱۶* په بایو انفارماتیک کې دندې | ویکتوریا کورزوا، د میکس پلانک د بایو کیمیا انسټیټیوټ
ویډیو: , |
ویکتوریا په بهر کې د اکاډمیک ساینس جوړښت په اړه خبرې وکړې او هغه څه چې تاسو ورته اړتیا لرئ په ساینس یا صنعت کې د یو لیسانس ، فارغ یا فارغ شوي زده کونکي په توګه د مسلک رامینځته کولو لپاره پاملرنه وکړئ.
17* د ساینس پوه لپاره د CV لیکلو څرنګوالی | ویکتوریا کورزوا، د میکس پلانک د بایو کیمیا انسټیټیوټ
په CV کې څه پریږدئ او څه لرې کړئ؟ کوم حقایق به د احتمالي لابراتوار مدیر لپاره د علاقې وړ وي ، او کوم غوره دي چې یادونه یې ونشي؟ تاسو باید څنګه معلومات تنظیم کړئ ترڅو خپل ریزیوم غوره کړئ؟ لیکچر به دې او نورو پوښتنو ته ځوابونه ورکړي.
۱۸* د بایو انفارماتیک بازار څنګه کار کوي | اندری افاناسیف، yRisk
|
بازار څنګه کار کوي او د بایو انفارمیشن پوه چیرته کار کولی شي؟ د دې پوښتنې ځواب په تفصیل سره د مثالونو او مشورې سره د اندری په لیکچر کې وړاندې شوی.
پای
لکه څنګه چې تاسو شاید یادونه کړې وي، په ښوونځي کې لیکچرونه په موضوعاتو کې خورا پراخه دي - د مالیکولر ماډلینګ او د جینوم اسمبلۍ لپاره د ګرافونو کارولو څخه ، د واحد حجرو تحلیل او د ساینسي مسلک رامینځته کولو پورې. موږ د بایو انفارماتیک انسټیټیوټ کې هڅه کوو چې د ښوونځي په برنامه کې مختلف موضوعات شامل کړو ترڅو د امکان تر حده د بایو انفارماتیک ډیسپلینونه پوښ کړو، او هر ګډون کوونکی یو څه نوي او ګټور زده کړي.
د بایو انفارمیټکس راتلونکی ښوونځی به مسکو ته نږدې د جولای له 29 څخه تر اګست 3 پورې ترسره شي. . د سږ کال موضوع به په پرمختیایي بیولوژي او د عمر د څیړنې په برخه کې بایو انفارماتیک وي.
د هغو کسانو لپاره چې غواړي بایو انفارمیټکس په ژوره توګه مطالعه کړي، موږ لاهم زموږ لپاره غوښتنلیکونه منو په سینټ پیټرزبورګ کې. یا په دې مني کې په مسکو کې د پروګرام د پرانستلو په اړه زموږ خبرونه تعقیب کړئ.
د هغو کسانو لپاره چې په سینټ پیټرزبورګ یا مسکو کې نه دي ، مګر واقعیا غواړي بایو انفارماتیک پوه شي ، موږ چمتو کړی دی په الګوریتم، پروګرامینګ، جینیات او بیولوژي کې.
موږ هم لسګونه لرو ، کوم چې تاسو کولی شئ همدا اوس تیریدل پیل کړئ.
په 2018 کې، د بایو انفارمیټکس کې د دوبي ښوونځي زموږ د منظم شریکانو په ملاتړ ترسره شو - شرکتونه JetBrains، BIOCAD او EPAM، د کوم لپاره چې موږ د دوی ډیره مننه کوو.
بایو انفارماتیک هرڅوک!
PS که تاسو فکر نه کاوه چې دا کافي و، и .
سرچینه: www.habr.com